초록 ▼

3. 과업의 범위
○ 차세대유전체분석기술을 이용하여 대표적 자원식물의 재배종 및 야생 근연종의(8종) 전체 유전체 정보 생산 (유전체 크기의 0.5X ~1X 정도)
○ 유전체정보의 생물정보 분석을 통한 엽록체 유전체 완전서열 확보, 유전자 부위 결정 및 다양성 분석
○ 소기관 비교유전체 연구 파이프라인 구축방안 및 WIGIS내 엽록체 유전체 DB 구축을 위한 contents 제시
○ 국내 자생 산국 생물자원의 수집 및 수집 자원에 대한 유전적 다양성 평가
○ 국화과 근연 야생종(산국, 감국, 구절초, 제충

3. 과업의 범위
○ 차세대유전체분석기술을 이용하여 대표적 자원식물의 재배종 및 야생 근연종의(8종) 전체 유전체 정보 생산 (유전체 크기의 0.5X ~1X 정도)
○ 유전체정보의 생물정보 분석을 통한 엽록체 유전체 완전서열 확보, 유전자 부위 결정 및 다양성 분석
○ 소기관 비교유전체 연구 파이프라인 구축방안 및 WIGIS내 엽록체 유전체 DB 구축을 위한 contents 제시
○ 국내 자생 산국 생물자원의 수집 및 수집 자원에 대한 유전적 다양성 평가
○ 국화과 근연 야생종(산국, 감국, 구절초, 제충국, 아스타 등)에 대한 계통관계 규명 및 종 구분 마커 개발

Abstract ▼

Complete chloroplast(CP) genome sequencing of korean indigeous 8 species have complished using Next generation sequencing strategy and approved bioinformatics tool. We did complete 8 CP genomes by low genome coverage sequencing and de novo assembly strategy. and did assembled contigs mapping to the

Complete chloroplast(CP) genome sequencing of korean indigeous 8 species have complished using Next generation sequencing strategy and approved bioinformatics tool. We did complete 8 CP genomes by low genome coverage sequencing and de novo assembly strategy. and did assembled contigs mapping to the reference CP genomes for sequence validation, Finally we have confirmed 8 CP genome sequences Glehnia littoralis F. schmidt 154,130bp to Acanthopanax koreanum 157,160bp through sequence validation, Panax ginseng Jakyung was assembled only 2 contigs and most of species were assembled 3~7 contigs, We did comparative analysis of 8 species CP genomes, Most of genes are conserved in 8 species, but ycf2 gene that is known about unknown function gene has been expanded approximately 800bp in Ledebouriela seseloides H. Wolff and Peucedanum japonicum Thunb, and 528bp Indel sequence variation was revealed in tRNA-Glu~tRNA-Thr intergenic region of Peucedanum japonicum. Acanthopanax sessiliflorus and Acanthopanax divaricatus are more closely related than Acanthopanax koreanum, and Ledebouriella seseloides and Peucedanum japonicum and Glehnia littoralis F. schmidt were revealed close relationship than other species. We have accomplished phylogenetic relationships and molecular marker development for taxon identification among 8 species.
in this study, we have also investigated ribosomal DNA(rDNA) sequence, rDNA is distributed by tandem repeat in nuclear genome, and rDNA repeat unit length is known about 5,4~12kb, we have completely acomplished and analysed rDNA full length sequence by 1 contig in 8 species, we have did comparative analysis of rDNA full length among 8 species, there are so diversed among species, ITS1 and ITS2 are hotspot region as plant diversity, 18s and 26s rDNA are revealed also polymorphic sites among species.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 3
• 요 약 문 ... 4
• Abstract ... 8
• 차 례 ... 9
• 목 차 ... 10
• 표 목차 ... 11
• 그림 목차 ... 12
• Ⅰ. 서 론 ... 14
• 1. 연구사업의 배경 및 목적 ... 14
• Ⅱ. 연구 내용 및 방법 ... 16
• 1. 과업의 범위 ... 16
• 2. 연구추진체계 및 연구진 구성 ... 17
• 3. 조사 및 분석방법 ... 20
• Ⅲ. 결과 및 고찰 ... 24
• 1. 한반도 자원식물 근연 야생종의 유전체적 다양성 연구 ... 24
• 2. 한반도 자원식물 근연 야생종의 원산지 구분 분자마커 개발 ... 59
• Ⅳ. 결론 ... 77
• 1. 한반도 자원식물 근연 야생종의 유전체적 다양성 연구 ... 77
• 2. 한반도 자원식물 근연 야생종의 원산지 구분 분자마커 개발 ... 78
• Ⅴ. 기대성과 및 향후계획 ... 79
• Ⅵ. 참고문헌 ... 80