초록 ▼

4. 연구결과
가. 멸종위기종의 엽록체 유전체 정보 확보
1) 산작약: 152,698 bp 엽록체 전체 서열 확보, infA와 rpl32 유전자 소실, rpl22, rps18 유전자 pseudogenization 확인
2) 제비동자꽃: 152,320 bp 엽록체 전체 서열 확보, infA 유전자 소실, accD 유전자 pseudogenization 확인
3) 분홍장구채: 150,224 bp 엽록체 전체 서열 확보, infA 유전자 소실
4) 섬시호: 150,069 bp 엽록체 전체 서열 확보
5) 서

4. 연구결과
가. 멸종위기종의 엽록체 유전체 정보 확보
1) 산작약: 152,698 bp 엽록체 전체 서열 확보, infA와 rpl32 유전자 소실, rpl22, rps18 유전자 pseudogenization 확인
2) 제비동자꽃: 152,320 bp 엽록체 전체 서열 확보, infA 유전자 소실, accD 유전자 pseudogenization 확인
3) 분홍장구채: 150,224 bp 엽록체 전체 서열 확보, infA 유전자 소실
4) 섬시호: 150,069 bp 엽록체 전체 서열 확보
5) 서울개발나물: 154,477 bp 엽록체 전체 서열 확보, rps19 유전자 소실
나. 멸종위기종 왕제비꽃의 분류학적 실체 규명
- 우리나라 왕제비꽃은 요녕성에서 채집된 기준표본과 중국 길림성 분포 왕제비꽃의 형태적 특징과 동일
- 일본에 분포하는 Viola thibaudieri와는 형태적, 유전적으로 뚜렷히 구별됨
다. 멸종위기종의 집단분석용 유전자 표지 개발 및 유전다양성 분석
1) 왕제비꽃의 마이크로새틀라이트 마커 개발
- 중국 길림성 집단을 포함하여 한국과 중국 13개 개체군, 374개체 시료 확보 및 DNA 추출 완료
- GS-FLX 플랫폼을 이용하여 295.9 Mbp (818,528 reads) 확보
- 30,704개 반복서열로부터 96개 후보구간 선정
- 한국과 중국 2개 집단으로 검증한 결과 27개의 다형성 있는 마커 선발
2) 넓은잎제비꽃의 마이크로새틀라이트 마커 개발
- 중국 흑룡강성, 요녕성 집단을 포함하여 한국과 중국 14개 개체군, 390개체 시료 확보 및 DNA 추출 완료
- GS-FLX 플랫폼을 이용하여 133.5 Mbp (443,935 reads) 확보
- 31,493개 반복서열로부터 192개 후보구간 선정
- 한국과 중국 2개 집단으로 검증한 결과 31개의 다형성 있는 마커 선발
3) 노랑만병초의 유전다양성 분석
- 노랑만병초와 만병초는 유전적으로 뚜렷이 구별되며, 만병초의 유전적 다양성이 전반적으로 노랑만병초 보다 낮음
- 한반도 만병초 집단은 울릉도 집단을 제외하고 서식지 별로 구별되지 않으며, 울릉도 집단은 일본과 한반도 집단 중간형으로 나타남
- 설악산 노랑만병초는 structure 분석 결과 admixture 현상이 발견되었으며, He가 Ho보다 낮고, 설악산 만병초와 rbcL이 동일한 유형으로 나타나 노랑만병초와 만병초의 잡종으로 형성되었을 가능성이 제기
- 설악산 노랑만병초는 백두산과 로백산, 일본 훗카이도, 타키야마, 사할린 등에 분포하는 다른 노랑만병초와 확연히 구분됨

Abstract ▼

As the convention on Biological Diversity (CBD) was ratified at 1993, the genetic information on the wild species in Korea took essential part in claiming the sovereign rights over biological resources by providing a basis for the claim. This study aims to provide a scientific basis for managing and

As the convention on Biological Diversity (CBD) was ratified at 1993, the genetic information on the wild species in Korea took essential part in claiming the sovereign rights over biological resources by providing a basis for the claim. This study aims to provide a scientific basis for managing and conserving important species in Korea through verification of genetic uniqueness and evaluating genetic diversity. To obtain genetic information of chloroplast genomes of Paeonia obovata, Lychnis wilfordii, Silene capitata, Bupleurum latissimmum, and Pterygopleurum neurophyllum, next-generation sequencing (GS-FLX Titanium or HiSeq 2500 platforms) were performed. After extracting chloroplast genome sequences from raw sequence data, the chloroplast genome were annotated and gaps between neighboring contigs were filled by Sanger sequencing. The chloroplast genome of P. obovata was 152,689 bp and deletion of infA and rpl32 and pseudogenization of rpl22 and rps18 were detected. The chloroplast genome of L. wilfordii was 152,320bp and deletion of infA and pseudogenization of accD were identified. The chloroplast genome of S. capitata was 150,224 bp and deletion of infA was detected. The chloroplast genomes of B. latissimmum and P. neurophyllum were 150,069 bp and 154,477 bp, respectively. The deletion of rps 19 in the genome of P. neurophyllum was also identified. The genetic characteristics of chloroplast were investigated by comparison with previously reported chloroplast sequences from related species. An endangered species, Viola websteri, was investigated for its taxonomic identity. The morphological characteristics of V. websteri in the Korean peninsula were identical to the type specimen collected from Liaoning province. Also, V. websteri was clearly distinguished genetically and morphologically from V. thibaudieri. The microsatellite markers for V. websteri and V. mirablis were developed using GS-FLX platform. The low depth of genomic sequences was obtained and candidate microsatellite regions were identified with di- and tri- repeat motifs. 27 polymorphic microsatellites among 96 candidates of V. websteri and 31 polymorphic microsatellites 192 candidates of V. mirablis were identified between Korean and Chinese populations. Lastly, population genetic diversity and structure of Rhododendron aureum and R. brachycarpum were investigated. These two species were genetically separated and the genetic diversity o fR. aureum is higher than R. brachycarpum. The populations of R. brachycarpum in the Korean peninsula were not separated but the Ullreung Is population was separated from other Korean populations. With STRUCTURE analysis, the R. aureum of Mt. Seorak Population showed admixture and clearly distinguished from other R. aureum population. Also, expected heterozygosity of the R. aureum Mt. Seorak Population was lower than observed heterozygosity and the rbcL sequences of R. aureum Mt. Seorak Population was identical to its of R. brachycarpum in neighboring sites. Thus, we concluded that R. aureum Mt. Seorak Population should be managed as a single conservation management unit and in situ transplantation from other populations should be avoided to preserve its genetic uniqueness. These results will be useful for management, restoration and listing of endangered species as well as a low data for red-list book. The newly developed molecular markers will be applied for future population genetic studies.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 요약문 ... 5
• 목차 ... 8
• 표목차 ... 11
• 그림목차 ... 13
• Abstract ... 15
• I. 서언 ... 19
• II. 멸종위기종의 엽록체유전체 정보 확보 ... 23
• 1. 산작약의 엽록체 유전체 정보 확보 ... 25
• 가. 서론 ... 25
• 나. 연구방법 ... 26
• 다. 결과 및 고찰 ... 28
• 라. 참고문헌 ... 36
• 2. 제비동자꽃의 엽록체 유전체 정보 확보 ... 40
• 가. 서론 ... 40
• 나. 연구방법 ... 41
• 다. 연구결과 ... 43
• 라. 고찰 ... 46
• 라. 참고문헌 ... 50
• 3. 분홍장구채의 엽록체 유전체 정보 확보 ... 52
• 가. 서론 ... 52
• 나. 연구방법 ... 53
• 다. 연구결과 ... 55
• 라. 고찰 ... 58
• 라. 참고문헌 ... 62
• 4. 섬시호의 엽록체 유전체 정보 확보 ... 64
• 가. 서론 ... 64
• 나. 연구방법 ... 65
• 다. 연구결과 ... 67
• 라. 고찰 ... 70
• 라. 참고문헌 ... 72
• 5. 서울개발나물의 엽록체 유전체 정보 확보 ... 74
• 가. 서론 ... 74
• 나. 연구방법 ... 75
• 다. 연구결과 ... 76
• 라. 고찰 ... 79
• 라. 참고문헌 ... 85
• III. 멸종위기종 왕제비꽃의 분류학적 실체 규명 ... 87
• 가. 서론 ... 89
• 나. 연구방법 ... 90
• 다. 연구결과 ... 93
• 라. 고찰 ... 101
• 마. 참고문헌 ... 105
• Ⅳ. 멸종위기종의 집단분석용 마커 개발 및유전다양성 분석 ... 107
• 1. 왕제비꽃의 집단분석용 마커 개발 ... 109
• 가. 서론 ... 109
• 나. 연구방법 ... 110
• 다. 연구결과 ... 114
• 라. 고찰 ... 114
• 마. 참고문헌 ... 119
• 2. 넓은잎제비꽃의 집단분석용 마커 개발 ... 122
• 가. 서론 ... 122
• 나. 연구방법 ... 123
• 다. 연구결과 ... 127
• 라. 고찰 ... 129
• 마. 참고문헌 ... 130
• 3. 노랑만병초의 유전다양성 분석 ... 133
• 가. 서론 ... 133
• 나. 연구방법 ... 135
• 다. 연구결과 ... 136
• 라. 고찰 ... 139
• 마. 참고문헌 ... 142
• V. 종합고찰 ... 147
• 끝페이지 ... 150