초록 ▼

post-genomics 시대의 효과적인 응용을 위한 차세대 초고속 단백질 NMR 구조결정기술을 개발하고 개발된 기술을 신약후보 단백질에 적용함. 기술개발과정에서 도출된 결과물로서 논문3 8편(SCI 3 5편), 특허및 프로그램 등록 5건, 특허 출원 2건의 업적을 도출하였음
1. 단백질 시료의 중수소표지기법, 선택적 메틸화 기법등 특별한 동위원소 표지기법
NMR 실험기법 확립
2. 거대 단백질 구조 규명을 위한 TROSY 기법도입 및 적용 기술 확립
3. 자동화된 NMR 데이터분석 기법 확립
4. NO

post-genomics 시대의 효과적인 응용을 위한 차세대 초고속 단백질 NMR 구조결정기술을 개발하고 개발된 기술을 신약후보 단백질에 적용함. 기술개발과정에서 도출된 결과물로서 논문3 8편(SCI 3 5편), 특허및 프로그램 등록 5건, 특허 출원 2건의 업적을 도출하였음
1. 단백질 시료의 중수소표지기법, 선택적 메틸화 기법등 특별한 동위원소 표지기법
NMR 실험기법 확립
2. 거대 단백질 구조 규명을 위한 TROSY 기법도입 및 적용 기술 확립
3. 자동화된 NMR 데이터분석 기법 확립
4. NOESY 해석 및 구조계산 자동화 기법 확립
5. Residual diploar coupling 측정 기법 확립 및 거대단백질/multi-domain 단백질에 적용
6. NMR data 기반 구조 예측 알고리듬 개발 및 구조 계산에의 적용 상기 개발된 기술을 기반으로 여러 종류의
①통상적 NMR기법의 한계인 20KDa이상의 단백질인 50KDa의 크기를 가지는 HP1043과 25KDa 크기를 가지는 Prxvi 단백질에 대해 TROSY/RDC 기법을 적용하여 단백질의 삼차원 구조를 규명하였음.
② Automated data 분석 및 구조 계산 자동화 기법을 개발하여 Structural Proteomics 표적 단백질 5종에 대해 구조를 규명하였고, 관련기술을 국내 대학 및 연구 기관에 이전하였음.
③ NMR data 기반 단백질 2차 구조 및 삼차원 구조 예측 프로그램을 개발하였으며, 프로그램등록완료 후 이를 기반으로 homepgae에서 관련 연구자들을 대상으로 data base를 구축 하여 서비스 중임.
④ 신약 표적 단백질인 Syntenin 단백질(21kD), HIP2/UBB+1 단백질 복합체(35kD)의 구조와 기능 연구를 HTSD-NMR 기법을 적용하여 수행하였음.

Abstract ▼

- Establishment of TROSY experiments and application to large protein which size is more over 25kDa
- Setting up of Uniform Deuterium labelling Technique and application to TROSY experiments and structure determination
- Coupling(RDC) Experiment and its application
- Development of automat

- Establishment of TROSY experiments and application to large protein which size is more over 25kDa
- Setting up of Uniform Deuterium labelling Technique and application to TROSY experiments and structure determination
- Coupling(RDC) Experiment and its application
- Development of automatic resonaceassignment and structure calculation method and program
- Development and application of novel TROSY experiment
- Establishment and application of selective methyl protonation labelling technique
- Structure determination of multi-domain protein using RDC technique
- Application of HTSD-NMR techniques to to structureal proteomics and target proteins for novel drugs
- Development of prediction algorithm of secondary and tertiary structure of protein based on NMR data

목차 Contents

• 제 1 장 연구개발과제의 개요...18
• 1절 기술의 개요...18
• 2절 기존기술의 문제점 및 해결방안...19
• 3절 연구개발 목표 및 개발효과...20
• 4절 연구개발의 필요성 ...21
• 가. 기술적 측면...22
• 나. 경제산업적 측면...24
• 다. 사회문화적 측면...25
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...26
• 1절 본 과제 개발 착수 시점에서의 연구개발 현황 및 실적...26
• 가. 국내 개발현황 및 실적...26
• 나 국외 개발현황 및 실적...26
• 2절 본 과제 수행중 국외기술 현황...27
• 가. 단백질 NMR 연구분야의 노벨상 수상...27
• 나. HTSD-NMR 기술을 이용한 구조 유전체학 및 단백 유전체학 연구의 중요성 대두...27
• 다. Residual Dipolar Couplig 기법의 중요성 증가 및 실험 기법 개발...28
• 라. 신뢰성 있는 automation방법의 중요성...29
• 마. 초거대분자대응 NMR 기법 개발/발표...29
• 바. NMR 실험시간을 단축하기 위한 새로운 실험기법...29
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과...31
• 1절 1단계 연구개발 수행내용 및 결과...31
• 가. 연구개발의 이론적,실험적 접근방법...31
• 나. 연구 및 수행 결과...33
• 제2절 2단계 연구개발 수행내용 및 결과...38
• 가. 연구개발 이론적,실험적 접근방법...38
• 나. 연구내용 및 수행결과...44
• 제3절 위탁과제 연구내용 및 수행결과...67
• 가. 연구 개발 목표, 내용 및 결과...67
• 나. 수행성과 및 활용방안...72
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도...73
• 1절 계획대비 달성도...73
• 2절 대표적 성공사례...75
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...77
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보...78
• 제 7 장 참고문헌...80
• 첨부 연구 성과 현황...88