초록 ▼

post-genomics 시대에 대응하기 위한 차세대 초고속 단백질 NMR 구조결정기술을 개발함.
이를 위해
1. 시료의 중수소표지기법, 선택적 메틸화 기법등 특별한 동위원소 표지기법을 도입
2. 거대 단백질을 위한 TROSY 기법도입 및 적용
3. 자동화된 NMR 데이터분석 기법 확립
4. NOESY 해석 및 구조계산 자동화 기법 확립
5. residual diploar coupling 측정 기법 확립
하였다. 상기의 기법을 활용하여 통상적 NMR기법의 한계인20KDa을 넘어서는 50KDa의

post-genomics 시대에 대응하기 위한 차세대 초고속 단백질 NMR 구조결정기술을 개발함.
이를 위해
1. 시료의 중수소표지기법, 선택적 메틸화 기법등 특별한 동위원소 표지기법을 도입
2. 거대 단백질을 위한 TROSY 기법도입 및 적용
3. 자동화된 NMR 데이터분석 기법 확립
4. NOESY 해석 및 구조계산 자동화 기법 확립
5. residual diploar coupling 측정 기법 확립
하였다. 상기의 기법을 활용하여 통상적 NMR기법의 한계인20KDa을 넘어서는 50KDa의 크기를 가지는 HP1043과 25KDa 크기를 가지는 Prxvi 단백질에 대한 NMR 연구를 수행하였으며 RDC 방법을 이용하여 HP1043과 같은 multidomain protein의 domain간 구조 정보를 얻고 이를 구조에 적용하였다. 또한 78개의 아미노산 잔기를 가지는 HP0371단백질과 10KDa 크기의 TA0956단백질에 대해 완전자동화한 Sequential assignment 와 NOESY assignment 방법을 적용시켜 단백질에 대한 구조정보를 얻었으며 기타 실험을 통한 구조정보를 얻어 Linux cluster에 적용시킨 자동화 구조계산 프로그램을 통해 NMR 구조를 결정하였다.

Abstract ▼

Developments of HTSD-NMR methods and related techniques
- Establishment of TROSY experiment and structure determination of macromolecular protein($\textgreater$25KDa)
- Setup of efficient uniform deuterium labeling method and application
- Establishment and application of residua

Developments of HTSD-NMR methods and related techniques
- Establishment of TROSY experiment and structure determination of macromolecular protein($\textgreater$25KDa)
- Setup of efficient uniform deuterium labeling method and application
- Establishment and application of residual dipolar coupling method for large size of proteins($\textgreater$25KDa)
- Development of automatic resonance assignment platform

목차 Contents

• 제1장 연구개발과제의 개요...12
• 1절 개발개요...12
• 2절 연구개발 목표...13
• 3절 개발 효과...13
• 4절 연구개발의 필요성...14
• 1. 기술적 측면...14
• 가. 기술의 기반성...14
• 나. 기술의 핵심성...14
• 2. 경제$\cdot$산업적 측면...15
• 3. 사회$\cdot$문화적 측면...16
• 제2장 국내외 기술개발 현황...17
• 1절 국내개발 실적...17
• 2절 국외개발 실적...17
• 1. 단백질 NMR연구 분야의 노벨상 수상...18
• 2. HTSD-NMR 기술의 중요성 대두...18
• 3. Residual Dipolar Coupling 연구의 중요성 증가...19
• 4. 신뢰성 있는 Automation 방법 개발의 중요성...19
• 5. 초거대분자대응 NMR기법 개발/발표...19
• 6. GFT-NMR 및 Spafrse NMR methods...20
• 제3장 연구개발수행 내용 및 결과...21
• 1절 Sample preparation...21
• 1. Deutration...21
• 2. Selective methylation...21
• 2절 New NMR technique-TROSY...21
• 3절 New NMR technique-RDC...21
• 4절 Automatic Aassignment...22
• 5절 Automatic calculation...22
• 6절 구체적 적용 예시...22
• 1. 거대 단백질에 대한 NMR 연구- HP1043, Prx에 대한 NMR연구...22
• 2. 소형단백질($\sim$12KDa)에 대한 자동화된 NMR 분석...24
• 3. 약물 작용점 후보에 단백질에 대한 NMR의한 단백질 특성 분석 및 기질과의 상호작용 특성 연구...25
• 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도...26
• 1절 계획대비 달성도...26
• 2절 대표적 성공사례...27
• 제5장 연구개발결과의 활용계획...28
• 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보...29
• 제7장 참고문헌...30