초록 ▼

전통 천연물 및 표적 단백질 통합 데이터베이스 구축
- 다양한 전통 천연물 공개 데이터베이스에 산재한 정보를 효과적으로 통합하고 표준화하기 위하여 국제 식별자에 매핑한 후 분류 및 통합하는 과정을 수행
- 다양한 정보 및 정보 간의 연관관계를 효과적으로 저장, 검색 가능한 스키마를 개발하였으며, 이를 기반으로 통합 데이터베이스를 구축
가상인체 및 세포 모델링 기술 개발
- 가상인체를 구성하는 entity와 관계 종류, 조직-질병 특이적인 상황정보와 정보 출처 등이 표현 가능한 인체 모델링 정형언어를 개발

전통 천연물 및 표적 단백질 통합 데이터베이스 구축
- 다양한 전통 천연물 공개 데이터베이스에 산재한 정보를 효과적으로 통합하고 표준화하기 위하여 국제 식별자에 매핑한 후 분류 및 통합하는 과정을 수행
- 다양한 정보 및 정보 간의 연관관계를 효과적으로 저장, 검색 가능한 스키마를 개발하였으며, 이를 기반으로 통합 데이터베이스를 구축
가상인체 및 세포 모델링 기술 개발
- 가상인체를 구성하는 entity와 관계 종류, 조직-질병 특이적인 상황정보와 정보 출처 등이 표현 가능한 인체 모델링 정형언어를 개발
- 다양한 상용 데이터베이스와 방대한 문헌 정보로부터 추출한 관계 정보를 일관성 있게 데이터베이스화
- 유전자, 대사물질, 세포, 조직, 기관 , 질병, 약물, 관계정보, 생물학적 프로세스, 상황정보 각각에 대한 통합 ontology를 구축
- 개발한 인체 모델링 정형언어를 활용하여 1,300만개 이상의 조직 특이적, 조직 간 유전자 조절 관계, 단백질 상호 작용 관계, 신호 전달 경로 정보, 대사 반응 관계, 다 수준간의 관계를 통합한 공통(generic) 가상 세포 모델을 구축

(출처 : 보고서 요약서 4p)

Abstract ▼

For most diseases, the one drug, one target model has limitation in many aspects. Furthermore, it is now evident that multi-component drugs or multi-targeting drugs, work synergistically to potentiate therapeutic effects of multiple targets and signaling pathways. Thus, we constructed the integrated

For most diseases, the one drug, one target model has limitation in many aspects. Furthermore, it is now evident that multi-component drugs or multi-targeting drugs, work synergistically to potentiate therapeutic effects of multiple targets and signaling pathways. Thus, we constructed the integrated database, which contains traditional herbal medicine, functional food, and up-to-date molecular drug/target information. Moreover we provide a search engine which makes it possible to infer compound combinations with clinical effects by applying association rule mining. As a result, we suggest a list of compound combinations, which are expected to have clinical effects on the disease, with statistical significance scores. We believe that out database will help researchers to initiate drug combination design and development. In addition, we propose a framework for reconstructing genome-scale biological networks into whole body level. We developed bio-synergy modeling language (BSML) format that can contain various contexts such as anatomical or disease contexts and collected various types of biological interactions in BSML format. Based on BSML format, we constructed context specific directed associations (CODA), which represents generic virtual physiological humans system. CODA comprises various types of interactions including not only molecular interactions such as tissue specific intra-cellular interactions and inter-cellular interactions but also associations between molecules and over-molecules. By using CODA, we will simulate effects of drugs and infer mechanisms of drugs in the future.

(출처 : SUMMARY 7p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 3
• 보고서 요약서 ... 4
• 요약문 ... 5
• SUMMARY ... 7
• CONTENTS ... 8
• 목차 ... 9
• 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 10
• 제 1 절 연구개발의 목적 ... 10
• 제 2 절 연구개발의 필요성 ... 10
• 제 3 절 연구개발의 범위 ... 10
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 12
• 제 1 절 유효성분 및 협동유효성분간의 표적단백질 기능 데이터베이스 ... 12
• 제 2 절 통합데이터베이스 구축을 위한 표준화를 위한 데이터베이스 ... 13
• 제 3 절 가상인체 및 세포 모델링 기술 ... 15
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 20
• 제 1 절 유효성분 및 협동유효성분간의 표적단백질 기능 데이터베이스 ... 20
• 제 2 절 가상인체 및 세포 모델링 기술개발 ... 26
• 제 3 절 가상인체 시스템생물학을 이용한 다중표적 분석 기술 및 대사변화 모델 개발 ... 36
• 제 4 절 가상 인체모델 시각화에 적합한 네트워크 구현 방법 개발 ... 39
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 45
• 제 1 절 유효성분 및 협동유효성분간의 표적단백질 기능 데이터베이스구축 ... 45
• 제 2 절 가상인체 및 세포 모델링 기술개발 ... 46
• 제 3 절 가상인체 시스템생물학을 이용한 다중표적 분석 기술 및 대사변화 모델 개발 ... 48
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ... 51
• 제 1 절 의약활성, 효능작용점, 임상영양 정보 추가의 필요성 ... 52
• 제 2 절 천연물 소재-효능 간 연관규칙 분석을 통한 천연물 신약 개발 ... 52
• 제 3 절 조직 및 기관 특이성 가상세포 시스템 개발의 필요성 ... 53
• 제 4 절 가상인체 시스템의 활용성 ... 53
• 제 5 절 기대성과 ... 53
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 54
• 제 1 절 수집한 데이터베이스 ... 55
• 제 2 절 수집한 관련 연구 정보 ... 55
• 제 3 절 수집한 툴 정보 ... 56
• 제 7 장 연구시설·장비 현황 ... 57
• 제 8 장 참고문헌 ... 58
• 끝페이지 ... 61