초록 ▼

○ 연구결과
- 한우 육량·육질 관련 SNP 마커발굴 및 유전체 선발을 위한 집단을 구축하였고 마커도움선발/유전체정보를 이용한 유전능력평가 프로그램을 개발하였음.
- 한우유전체 서열을 해독/활용하여 육량과 육질에 대한 후보유전자를 규명하였음
- 한우전장연관분석을 수행하여 육량과 육질에 영향을 주는 SNP 마커를 개발하여, 고급육과 관련된 우수한 종축과 비육밑소를 조기에 선발할 수 있는 마커도움선발(MAS) 체계를 확립하였고, 마커도움선발반응을 평가하였음.
- 한우전장연관분석을 위하여 Illumina 50K SN

○ 연구결과
- 한우 육량·육질 관련 SNP 마커발굴 및 유전체 선발을 위한 집단을 구축하였고 마커도움선발/유전체정보를 이용한 유전능력평가 프로그램을 개발하였음.
- 한우유전체 서열을 해독/활용하여 육량과 육질에 대한 후보유전자를 규명하였음
- 한우전장연관분석을 수행하여 육량과 육질에 영향을 주는 SNP 마커를 개발하여, 고급육과 관련된 우수한 종축과 비육밑소를 조기에 선발할 수 있는 마커도움선발(MAS) 체계를 확립하였고, 마커도움선발반응을 평가하였음.
- 한우전장연관분석을 위하여 Illumina 50K SNP chip을 서산 후대검정우 600두에 분석하였고, 추가적으로 후대검정우 1,200여두, 상용집단 1,600여두에 대하여 192개 SNP마커조합 및 SNP 96마커 조합분석을 통하여 육량육질 마커 55개 SNP를 최종 발굴하여, 최종적으로 한우 육량육질 조기선발용 DNA(SNP) kit를 제작하였음.

Abstract ▼

IV. Research and Development Outcomes
1) Constructed Hanwoo reference population for SNP detection and genomic selection of carcass and meat quality in Hanwoo, and developed genetic evaluation programs that were combined with marker-assisted selection and genomic information.
2) Characterized

IV. Research and Development Outcomes
1) Constructed Hanwoo reference population for SNP detection and genomic selection of carcass and meat quality in Hanwoo, and developed genetic evaluation programs that were combined with marker-assisted selection and genomic information.
2) Characterized candidate genes for carcass and meat quality through Hanwoo genome analysis.
3) Developed SNP markers for carcass and meat quality through GWAS analyses and established MAS system for pre-selection of genetically superior sires and steers, and evaluated MAS response.
4) The Illumina 50K SNP chips were applied in the Seosan elite candidate sires and steers (N=600) for WGAS analysis for carcass and meat quality, and additional samples from the Seoson population (N=1,200) and Hanwoo commercial populations (N=1,600) were used to genotype the 192 and 96 SNP sets to finalize a set of 55 SNP markers that are used for construction of the DNA (SNP) kit for the pre-selection of Hanwoos with high quality in carcass and meat quality.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 요 약 문 ... 3
• SUMMARY(영문요약문) ... 5
• CONTENTS(영 문 목 차) ... 7
• 목 차 ... 10
• 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 12
• 제 1 절 연구개발의 필요성 ... 12
• 1. 경제적 측면 ... 12
• 2. 산업적 측면 ... 12
• 3. 기술적 측면 ... 13
• 제 2 절 연구의 목표 ... 14
• 1. 연구개발의 최종목표 및 주요내용 ... 14
• 제 3 절 세부과제별 연구수행 내용 ... 15
• 1. SNP 정보를 이용하여 도체 형질에 대한 한우의 유전체 육종가 추정 ... 15
• 2. 한우 집단의 육량·육질 형질에 대한 분자유전학적 특성 분석 ... 16
• 3. 한우 유전체에서 통계유전학적 분석을 이용한 DNA마커 발굴 ... 17
• 4. 한우 경제 형질 연관 SNP contents 발굴을 위한 대규모 SNP scanning 및 validation study ... 18
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 19
• 제 1 절 국내외 현황 ... 19
• 1.유전체 선발에 대한 연구 현황 ... 19
• 2. 분자유전을 활용한 연구 현황 ... 22
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 24
• 제 1 절 한우집단 조성, 개량 평가 및 산업 시스템 구축 ... 24
• 1. 한우 개량 평가를 위한 시험 집단 ... 24
• 2. 유전체 선발(Genomic Selection)을 위한 자료 구축 ... 29
• 3. 유전체 선발(Genomic Selection) ... 34
• 제 2 절 한우 집단의 육량·육질 형질에 대한 분자유전학적 특성 분석 ... 48
• 1. 기능성 후보유전자와 도체형질과의 연관성 분석 ... 48
• 2. 한우 고기 내 불포화지방산 함량관련 유전자 연구 ... 54
• 3. 불포화지방산 강화 FASN 유전자 변이의 후보종모우와 암소 선발 효과 검증 ... 58
• 4. 한우 후대검정우 및 상업집단에서 Acetyl-CoA Carboxylase-α (ACACA) 유전자의 단일염기 변이가 육량 및 육질에 미치는 영향 검증 ... 65
• 5. FASN 과 ACACA 유전자들 내의 단일염기변이간의 상호작용효과를 통해 상업집단의 육량 및 육질에 미치는 영향을 검증. ... 67
• 6. 보고된 소 QTL부위의 육량 및 육질 유용 DNA 변이 개발 및 이용. ... 70
• 7. 일본화우의 QTL 영역 데이터를 비교 이용하여 한우의 중요한 SNP 들의 규명. ... 81
• 8. 한우암소의 산유량 생산 관련 후보후전자 연구 ... 89
• 9. 한우 유전체 분석을 이용한 대량 SNP 발굴 ... 91
• 10. 한우 유전체에서 확보된 3M SNP를 이용한 대용량 SNP 분석시스템 개발 ... 94
• 11. GWAS 분석에서 발굴된 육량·육질 SNP 좌위 원인유전자 분석 ... 97
• 제 3 절 한우유전체에서 통계유전학적 분석을 이용한 DNA마커 발굴 ... 103
• 1. 한우집단에서 유용 SNP발굴, 연관불균형 조사 및 Hapmap 구성 ... 103
• 2. 시험집단에서 대용량 SNP chip을 이용하여 육량육질과 관련된 SNP 대량발굴 ... 108
• 3. 상용집단에서 육량육질과 관련된 SNP 검정 및 최종 육량육질 SNP 마커 발굴 ... 121
• 4. 발굴된 육량·육질 SNP 마커를 보정한 분자육종가 추정 및 선발반응 평가 ... 139
• 제 4 절 대규모 SNP genotyping을 통한 형질 관련 SNP contents 발굴 ... 144
• 1. 연구개발 내용 및 방법 ... 144
• 2. 연구개발 결과 ... 155
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 201
• 제 5 장 연구개발 성과 및 성과활용 계획 ... 207
• 제 1 절 한우 유전체 서열 해독 및 한우 유용 SNP 대량발굴 ... 207
• 제 2 절 한우 육량육질 SNP kit 개발 및 적용 ... 209
• 1. 선 유전정보에 따른 적절한 사양정보를 제공하는 육종·사양을 조합한 새로운 패러다임 구축 ... 209
• 2. 육량육질 SNP 마커를 국가 한우 종모우 검정사업에 활용 ... 209
• 3. 육량육질 SNP 마커를 국가 암소 검정사업에 활용 ... 210
• 4. 브랜드, 생산 농가 맞춤형 최적 육량육질 프로그램 제공 ... 210
• 5. 한우 육량육질 SNP키트의 사업화 어려움 ... 210
• 제 3 절 육량육질 SNP마커를 한우 산업에 적용할 경우 경제적 파급효과 ... 211
• 1. 국가암소검정사업 ... 211
• 2. 국가 후보종모우 선발에 적용 및 육량육질 SNP kit 적용전략 ... 212
• 3. 육량육질 SNP kit의 다용도성 ... 212
• 제 4 절 유전체선발(Genome selection) 적용 ... 213
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 214
• 제 7 장 참고문헌 ... 215
• 끝페이지 ... 218