보고서 정보
주관연구기관 |
한국생명공학연구원 Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
|
발행년월 | 2007-05 |
과제시작연도 |
2006 |
주관부처 |
농림부 Ministry of Agriculture and Forestry |
등록번호 |
TRKO201400022816 |
과제고유번호 |
1380000848 |
사업명 |
농림기술개발 |
DB 구축일자 |
2014-11-10
|
초록
▼
○ 연구개발 목표 및 내용
목표 : 병해충 진단용Oligo chip의 제작을 위한 기반기술의 확립
Prototype oligo chip의 제작 및 검정
30 종의 바이러스 병 진단용 oligo chip 제작
내용 : 국내에서 재배되는 작물에 발생하는 바이러스의 시료 확보
국내에서 보고된 바이러스 병의 조사
Oligonucleotide의 설계 및 제작
Pilot DNA chip 제작 및 검정
30 종의 바이러스 병 진단용 oligo chip 제작
진단용 칩 제
○ 연구개발 목표 및 내용
목표 : 병해충 진단용Oligo chip의 제작을 위한 기반기술의 확립
Prototype oligo chip의 제작 및 검정
30 종의 바이러스 병 진단용 oligo chip 제작
내용 : 국내에서 재배되는 작물에 발생하는 바이러스의 시료 확보
국내에서 보고된 바이러스 병의 조사
Oligonucleotide의 설계 및 제작
Pilot DNA chip 제작 및 검정
30 종의 바이러스 병 진단용 oligo chip 제작
진단용 칩 제작
○ 연구성과 활용실적 및 계획
논문 :
1. 이수헌, 이재봉, 김상목, 최홍수, 박진우, 이준성, 이기운, 문제선시설 및 노지재배 고추의 바이러스병 발생과 분포 (2004). 식물병연구. 10(4); 231-240
2. 명인식, 박경석, 홍성기, 박진우, 심홍식, 이영기, 이상엽, 이승돈, 이수헌, 최홍수, 최효원, 허성기, 신동범, 나동수, 예완해, 조원대. 2004년 주요 농작물 병해 발생개황 (2005). 식물병연구. 11(2); 89-92
3. 최홍수, 고숙주, 김미경, 박진우, 이수헌, 김국형, Hassan Karakacha Were, 최장경, Yoichi Takanami. Characteristics of Potato virus Y isolated from paprika in Korea. (2005). The Plant Pathology Journal. 21(4); 349-354
4. 최홍수, 김미경, 박진우, 이수헌, 김국형, 김정수, Hassan Karakacha Were, 최장경, Yoichi Takanami. First report of the Peanut stripe strain of Bean common mosaic virus(BCMV-PSt) infection Mungbean in Korea (2006). The Plant Pathology Journal. 22(1); 46-50
5. 김상목, 이재봉, 이영훈, 최세훈, 최흥수, 박진우, 이준성, 이관석, 문중경, 문제선, 이기운, 이수헌. First Report of Soybean Dwarf Virus on Soybean (Glycine max) in Korea (2006). 식물병연구. 12(3);213-220
특허출원 :
1. 고추 및 파프리카에 발생하는 고추모틀바이러스, 잠두위조바이러스2, 오이모자이크바이러스 및 고추마일드모틀바이러스 진단용 프라이머 조합. 이수헌외 3명. 출원번호; 10-2005-0038084
2. 십자화과 작물에 발생하는 순무모자이크바이러스, 립그라스모자이크바이러스 및 오이모자이크바이러스 진단용 프라이머 조합. 이수헌외 3명. 출원번호; 10-2005-0038085
3. 콩 모자이크 바이러스 진단용 특이 프라이머. 문제선외 8명. 출원번호; 10-2006-0010431
4. 담배녹반모자이크 바이러스 진단용 특이 프라이머. 문제선외 8명. 출원번호; 10-2006-0010904
Abstract
▼
Viruses have caused diseases in economically important crops and vegetables, resulting in yield loss and reducing the value of commodities. So far, viruses have been diagnosed by either ELISA or PCR. However, such diagnostic methods are limited to detect a single or a few target viruses. Furthermore
Viruses have caused diseases in economically important crops and vegetables, resulting in yield loss and reducing the value of commodities. So far, viruses have been diagnosed by either ELISA or PCR. However, such diagnostic methods are limited to detect a single or a few target viruses. Furthermore, these detection methods frequently produce false-positive or -negarive results. The development of oligonucleotide DNA chip is likely to assist efficient diagnosis of viruses.
To develop oligonucleotide DNA chip, approximately thirty different virus species are selected by the importance of host crops and the occurrence for last several years nationwide. Virus samples are obtained from the virus collections in National Institute of Agricultural Science and Technology and fields samples nationwide. Field samples are furthur purified by inoculating test plants or directly applied to oligonucleotide DNA chips due to the difficulties in mechanical inoculation. All samples are carefully examined by PCR and nucleotide sequencing of the products before total RNA extraction.
Genome information of target viruses is obtained from several public databases, such as NCBI or DPVWeb, and National Institute of Agricultural Science and Technology. Approximately five thousand oligonucleotides for thirty target viruses are designed by Array Designer 3.01. Among them, three hundred oligonucleotides are selected and screened. They are selected based on the transcription mechanism, titers of viruses in host plants, and copy number of target genomic or subgenomic RNA. Most of diagnostic chips contain a single species of target virus or strains derived from the target virus. However, oligonucleotide chip constructed in this project contains multiple species of target viruses. We overcome such technical problems by developing a unique labelling method to incorporate dye nonspecifically into all kind of RNAs.
When the diagnostic chip contains multiple targets or the sample contains low copy of target RNA/DNA, oligonucleotide DNA chip for the diagnosis of plant viruses developed in this project will suggest lobust solutions with technical advances. Also it could be directly applied to the diagnosis of animal and human viral pathogens and the forecast of the occurrence of virus diseases.
목차 Contents
- 표지 ... 1
- 제출문 ... 2
- 요약문 ... 3
- SUMMARY ... 4
- CONTENTS ... 5
- 목차 ... 6
- 제1장 연구개발과제의 개요 ... 7
- 1절. 연구개발의 필요성 ... 7
- 1. 기술적 측면 ... 7
- 2. 경제.산업적 측면 ... 8
- 3. 사회.문화적 측면 ... 8
- 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 9
- 1절. 국내.외 관련기술의 현황과 문제점 ... 9
- 1. 국내현황 ... 9
- 2. 국외현황 ... 9
- 3. 문제점 ... 9
- 2절. 앞으로의 전망 ... 10
- 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 11
- 1절. 진단 대상 바이러스병 선정 및 바이러스 균주의 확보 ... 11
- 1. 진단대상 바이러스병의 선정 ... 11
- 2. 바이러스 분리주 수집 및 정밀진단 ... 13
- 3. 진단대상 바이러스의 확보 및 검정 ... 16
- 2절. 작물 바이러스 진단용 oligonucleotide chip 제작기술 개발 및 상용화 ... 27
- 1. oligonucleotide의 설계 및 제작 ... 27
- 2. pilot DNA chip 제작 및 검정 ... 32
- 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 55
- 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 56
- 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 57
- 제7장 참고문헌 ... 58
- 끝페이지 ... 59
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