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NTIS 바로가기주관연구기관 | 한국생명공학연구원 Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology |
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연구책임자 | 김운봉 |
참여연구자 | 구남진 , 오상호 , 김지한 , 김민서 , 그외 다수 , 김계영 , 박성진 , 윤종철 , 고건환 , 송완호 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2015-11 |
주관부처 | 미래창조과학부 KA |
사업 관리 기관 | 한국과학기술정보연구원 Korea Institute of Science and Technology Information |
등록번호 | TRKO201600000539 |
DB 구축일자 | 2016-04-16 |
키워드 | 치매,유전체,패스웨이,노인성 질환,발현체,시스템바이올로지dementia,genome,pathway,aging,expressome,system biology |
1. 노인성질환(치매) 분석을 위한 대용량 유전체 데이터 분석 기법 개발
○ 개발된 유전체 파이프라인의 전체적인 단계는 다음과 같다. 기존에 잘 알려진 프로그램을 이용하여 대용량 유전체 데이터를 보다 정확하고 빠르게 분석할 수 있는 클러스터 시스템에 맞게 파이프라인을 구축함
2. 발현체 정보 (Microarray, RNA-Seq, 등) 분석 기술 개발
○ 우선 affymetrix 회사의 마이크로어레이 데이터인 셀 파일 (cel file)을 불러오고 품질검증 (quality control)을 진행한다. 품질이 좋지 않
Ⅳ. Result of the study
○ Method for genomic NGS data analysis
We developed a pipeline for NGS-base genomic data. The pipeline consists of several public programs which are exactly integrated for cluster computing system
○ Analysis pipeline for microarray and RNA-seq
Our pipeline for micr
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