초록 ▼

4. 최종 연구결과 요약
- 목표(1년차)
∘ 국내분리 동물병원성바이러스들에 대한 유전체정보 조사: 구제역바이러스, 돼지열병바이러스, 조류인플루엔자바이러스, 광견병바이러스, 돼지 써코바이러스
∘ 유전체사업관련 동물 바이러스주 선발: 가축전염병예방법 및 농림수산식품부령이 정하는 제1,2,3종 가축전염병의 병원체바이러스 및 신종바이러스
∘ 국내분리 돼지뇌심근염바이러스 및 돼지파보바이러스 유전체분석
∘ 주요 유전자 크로닝 및 뱅크화
∘ 유전체에 대한 구조 및 비교 분석
- 목표(2년차)
∘ 국내

4. 최종 연구결과 요약
- 목표(1년차)
∘ 국내분리 동물병원성바이러스들에 대한 유전체정보 조사: 구제역바이러스, 돼지열병바이러스, 조류인플루엔자바이러스, 광견병바이러스, 돼지 써코바이러스
∘ 유전체사업관련 동물 바이러스주 선발: 가축전염병예방법 및 농림수산식품부령이 정하는 제1,2,3종 가축전염병의 병원체바이러스 및 신종바이러스
∘ 국내분리 돼지뇌심근염바이러스 및 돼지파보바이러스 유전체분석
∘ 주요 유전자 크로닝 및 뱅크화
∘ 유전체에 대한 구조 및 비교 분석
- 목표(2년차)
∘ 국내분리 소유행열바이러스 및 백신주 우역바이러스유전체분석
∘ 유전체에 대한 구조 및 비교 분석
∘ 분석된 유용유전자 크로닝 및 뱅크화
- 목표(3년차)
∘ 국내분리 돼지유행성설사병바이러스 및 개호흡기코로나바이러스 유전체조사
∘ 유전체에 대한 구조 및 비교 분석
∘ 분석된 유용유전자원 크로닝 및 뱅크화
∘ 주요 유전자 크로닝 및 유전자원 은행 보존
∘ 유전체에 대한 구조 및 비교 분석: Mega 4.0 software와 RDP3Beta program 이용분석
∘ 동물병원성바이러스 유전체 한국형 D/B 구축

Abstract ▼

The genomes of two porcine parvovirus strains isolated from the aborted fetuses of Korean sows were sequenced in their entirety, except for the 5'- and 3'-ends to investigate which high or moderate virulent virus. Comparison of the amino acid sequences at six positions (195, 365, 528, 533, 586, and

The genomes of two porcine parvovirus strains isolated from the aborted fetuses of Korean sows were sequenced in their entirety, except for the 5'- and 3'-ends to investigate which high or moderate virulent virus. Comparison of the amino acid sequences at six positions (195, 365, 528, 533, 586, and 715) within the VP1/VP2 protein with those of the highly pathogenic Kresse strain revealed that the Korean PVK2 strain differed at only one position (T-365-I) like Challenge strainwhile the Korean PVK1 strain differed at four position (T-365-I, G-528-D, Q-533-H, P-586-P) like POVG strain from Spain. The first EMCVs that were ever isolated were K3 and K11, which were isolated in 1993 from a mummy and a stillborn fetus suspected of having EMCV, respectively. Comparative analysis with the openreading frame (ORF) region nucleotide sequences of other EMCV strains showed that K3 shared high homology (99.5-99.7%) with K11, BEL-2887A/91, BJC3 and HB1, but had lower homology (79.7-82.2%) to EMC-B, EMC-D and Mengo virus. Phylogenetic analyses of the capsid coding region (CCR) and the VP3/VP1 genes by using the Bayesian method and the PHYLIP 3.572c program revealed the EMCV strains fell into two clusters (group 1 and 2) and two sub-clusters (group 1a and 1b).
The small open reading frames situated between the spike and envelope genes of the three Korean CRCoV isolates were found to encode three nonstructural proteins (4.9 kDa, 2.7 kDa, and 12.8 kDa in size), as were the British (CRCoV G9142) and Italian(CRCoV 240-05) strains. Comparison of the deduced amino acid sequences of the spike protein in the CRCoV and bovine coronavirus (BCoV) strains revealed twenty sequence variations. The predicted spike protein of CRCoV contained 20 or 21 N-glycosylation sites, whereas that of BCoV contained 19 sites. The LATC06 genome consists of 15882 nucleotides. Its transcriptional regulatory control sequences (TRS) at gene boundaries are identical to those of the Kabete O strain. Cleavage sites for generating F1/F2 proteins were identified in the same amino acid position (aa 108) as F proteins in LATC06, L13, RBT1, Kabete O, and RBOK strains. There are three predicted N-glycosylation sites of H proteins in LA (Japan) and LATC06 strains. The six epitopes of H protein in the LA (Japan) strain that elicit immunodominant humoral responses are also found in the LATC06 strain.

목차 Contents

• 총괄요약표 ... 1
• 연구과제 최종결과보고서 ... 2
• Ⅰ. 연구배경 및 목표 ... 2
• 1. 연구배경 ... 2
• 2. 연구최종목표 ... 3
• 3. 연차별 연구개발 목표 및 내용 ... 3
• Ⅱ. 연구방법 및 수행전략 ... 4
• 1. 재료 ... 4
• 2. 연구전략 및 방법 ... 4
• Ⅲ. 연구결과 ... 4
• 가. 1차년도 세부과제명: 국내분리 돼지뇌심근염바이러스 및 돼지파보바이러스 유전체분석 ... 4
• 나. 2차년도 세부과제명: 소유행열바이러스 및 백신주 우역바이러스유전체분석 ... 8
• 다. 3년차도 세부과제명: 국내분리 돼지유행성설사병바이러스 및 개호흡기코로나바이러스 유전체조사 ... 11
• Ⅳ. 연구결과요약 ... 14
• Ⅴ. 고찰 ... 15
• Ⅵ. 연구결과 활용실적 및 계획 ... 16
• Ⅶ. 참고문헌 ... 16
• Ⅹ. 영문초록 ... 18
• 끝페이지 ... 18