초록 ▼

분자상호작용에 대한 실험방법이 소개되면서 이 분야의 자료가 빠르게 증가되고 있으며, 이와 관련된 데이터베이스는 급격히 증가하고 있다. 하지만 이와 같은 정보를 기반으로 질병의 이해와 같은 분자수준의 반응 기작 연구의 활용에는 어려움이 있었다. 본 연구 우리는 다양한 형태의 분자상호작용 정보를 불러들이고 이를 가시화 할 수 있는 브라우저를 개발하였다. 이 프로그램은 복잡한 구조의 상호작용을 좀 더 쉽게 이해시킬 수 있도록 3차원 형태의 네비게이션 기능을 제공하며, 이를 통해 연구자가 자신의 원하는 상호작용 모델을 생성할 수 있도록 해

분자상호작용에 대한 실험방법이 소개되면서 이 분야의 자료가 빠르게 증가되고 있으며, 이와 관련된 데이터베이스는 급격히 증가하고 있다. 하지만 이와 같은 정보를 기반으로 질병의 이해와 같은 분자수준의 반응 기작 연구의 활용에는 어려움이 있었다. 본 연구 우리는 다양한 형태의 분자상호작용 정보를 불러들이고 이를 가시화 할 수 있는 브라우저를 개발하였다. 이 프로그램은 복잡한 구조의 상호작용을 좀 더 쉽게 이해시킬 수 있도록 3차원 형태의 네비게이션 기능을 제공하며, 이를 통해 연구자가 자신의 원하는 상호작용 모델을 생성할 수 있도록 해준다. 또한 얻어진 모델을 이용하여 손쉽게 분자 시뮬레이션을 수행할 수 있도록 시뮬레이션 기능을 제공한다. 대장균의 주화성에 대한 신호전달기작을 대상으로 시뮬레이션 분석과정을 테스트해 보았다.

Abstract ▼

Contents and scope of the study we developed in this research project are as follows.
- The understanding of the current research situation for signal transduction
- The development of signal transduction network browser
- The construction of the environment for computer simulation experime

Contents and scope of the study we developed in this research project are as follows.
- The understanding of the current research situation for signal transduction
- The development of signal transduction network browser
- The construction of the environment for computer simulation experiments using signal transduction network browser

목차 Contents

• Ⅰ. 서 론 ... 17
• 1. 연구사업의 필요성 및 목적 ... 17
• 2. 연구사업의 목표 및 내용 ... 18
• 3. 연구방법 및 추진체계 ... 19
• Ⅱ. 신호전달 분야 국제적 연구 현황 ... 20
• 1. 개요 ... 20
• 2. 신호전달 과정의 이해 ... 21
• 가. 신호전달 과정의 기본체계 ... 22
• 나. 신호전달 과정의 예 ... 23
• 3. 단백질 상호작용에 대한 정보표준 ... 24
• 가. 단백질 상호작용에 대한 실험 ... 25
• 나. 단백질 상호작용에 대한 데이터 ... 30
• 4. 단백질 상호작용 데이터베이스 현황 및 분석 ... 37
• 가. 개요 ... 37
• 나. 데이터베이스 조사 ... 40
• Ⅲ. 신호전달 네트워크 브라우저 개발 ... 51
• 1. 개요 ... 51
• 2. 수행방법 ... 52
• 가. 단백질 상호작용 ... 52
• 나. 상호작용 데이터 모델 ... 52
• 다. 시스템 구현 ... 53
• 3. 결과 및 토론 ... 53
• 가. 단백질 상호작용 데이터와의 인터페이스 ... 53
• 나. 신호전달 네비게이션용 프로그램 개발 ... 54
• 다. 3차원 가시화 ... 55
• Ⅳ. 신호전달 네트워크에 대한 세포 모사 환경 구축 ... 57
• 1. 개요 ... 57
• 2. 분석모델 ... 58
• 가. 동적모델 ... 58
• 나. 정적모델 ... 59
• 다. 동적/정적 혼합모델 ... 60
• 3. 세포모사 환경 구축 ... 61
• 가. 전사모사 서비스 개발 ... 61
• 나. 신호전달 브라우저와 인터페이스 ... 61
• 4. 박테이라의 주화성(Chemotaxis) 시뮬레이션 ... 62
• 가. 주화성기작 ... 62
• 나. 주화성 과정의 시뮬레이션 ... 63
• Ⅴ. 결론 및 향후 연구 방향 ... 66
• 1. 연구개발 목표의 달성도 ... 66
• 2. 결과의 활용가능성 및 기대되는 파급효과 ... 67
• 가. 활용방안 ... 67
• 나. 기대성과 및 예상파급효과 ... 67
• 감사의 글 ... 67
• 참고문헌 ... 68