초록 ▼

(연구과제 통합목표)
바이오인포매틱스를 통하여 소아 악성뇌종양 조직에서 발암/재발/악성화/전이의 기전을 규명함

(세부과제 목표)
● [제1세부과제] 제2세부과제의 유전체분석 결과를 기반으로 수모세포종과 뇌실내 악성종양들의 발암/진행/악성화/전이에 관여하는 유전적변이에 대하여 기능검사 및 동물실험을 시행하여 새로운 치료 타겟을 발굴함

● [제2세부과제] 바이오인포매틱스 기반 유전체, 전사체, 대사체 자료의 통합 오믹스분석을 통하여 수모세포종과 뇌실내 악성종양들의 발암/재발/악성화/전이와 관련된 메카

(연구과제 통합목표)
바이오인포매틱스를 통하여 소아 악성뇌종양 조직에서 발암/재발/악성화/전이의 기전을 규명함

(세부과제 목표)
● [제1세부과제] 제2세부과제의 유전체분석 결과를 기반으로 수모세포종과 뇌실내 악성종양들의 발암/진행/악성화/전이에 관여하는 유전적변이에 대하여 기능검사 및 동물실험을 시행하여 새로운 치료 타겟을 발굴함

● [제2세부과제] 바이오인포매틱스 기반 유전체, 전사체, 대사체 자료의 통합 오믹스분석을 통하여 수모세포종과 뇌실내 악성종양들의 발암/재발/악성화/전이와 관련된 메카니즘을 이해하고 관련된 새로운 바이오마커나 분자표적자를 발굴함

[제1세부과제]
♦ 소아 악성뇌종양(수모세포종, 뇌실내종양)에서 driver gene mutation의 발견
♦ 소아뇌종양의 발암/진행/악성화/전이되는 각 단계의 주요 유전적 변이를 설명함
♦ 악성종양의 주요 유전적 변이에 대한 in vitro functional study
♦ 동물모델에서 유전적 변이가 종양의 발암/진행/악성화/전이 과정에 미치는 영향 분석
♦ 문제의 유전자와 연관된 genetic pathway에 대한 기능적 관계 확인
♦ 연관된 genetic pathway를 공격할 수 있는 치료전략의 가설을 세우고 기초적인 검증

[제2세부과제]
♦ Whole-exome sequencing 자료 분석을 통하여 수모세포종 및 악성 뇌실내종양 조직에서 일어난 유전체 변화(genomic alteration) 분석
♦ Whole-transcriptome sequencing 자료 분석을 통해 수모세포종 및 악성 뇌실내종양 조직에서 일어난 전사체 변화 비교 분석
♦ Gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS)를 이용하여 수모세포종 및 악성 뇌실내종양 조직에서의 유기대사체 프로파일 분석
♦ 오믹스 통합 분석(integrated analysis)을 통하여 소아 악성뇌종양의 발암/재발/악성화/전이와 관련되어 변화된 pathway 및 신호전달체계를 규명

(연구개발에 따른 기대성과)
♦ 예후가 극히 나쁜 소아의 주요 악성 뇌종양에 대한 유전적 정보를 획득하고 주요 유전자변이를 발굴함
♦ 발견된 유전자변이를 기반으로 새로운 표적 치료법의 개발에 기여함
♦ 연구과정에서 구축하게 될 새로운 멀티오믹스 통합분석방법으로 다른 암과 질병연구에 응용할 수 있음

( 출처 : 요약문 5p )

Abstract ▼

(Research project aim)
We aim to investigate mechanisms of tumorigenesis, recurrence, malignant transformation and metastasis in pediatric malignant brain tumor through bioinformatics.

(Subproject aims)
● [Specific aim of subproject 1] Based on the molecular analysis from ‘Subproject 2’

(Research project aim)
We aim to investigate mechanisms of tumorigenesis, recurrence, malignant transformation and metastasis in pediatric malignant brain tumor through bioinformatics.

(Subproject aims)
● [Specific aim of subproject 1] Based on the molecular analysis from ‘Subproject 2’, we sought to investigate novel therapeutic target through in vitro functional screening and in vivo animal experiment on genetic mutations those involve tumorigenesis, recurrence, malignant transformation and metastasis in medulloblastoma and intraventricular tumors.

● [Specific aim of subproject 2] We aim to understand mechanisms and discover novel biomarkers/molecular target relating tumorigenesis, recurrence, malignant transformation, metastasis in medulloblastoma and intraventricular tumor through combined omics data which includes genome, transcriptome, and metabolome data bases on bioinformatics.

[Specific aim of subproject 1]
♦ Find driver gene mutation in pediatric malignant brain tumor (medulloblastoma, intraventricular tumor).
♦ Demonstrate genetic mutation in each stage of recurrence, malignant transformation and metastasis in pediatric brain tumor.
♦ Conduct in vivo functional study regarding major genetic mutation in malignant tumor.
♦ Analyze affected tumorigenesis, recurrence, malignant transformation and metastasis by genetic mutation in animal models.
♦ Confirm functional correlation between the genetic pathway and the gene of interest.
♦ Construct hypothesis on therapeutic strategy targeting related genetic pathway and rudimentary verification

[Specific aim of subproject 2]
♦ Analyze genomic alteration in medulloblastoma and intraventricular tumor through whole-genome sequencing.
♦ Conduct comparative transcriptome analysis in medulloblastoma and intraventricular tumor through whole-transcriptome sequencing.
♦ Profile organic metabolome in medulloblastoma and intraventricular tumor tissue through gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS).
♦ Demonstrate altered pathway and signaling system regarding tumorigenesis, recurrence, malignant transformation and metastasis in pediatric malignant brain tumor through omics integrated analysis.(Expected results from the research project)
♦ Discover major genetic mutation and obtain genetic information in main malignant brain tumors with dismal prognosis.
♦ Contribute in development of novel therapeutic target based on discovered genetic mutation.
♦ The new multi-omics integrated analysis that has been constructed through current study can be applied in analyzing other cancers and diseases.

( 출처 : SUMMARY 6p )

목차 Contents

• 표지 ... 1제 출 문 ... 2목차 ... 3연구개발사업 최종연구개발결과보고서 요약문 ... 5Project Summery ... 6총괄연구과제 연구결과 ... 7 1. 총괄연구과제의 최종 연구개발 목표 ... 7 2. 총괄연구과제의 최종 연구개발 내용 및 결과 ... 10 3. 총괄연구과제의 연구결과 고찰 및 결론 ... 24 4. 총괄연구과제의 연구성과 및 목표달성도 ... 27 5. 총괄연구과제의 활용계획 ... 40 6. 첨부서류 ... 42제1세부연구과제 연구결과 ... 48 1. 제1세부연구과제의 최종 연구개발 목표 ... 49 2. 제1세부연구과제의 연구대상 및 방법 ... 50 3. 제1세부 연구과제의 최종 연구개발결과 ... 52 4. 제1세부연구과제의 연구결과 고찰 및 결론 ... 59 5. 제1세부연구과제의 연구성과 및 목표달성도 ... 61 6. 제1세부연구과제의 활용계획 ... 62 7. 참고문헌 ... 62제2세부연구과제 연구결과 ... 64 1. 제2세부연구과제의 최종 연구개발 목표 ... 65 2. 제2세부연구과제의 연구대상 및 방법 ... 66 3. 제2세부 연구과제의 최종 연구개발결과 ... 74 4. 제2세부연구과제의 연구결과 고찰 및 결론 ... 106 5. 제2세부연구과제의 연구성과 및 목표달성도 ... 107 6. 제2세부연구과제의 활용계획 ... 108 7. 참고문헌 ... 108끝페이지 ... 115