초록 ▼

본 연구과제는 유전자 정보에 의한 넙치 우량친어를 선별할 수 있는 분자육종기술 확립을 위하여 넙치 육종을 위한 기초집단을 조성하고 유전적 다형성을 분석하였고, 유전자 마커를 대량으로 발굴하고 탐색하였다. 우량형질 유전자 혹은 유전자 마커에 의한 선발 (MAS)을 위한 기초 기반이 되는 유전자 지도 초안이 2006년도에 작성되고 이를 기반으로 본격적인 QTL-mapping 분석이 2008년부터 시도하였고, 2009년에는 형질관련 유전자 마커를 대량 분리하여 질병내성형질과의 연관성을 조사하였다. 넙치 유전자 지도는 MS 마커 177개,

본 연구과제는 유전자 정보에 의한 넙치 우량친어를 선별할 수 있는 분자육종기술 확립을 위하여 넙치 육종을 위한 기초집단을 조성하고 유전적 다형성을 분석하였고, 유전자 마커를 대량으로 발굴하고 탐색하였다. 우량형질 유전자 혹은 유전자 마커에 의한 선발 (MAS)을 위한 기초 기반이 되는 유전자 지도 초안이 2006년도에 작성되고 이를 기반으로 본격적인 QTL-mapping 분석이 2008년부터 시도하였고, 2009년에는 형질관련 유전자 마커를 대량 분리하여 질병내성형질과의 연관성을 조사하였다. 넙치 유전자 지도는 MS 마커 177개, EST 유래 MS 마커가 50개, 특정유전자 3개 (HSP 10, cathepsin-F, growth hormone gene)를 사용하여 genome size 1022.5cM으로 총 24개의 linkage group과 marker density 4.4 cM로 제작되었다. 넙치 성장관련 QTL은 PVE(%) 추정에 의해 체중 및 전장에 대한 표현형 변이의 1.9～9.5%의 효과를 추정하였고, 염색체위 12곳에서 확인되었다. 이는 성장에 관여하는 유전자에 의해 PVE(%) 추정치만큼 개량효과를 기대할 수 있다. 넙치 백화형질 QTL은 성장보다 더 큰 유전요인에 의해 영향을 받고 있었으며 PVE(%) 추정치는 5.3～17.01%으로 유전자 마커에 의한 유전적 개량이 클 것으로 기대된다. 넙치의 림포시스티스 병과 E. tarda 병 저항성과 연관된 마커 개발하기 위하여 microsatellite 마커와 연관 분석 결과, 43개 마커가 림포시스티스 병 저항성에, 16개 마커가 E. tarda 병 저항성에 연관되어 있었으며, 면역관련 유전자인 lipopolysaccharide binding/bactericidal permeability increasing protein (LPB/BPI) 유전자의 SNP 다형 (+816 G>A)이 넙치 E. tarda 병 저항성과 연관되었다. 이상의 결과를 종합하여 보면 이는 향후 유전자 표지를 선발의 지표로서 품종개량에 직접적으로 활용하여 선발의 정확도를 향상시킬 수 있어 효율적인 품종개량방법을 제시할 수 있다.

Abstract ▼

○ Development of molecular markers for aquacultural breeding
- species : olive flounder (Paralichthys olivaceus), abalone (Haliotis discus hannai)
- Molecular marker : microsatellite (MS)
○ A high-density genetic linkage map of the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus
○ Search of ge

○ Development of molecular markers for aquacultural breeding
- species : olive flounder (Paralichthys olivaceus), abalone (Haliotis discus hannai)
- Molecular marker : microsatellite (MS)
○ A high-density genetic linkage map of the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus
○ Search of genetic marker for conomically important traits
- Analysis of linkage disequilibrium (LD) between molecular marker and economic trait
- QTL mapping to search for growth and pseudoalbinism-related loci
○ Production and management of reference family
○ Search for lymphocystis disease (LD)-resistant candidate microsatellite loci on linkage map
- Association study of microsatellite markers with resistance to LD
- Detection of (LD)-resistant candidate microsatellite loci on the linkage map
○ Search for E. tarda disease-resistant candidate microsatellite loci
- Association study of microsatellite markers with resistance to E. tarda disease
- Development of single nucleotide polymorphism (SNP) in immune-related gene
- Association study of single nucleotide polymorphism (SNP) in immune-related gene with resistance to E. tarda disease

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 보고서 요약 ... 3
• 요약문 ... 5
• SUMMARY ... 9
• 목차 ... 15
• 그림 목차 ... 16
• 표 목차 ... 17
• 제1장 연구개발과제의 개요 ... 19
• 제2장 국내.외 기술 개발 현황 ... 20
• 제3장 연구 개발 수행 내용 및 결과 ... 21
• 제1절 연구개발 수행 내용 ... 21
• 1. 넙치 고밀도 유전자 지도 작성 ... 21
• 2. 넙치 우량형질 연관 유전자 마커 탐색 (QTL 분석) ... 22
• 3. 넙치 microsatellite 마커 분리 ... 24
• 4. 넙치 LD 및 E. tarda 병에 대한 가계생산 ... 24
• 5. 넙치 병저항성과 마커와의 연관분석을 위한 통계분석 ... 25
• 제2절 연구개발 수행 결과 ... 26
• 1. 넙치 고밀도유전자 지도 작성 ... 26
• 2. 넙치 성장형질 유전자 마커 탐색 (QTL 분석) ... 28
• 3. 넙치 백화형질 유전자 마커 탐색 (QTL 분석) ... 30
• 4. 넙치 림포시스티스 병 저항성과 microsatellite 마커와의 연관분석 ... 31
• 5. 넙치 E. tarda 병 저항성과 microsatellite 마커와의 연관분석 ... 32
• 6. 넙치 면역관련 유전자의 SNP 동정 ... 33
• 7. LBP/BPI 유전자의 SNP와 넙치 E. tarda 병 저항성간의 연관분석 ... 36
• 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 37
• 제5장 연구개발 결과의 활용 계획 ... 38
• 제6장 참고문헌 ... 39