초록 ▼

프로테오믹 분석방법을 사용하여 나이관련황반변성 환자와 정상대조군에 특이적인 혈장 단백질 35개를 발굴함. 그 중 8개의 최종후보 혈장단백질(vinculin, TPI, S100A8, S100A9, TNX, ZPI, CXCL7, APOE에) 대한 추가 검증을 수행하여 Vinculin 이 황반변성의 가장 우수한 바이오마커임을 확인 (AUC=0.865-0.934). 혈장단백질 7개를 조합한 질병예측모델은 2개의 데이터셋에서 AUC 0.978 과 1.000을 보여 매우 우수한 질병진단능력을 확인하였으며, Vinculin 만을 이용한 예측모델

프로테오믹 분석방법을 사용하여 나이관련황반변성 환자와 정상대조군에 특이적인 혈장 단백질 35개를 발굴함. 그 중 8개의 최종후보 혈장단백질(vinculin, TPI, S100A8, S100A9, TNX, ZPI, CXCL7, APOE에) 대한 추가 검증을 수행하여 Vinculin 이 황반변성의 가장 우수한 바이오마커임을 확인 (AUC=0.865-0.934). 혈장단백질 7개를 조합한 질병예측모델은 2개의 데이터셋에서 AUC 0.978 과 1.000을 보여 매우 우수한 질병진단능력을 확인하였으며, Vinculin 만을 이용한 예측모델도 233명의 환자-대조군 검체에서 AUC 0.879의 높은 검증력을 보임. 유전자-혈액단백질 조합 질병예측모델을 최종적으로 구축하였으며 (vinculin과 ARMS2 유전자 변이를 조합, AUC 0.916), 또한 Vinculin의 황반변성의 병리와 관련하여 혈액내 단백질 농도 증가의 기전을 안구조직과 세포를 이용한 실험으로 입증하였다.

Abstract ▼

4. Result
A. 835 blood samples from AMD and 743 from healthy controls were obtained in the end.
B. 35 protein markers were discovered from a dataset of patients and controls using the proteomic strategy which utilized the mass spectrometry and statistical analysis.
C. Verification on the 8

4. Result
A. 835 blood samples from AMD and 743 from healthy controls were obtained in the end.
B. 35 protein markers were discovered from a dataset of patients and controls using the proteomic strategy which utilized the mass spectrometry and statistical analysis.
C. Verification on the 8 candidate protein markers were conducted using commercial ELISA kits and Western blotting. Our of 8 proteins, Vinculin showed the highest value of area under ROC (AUC) in two separate datasets, thus it was proved to be a good biomarker for AMD.
D. Through the candidate approach and GWAS, we found rs10490924 (OR=2.86, P=3.18E-21) and rs800292 (OR=1.67,P=2.41E-5) are the major risk SNP for AMD in Korean population.
E. Disease-prediction model from the combination of 7 plasma protein markers showed excellent disease discrimination power with AUC of 0.978 and 1.000. In addition, a prediction model using vinculin only also showed good discrimination power with AUC of 0.879 on 233 samples of cases and controls.
F. We proved the mechanism of elevated level of vinculin in AMD by conducting experiments on human ocular tissues and cultured retinal pigment epithelial cells.
G. Ultimately, we established a gene-protein combination prediction model. The model put with Vinculin, rs10490924(ARMS2) and rs800292(CFH) showed high AUC value of 0.916.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 요약문 ... 4
• SUMMARY ... 5
• 총괄연구개발과제의 연구성과 실적 및 향후 계획 ... 6
• 참여연구원 현황표 ... 8
• 목차 ... 9
• II. 총괄연구과제 연구결과 ... 11
• 1. 연구개발과제의 배경 및 필요성 ... 12
• 2. 국내외 기술개발 현황 ... 17
• 3. 연구개발과제의 추진체계 ... 23
• 4. 연구개발수행 내용 및 결과 ... 24
• 5. 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 54
• 6. 향후 연구성과 추진계획 ... 56
• 7. 연구개발결과의 파급효과 ... 57
• 8. 연구개발결과의 활용계획 ... 58
• 9. 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 59
• 10. 참고문헌 ... 59
• Ⅲ. 제 1 세부연구과제 연구결과 ... 60
• 1. 연구개발과제의 목표 ... 61
• 2. 연구개발과제의 추진체계 ... 65
• 3. 연구개발과제의 내용 및 결과 ... 67
• 4. 참고문헌 ... 80
• IV.제2세부과제연구결과 ... 83
• 1. 연구개발과제의 목표 ... 84
• 2. 연구개발과제의 추진체계 ... 85
• 3. 연구개발수행 내용 및 결과 ... 86
• 4. 참고문헌 ... 103
• Ⅳ. 첨부서류 ... 106
• 2. 실적 증빙자료 ... 108
• 3. 기타 첨부서류 ... 108
• 양식 1. 정량적 성과 요약서 ... 109
• 끝페이지 ... 112