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NTIS 바로가기주관연구기관 | 한국식품연구원 Korea Food Research Institute |
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연구책임자 | 남영도 |
참여연구자 | 임성일 , 정원형 , 임미영 , 이소영 , 이나리 , 신희순 , 박소림 , 서동호 , 이명기 , 임상동 , 조용선 , 한규재 , 정승원 , 노보영 , 이은숙 , 이지연 , 김수애 , 엄지은 , 배진주 , 권다애 , 송은지 , 강지수 , 신동욱 , 박용수 , 노성운 , 박용하 , 이지열 , 김근배 , 서명지 , 빌헬름 홀자펠 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2017-01 |
과제시작연도 | 2016 |
주관부처 | 미래창조과학부 Ministry of Science, ICT and Future Planning |
등록번호 | TRKO201700003716 |
과제고유번호 | 1711045968 |
사업명 | 한국식품연구원연구운영비지원 |
DB 구축일자 | 2017-09-20 |
키워드 | 한국인.장내미생물.차세대염기서열 분석방법.게놈.프로바이오틱스.Korean.Gut microbiome.Next-generation sequencing.Genome.Probiotics. |
DOI | https://doi.org/10.23000/TRKO201700003716 |
○장내미생물 분석의 기준 제시
해당 과제의 진행을 통해 3종의 NGS platform 및 5종의 16S rDNA gene region 분석, whole metagenome shotgun sequencing 결과와의 비교를 통해 최적 NGS 분석 기준으로서 miseq platform의 V3/4 region을 최종 선정하였음.
○한국인 장내미생물 특성 구명
총 1,000명의 한국인 장내미생물 특성 분석을 통해, phylum 수준에서는 기존의 보고와 같이 Firmicutes 및 Bacteroidetes 우점하나 종
Results
○ Development of NGS platforms for the analysis of gut microbiome
We compared the efficiency and accuracy of three NGS platforms and five 16S rDNA gene regions with the data of whole metagenome shotgun sequencing. A NGS system and target gene regions were finally selected for the
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