초록 ▼

<연구목표>
감염성 질환의 조기 진단과 치료를 위하여 기존 연구의 한계점인 단일계 중심의 유전체 분석에서 탈피하여, 미생물과 인간을 포함한 동식물의 상호작용유전체를 바탕으로 기주의 생체 방어시스템 이해의 새로운 패러다임을 제시하고 응용함
<연구내용>
○ 계통 간 상호작용 연구 모델의 구축
- 인간ㆍ동물 병원성 미생물을 이용한 식물 면역 반응 유도
- 식물 병원성 미생물을 이용한 동물 면역 반응 유도
- 해충-식물-근권미생물 다자간 상호작용 시스템 구축
○ 기주-병원균의 시스템적 연구 기반 구축<

<연구목표>
감염성 질환의 조기 진단과 치료를 위하여 기존 연구의 한계점인 단일계 중심의 유전체 분석에서 탈피하여, 미생물과 인간을 포함한 동식물의 상호작용유전체를 바탕으로 기주의 생체 방어시스템 이해의 새로운 패러다임을 제시하고 응용함
<연구내용>
○ 계통 간 상호작용 연구 모델의 구축
- 인간ㆍ동물 병원성 미생물을 이용한 식물 면역 반응 유도
- 식물 병원성 미생물을 이용한 동물 면역 반응 유도
- 해충-식물-근권미생물 다자간 상호작용 시스템 구축
○ 기주-병원균의 시스템적 연구 기반 구축
- 대용량 유전체/전사체 데이터 분석 파이프라인 구축
- 병원성 미생물 수용체의 동․식물세포 교차 도입을 통한 새로운 모델 시스템 구축
- 병원균의 병원성 인자 및 면역 세포가 인지하는 병원균의 분자 표적 탐색
○ NGS 기반 상호작용 유전체 대량 분석, 모델링 및 검증
- 동ㆍ식물 기주 및 병원성ㆍ공생 미생물의 reference genome에 대한 초고속 해독
- 비교유전체학적 분석을 이용한 병원체 및 미생물체의 다양성, 진화적 상관관계를 규명하고 유전체 정보에 입각한 병인(病因) 기작 입증
- Dual-RNA-seq을 이용한 기주-병원균 상호 작용 전사체 분석
- 모델링을 이용한 병원성 미생물의 동ㆍ식물에 대한 공통면역반응 기전 연구

Abstract ▼

Research Background
○ The new term “intergenomics”is a new field to understand the interaction between microbe-hosts including animal, human, and plan via. Next-Generation Sequencing (NGS) technology.
○ The current technology faces big demand due to occurrence of pendemics on the critical huma

Research Background
○ The new term “intergenomics”is a new field to understand the interaction between microbe-hosts including animal, human, and plan via. Next-Generation Sequencing (NGS) technology.
○ The current technology faces big demand due to occurrence of pendemics on the critical human and plant diseases caused by climate change. The final objective to study this field is to prevent, digonosis, and control human diseases through full understanding on the pathogenesis and host defenses.
○ The glogal trends of intergenomics is under progeass very rapidly. National research need to be improved upon global level.
Overall Objective
To provide a new paradigm on the intergenomics by understanding microbe-host (animal and plant) multi-disciplined interactions and host defense systems using by current divergent cutting edge omics (e.g. genomics) techniques
Contents
○ Constructing models on microbe-host interaction
- Plant immunity against animal and human pathogens
- Animal immunity against plant pathogens
- Tritripich interaction study on insect-plant-soil bacteria
○ Establishment of genomics-based intra-pipeline on microbe-host interaction
- Constructing large scale genome and transcripome pipeline
- Host recognition study during animal and plant immune responses
- Pathogenesis determinants of target pathogens and searching molecular target
○ Analyzing and modeling NGS data
- Genome sequencing of reference microbial and animal genome
- Studying on comparative genomics, co-evolution, and pathogenesis from genome data
- Interactome analysis via. Dual-RNA-seq
- Modeling common animal and plant defense mechanism from intergenomics study

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서(보고서 초록) ... 3
• 요 약 문 ... 4
• SUMMARY ... 5
• CONTENTS ... 6
• 목차 ... 7
• 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 8
• 1절 연구 배경 ... 8
• 2절 연구의 필요성 ... 11
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 16
• 1절 국내외 기술개발 현황 ... 16
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 22
• 1절 연구 수행 추진전략 및 추진체계 ... 22
• 2절 패혈증균 Vibrio vulnificus 에 의한 식물/동물 인터지노믹스 연구 ... 24
• 3절 이질균 Shigella- 식물 인터지노믹스 연구 ... 47
• 4절 식물 병원성 Pseudomonas syringae -동물 인터지노믹스 기반 생체 방어연구 ... 59
• 5절 곤충-식물-세균 tritrophic 인터지노믹스 연구 ... 75
• 6절 세균-세균 인터지노믹스 연구 ... 83
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 85
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ... 87
• 1절 종합 활용계획 ... 87
• 2절 패혈증 Vibrio vulnificus 에 대한 인터지노믹스 상호작용 연구 ... 87
• 3절 인간 병원균 Shigella 에 대한 대체 기주로서의 식물의 역할 연구 ... 87
• 4절 종합 기대 성과 ... 88
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 89
• 제 7 장 연구시설ㆍ장비 현황 ... 91
• 제 8 장 참고문헌 ... 92
• 끝페이지 ... 95