초록 ▼

Ⅳ. 연구개발결과
○ Long non-coding RNA 동정 파이프라인 수립
◦ 질소 결핍 조건을 처리한 벼의 뿌리와 잎을 대상으로 strand-specific RNA-Seq 수행.
◦ RNA-Seq 결과를 생물정보학 기법으로 분석하여 1,840 개의 putative long non-coding RNA 발현 지역 동정 및 동정된 long non-coding RNA의 특징 분석.
○ 스트레스 조건에서의 벼 long non-coding RNA 발현 변화 분석
◦ 질소 결핍 조건에 따라 발현이 변하는 838

Ⅳ. 연구개발결과
○ Long non-coding RNA 동정 파이프라인 수립
◦ 질소 결핍 조건을 처리한 벼의 뿌리와 잎을 대상으로 strand-specific RNA-Seq 수행.
◦ RNA-Seq 결과를 생물정보학 기법으로 분석하여 1,840 개의 putative long non-coding RNA 발현 지역 동정 및 동정된 long non-coding RNA의 특징 분석.
○ 스트레스 조건에서의 벼 long non-coding RNA 발현 변화 분석
◦ 질소 결핍 조건에 따라 발현이 변하는 838 개의 putative long non-coding RNA 확인.
◦ OsAMT1.1 (암모늄 이온 수송 단백질) 발현 지역의 antisense strand에서 발현되는 cis-NATOsAMT1.1 동정 및 질소 결핍에 따른 발현 변화 확인.
◦ 질소 결핍 조건 외에도 기존 벼에서 수행된 염해/한발/추위 스트레스 조건에서의 RNA-Seq 데이터를 확보 및 분석하여 putative long non-coding RNA의 발현 패턴 분석.

Abstract ▼

Nitrogen is a key component of crop plants growth. To increase the crop yield, the enormous amount of nitrogen-containing fertilizer is used, which increases the total production cost and leads to environmental pollution caused by residual nitrogen source which crop doesn’t take up. For these reason

Nitrogen is a key component of crop plants growth. To increase the crop yield, the enormous amount of nitrogen-containing fertilizer is used, which increases the total production cost and leads to environmental pollution caused by residual nitrogen source which crop doesn’t take up. For these reasons, many researchers are considering the increase of crop’s nitrogen use efficiency as one of solutions to reduce the amount of nitrogen fertilizer. Long non-coding RNA is known as a regulatory RNA, which regulates the expression of its target genes by their own specific molecular mechanisms. Although recent research on the function of long non-coding RNA have revealed its importance in various biological phenomena, identification and functional investigations on plant long non-coding RNA was not actively progressed.
In this project (“Investigation on long intergenic long non-coding RNA in rice”), identification of long non-coding RNAs was performed against nitrogen-starved rice. To do this, we organized long non-coding RNA identification pipeline, which is based on high throughput sequencing technology and bioinformatics, and applied on long non-coding RNA identification in nitrogen-starved rice. As a result, we identified 1,840 of novel long non-coding RNAs and analyzed its characteristics.
We also identified 838 long non-coding RNAs of which the expression level was changed in nitrogen-starved conditions. Furthermore, we performed expressional analysis of identified long non-coding RNAs against RNA-Seq dataset which came from studies on other stress condition-treated rice, and checked the expression level of multiple long non-coding RNAs were also changed in those dataset. Finally, we identified cis-NATOsAMT1.1 as a nitrogen metabolism-related long non-coding candidate.

목차 Contents

• 완결과제 최종보고서 ... 1
• 제출문 ... 2
• 요약문 ... 3
• SUMMARY ... 5
• 목 차 ... 6
• 제 1 장 서 론 ... 7
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 12
• 제 3 장 연구개발 수행 내용 및 결과 ... 14
• 제 4 장 연구개발 목표 달성도 및 대외 기여도 ... 34
• 1. 세부과제별 정성적 연구목표대비 달성도 ... 34
• 2. 정량적 목표대비 달성도 ... 35
• 제 5 장 연구개발 결과의 활용계획 ... 36
• 제 6 장 연구개발 과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 37
• 제 7 장 기타 중요 변동사항 ... 38
• 제 8 장 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구장비 현황 ... 39
• 제 9 장 참고문헌 ... 40
• 끝페이지 ... 42