초록 ▼

● 본 연구는 위암을 비롯한 소화기계 암의 공동 병인이 되는 점액 과분비 기전을 이해하기 위하여, 분비성 점액 유전자들(MUC2, MUC5AC, MUC5B, MUC6) 내에 존재하는 minisatellites polymorphism을 분석함.
● 분비성 점액 유전자(MUC2, MUC5AC, MUC5B, MUC6), 막 결합 점액 유전자(MUC4), 분비성 및 막 결합 점액유전자(MUC8), 전사인자인 점액 유전자 (MUC1)을 비롯해 다양한 암 발생에 관여된 것으로 보고된 TERT 유전자와 수송에 관련된 SLC6A18과 SLC

● 본 연구는 위암을 비롯한 소화기계 암의 공동 병인이 되는 점액 과분비 기전을 이해하기 위하여, 분비성 점액 유전자들(MUC2, MUC5AC, MUC5B, MUC6) 내에 존재하는 minisatellites polymorphism을 분석함.
● 분비성 점액 유전자(MUC2, MUC5AC, MUC5B, MUC6), 막 결합 점액 유전자(MUC4), 분비성 및 막 결합 점액유전자(MUC8), 전사인자인 점액 유전자 (MUC1)을 비롯해 다양한 암 발생에 관여된 것으로 보고된 TERT 유전자와 수송에 관련된 SLC6A18과 SLC6A19 유전자에 대한 연구 진행함.
● 국내에서는 본 실험실이 유일하며, 세계적으로도 약 5군데 미만의 실험실에서 행해지고 있는 TAR cloning 방법의 상용화를 위한 유전체 기술의 개발.
● 부가적으로 본 연구실에서 확보된 Illumina BeadArray gene expression platform을 이용하여 공동연구로 확보된 RNA sample을 이용하여 신약개발과 예측진단이 가능한 microarray 실험을 간암과 방광암 샘플을 중심으로 연구함.

Abstract ▼

Mucins are the major components of mucus and their genes share a common, centrally-located region of sequence that encodes tandem repeats. Mucins are well known genes with respect to their specific expression levels; however, their genomic levels are unclear because of their complex genomic properti

Mucins are the major components of mucus and their genes share a common, centrally-located region of sequence that encodes tandem repeats. Mucins are well known genes with respect to their specific expression levels; however, their genomic levels are unclear because of their complex genomic properties. In this study, we identified novel minisatellites from the MUCIN genes (MUC2, MUC5AC, MUC5B, MUC6, MUC8) regions, the orphan group of the SLC6 family includes SLC6A18 and SLC6A19, and TERT(human telomerase reverse transcriptase) genes. To investigate the allelic variation in these minisatellites may affect to susceptibility for various cancers including gastrointestinal cancer and liver cancer, we analyzed genomic DNA from the blood of normal healthy individuals and multi-generational family groups. Several minisatellites exhibited polymorphism and were transmitted meiotically in seven families, following Mendelian inheritance. These minisatellite polymorphisms may be useful markers for paternity mapping and DNA fingerprinting. We evaluated allelic variation in these minisatellites to determine if such variation affected the susceptibility to gastric cancer. Several associated minisatellites loci were identified: A statistically significant association was identified between rare exonic MUC2-MS6 alleles and the odds of gastric cancer: odds ratio (OR), 2.56; 95% confidence interval (CI), 1.31-5.04; and p = 0.0047. Additionally, a significant association (OR=7.08) between short rare MUC6 - MS5 alleles and relative risks were observed for gastric cancer [95% CI, 1.43-35.19; p=0.005]. Moreover, hypervariable MUC2 minisatellites were analyzed in matched blood and cancer tissue from 28 patients with gastric cancer and in 4 cases of MS2, minisatellites were found to have undergone rearrangement. These observations suggest that the minisatellites variants could function as identifiers for risk of gastric cancer. Additionally, we suggest that minisatellite instability might be associated with gene function in cancer cells. We also developed the method for purification of the amount of a circular YAC DNA of a 120-150 kb in size sufficient for restriction analysis and DNA sequencing. This new method is simple and reproducible, preferentially enriches for circular DNA and avoids a time-consuming step of centrifugation in CsCl-EtBr gradients. The method has been applied for purification of several circular YACs carrying DNA segments that are extremely unstable in E.coli cells.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 3
• 보고서 초록 ... 4
• 요약문 ... 5
• SUMMARY ... 8
• 목차 ... 10
• 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 11
• 1. 유전체 다형성 확인 및 질병과의 관련성 규명 ... 11
• 2. 유전체 사업의 신기술 TAR cloning technology의 확립과 상용화 ... 11
• 3. 유전자 발현에 대한 유전체 수준에서의 조절의 이해 ... 11
• 4. 예방의학적 기여와 경제ㆍ산업적 효과 ... 11
• 5. 법의학, 친자확인, 예방의학 서비스 제공과 교육적인 서비스 제공 ... 12
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 13
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 14
• 제 1 절 분비성 점액 유전자 (MUC2, MUC5AC, MUC5B, MUC6) ... 15
• 1. MUC2 gene ... 15
• 2. MUC5AC gene ... 19
• 3. MUC5B gene : MUC5AC 유전자의 유전체 구조 분석 및 다형성 확인 ... 19
• 4. MUC6 gene ... 20
• 제 2 절 결합성 점액 유전자(MUC1, MUC4) ... 22
• 1. MUC1 gene ... 22
• 2. MUC4 gene ... 22
• 제 3 절 분비성, 막 결합성 점액 유전자(MUC8) ... 26
• 1. MUC8 gene ... 26
• 제 4 절 암 발생에 관여 된 것으로 보고된 TERT 유전자 ... 28
• 제 5절 수송 단백질 SLC6A18과 SLC6A19 유전자 ... 30
• 1. SLC6A18 ... 30
• 2. SLC6A19 ... 30
• 제 6절 유전체 사업의 신기술 TAR cloning technology의 확립과 상용화 ... 32
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 34
• 제 1 절 연구개발의 최종목표 ... 34
• 제 2 절 연차별 연구개발 목표 및 내용 ... 35
• 제 3 절 계획대비 달성도 (과제선정시 제시된 연구목표) ... 36
• 제 4 절 제시된 연구목표 중 중요도 순으로 목표(4-5개 정도)를 추출하고 가중치 부여 ... 42
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ... 43
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 45
• 제 7 장 참고문헌 ... 46
• 끝페이지 ... 50