초록 ▼

3. 연구내용 및 방법
가. 정책적 관리대상종(멸종위기종 한반도고유종 국외반출승인대상종)의 유전체 분석·연구
1) 우리나라 멸종위기 생물종의 미토콘드리아(동물) 또는 엽록체(식물)의 유전체 염기서열을 결정
2) 유전자 배열 구조 및 특성 분석을 통해 분류군별 특성 파악
나. 멸종위기 생물종 및 유용 생물자원에 대한 유전적 다양성 분석·연구
1) micro satellite, COl, cytochrome B 등 멸종위 기 생물종의 칩 단 분석을 위한 분자 마커를 개발
2) 개체군간 및 개체

3. 연구내용 및 방법
가. 정책적 관리대상종(멸종위기종 한반도고유종 국외반출승인대상종)의 유전체 분석·연구
1) 우리나라 멸종위기 생물종의 미토콘드리아(동물) 또는 엽록체(식물)의 유전체 염기서열을 결정
2) 유전자 배열 구조 및 특성 분석을 통해 분류군별 특성 파악
나. 멸종위기 생물종 및 유용 생물자원에 대한 유전적 다양성 분석·연구
1) micro satellite, COl, cytochrome B 등 멸종위 기 생물종의 칩 단 분석을 위한 분자 마커를 개발
2) 개체군간 및 개체군내 집단 유전학적 분석 결과를 확보하여 종 보전 및 복원을 위한 정책수립 자료 제시
3) 유용 생물자원의 원산지 구별을 위한 마커 개발
다. 자생 야생생물자원으로부터 대용량 유전자 발굴·분석
1) 자생 유용 생물자원으로부터 전체 유전체 혹은 발현유전체 염기 서열을 차세대 염기서열 분석기법을 이용하여 확보
2) 생물정보학을 이용한 유전체 서열 분석 및 유용 유전자군 발굴 및 기능 분석
3) 환경, 의약, 농업 등 다양한 분야의 생물 산업에 활용 가능한 유전자 풀 제공

Abstract ▼

Genes are fundamental units to determine the characteristics and functions of an organism, thereby confer genetic diversity. As such, assessments of genetic make-ups cannot be overemphasized for scientific conservation and magnagement of endangered species as well as sustainable use of biological r

Genes are fundamental units to determine the characteristics and functions of an organism, thereby confer genetic diversity. As such, assessments of genetic make-ups cannot be overemphasized for scientific conservation and magnagement of endangered species as well as sustainable use of biological resources. In this study, we have conducted genetic analyses of important biological resources with three complementary approaches. At first, whole mitochondrial genomes of 4 vertebrate species, including 3 fish (Brachymystax lenok tsinlingensis, Rhynchocypris kumganensis, Pungtungia herzi) and one mammalian (Vulpes vulpes) species, were analyzed. Mitochondrial genomes of 4 species were similar to previously reported vertebrate mitogenomes in their structure and size. At second, species specific markers differentiating individuals or populations were developed using Next Generation Sequencing technology. Two SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markers from N ecfinetia falcata, an endangered species of Korea, distinguishing wild and cultivated individuals were developed. Microsatellite markers from Pungtungia herzi were successfully applied for its neighboring endangered species, Pseudopungtungia nigra and P. tenuicorpa. Genetic diversity of manturian traut, Bradtyrnystax lenok tsinlingensis, populations from Han and Nakdong river was evaluated using mitochondrial control region as a molecular marker to provide genetic basis for restoration of endangered species, For the last part, transcriptome of 3 wild species was analyzed to provide basis for translational approaches for their sustainable use. Transcriptome sequences of M orus alba, Codonopsis lanceolata, and Vitex rotundifolia, was obtained using lliumina's HiSeq2000 platform to result in 52,677, 52,199, and 57,842 contigs, respectively. Gene Ontology and KEGG pathway assignment were conducted after BLAST search against UniProt protein database for functional annotation of the transcripts. These data will provide valuable information for setting up strategies for management and conservation of biological resources.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 참여 연구진 ... 4
• 요약문 ... 6
• 목차 ... 10
• 표 목차 ... 11
• 그림 목차 ... 13
• Abstract ... 15
• Ⅰ. 서 언 ... 16
• Ⅱ. 정책적 관리대상종의 유전체 분석·연구 ... 26
• 가. 서론 ... 26
• 나. 재료 및 방법 ... 27
• 다. 연구결과 ... 32
• 라. 고찰 ... 60
• 마. 참고문헌 ... 64
• Ⅲ. 주요 생물자원의 집단분석용 마커개발 및 유전다양성 연구 ... 66
• 1. 차세대염기서열분석법을 이용한 주요 생물종의 집단분석용 마커개발 ... 68
• 가. 서 론 ... 68
• 나. 재 료 및 방법 ... 70
• 다. 연구결과 ... 76
• 라. 고찰 ... 88
• 마. 참고문헌 ... 90
• 2. 멸종위기 2급 열목어의 유전적 특성 해명을 위한 유전다양성 분석 ... 94
• 가. 서 론 ... 94
• 나. 재료 및 연구방법 ... 95
• 다. 연구 결과 ... 97
• 라. 고찰 ... 104
• 마. 참고문헌 ... 107
• Ⅳ. 자생 야생생물자원으로부터 대용량유전자 발굴·분석 ... 110
• 가. 서 론 ... 110
• 나. 재료 및 연구방법 ... 114
• 다. 연구결과 ... 118
• 라. 고찰 ... 136
• 마. 참고문헌 ... 137
• Ⅴ. 종합고찰 ... 142
• 끝페이지 ... 146