초록 ▼

▸ Human EMT 모델시스템 확립과 후성유전학적 landscape 완성 culture 조건이 까다롭고 media 등의 비용이 많이 들어 현실적으로 힘든 점이 많았지만 cell morphology, 분자 생물학적 여러 마커들로 확인하였을 때 안정적으로 EMT과정을 보여주는 human모델을 확립하였음. DNA methylation과 nucleosome occupancy를 한번에 알 수 있는 AcceSssIble 수행으로 human EMT 과정에서의 후성유전학적 landscape 완성함.
▸ EMT에서 중요 인자 발굴과 역할규

▸ Human EMT 모델시스템 확립과 후성유전학적 landscape 완성 culture 조건이 까다롭고 media 등의 비용이 많이 들어 현실적으로 힘든 점이 많았지만 cell morphology, 분자 생물학적 여러 마커들로 확인하였을 때 안정적으로 EMT과정을 보여주는 human모델을 확립하였음. DNA methylation과 nucleosome occupancy를 한번에 알 수 있는 AcceSssIble 수행으로 human EMT 과정에서의 후성유전학적 landscape 완성함.
▸ EMT에서 중요 인자 발굴과 역할규명 5가지 방법으로 EMT를 유도한 유전자 발현 microarray의 방대한 data(유전학적 분석)과 DNA methylation과 nucleosome occupancy를 한번에 볼 수 있는 AcceSssIble data(후성유전학적 분석)를 통합적으로 분석함으로써 흥미로운 유전자 TRIM29, 후성유전학적 실행자 CHD9을 찾고 loss of function study를 수행하여 기능을 규명하고 상호연관관계를 고찰함.
▸ 신경세포의 염증반응에서 후성유전학적 실행자 발굴과 기전 규명 Mouse primary Astrocyte에서 염증과정에서의 중요한 역할을 하는 epigenetic reader BRD2를 발굴하고 그아래의 타겟분자를 밝히고 분자생물학적 기전을 규명하였음.
▸ 종양 등의 질병 모델 적용과 small molecule의 적용
- 대표적인 epithelial과 mesenchymal breast cancer cell line을 이용하여 breast cancer에서 뿐 아니라 여러 암에서 중요한 target이 될 수 있는 BRD4_MYC_AP4_P21의 새로운 axis를 밝힘.
- Liver cancer에서는 epigenetic targeted small molecule JQ1의 효과를 검증하고 large cohort data와 time course transcriptome 분석/chromatin immunoprecipitation을 통한 검증으로 새로운 타켓 E2F2를 발굴하고 그 조절 전략을 제시함.
(출처: 연구결과 요약문 4p)

Abstract ▼

▸ Establishment of human EMT model system & epigenetic landscape Culturing HMEC has been considered as tricky and expensive, so it was hard to set up at early stage. However, we established EMT process and validated human model system based on cell morphology change and molecular biological markers.

▸ Establishment of human EMT model system & epigenetic landscape Culturing HMEC has been considered as tricky and expensive, so it was hard to set up at early stage. However, we established EMT process and validated human model system based on cell morphology change and molecular biological markers. Using AcceSssIble assay, we generated epigenetic landscape which covers DNA methylation change and chromatin accessibility (nuclesome occupancy) change during EMT.
▸ Excavation of key players during EMT We identified the zinc finger protein TRIM29 among 18 other genes within a core EMT signature, whose expression changes with changing chromatin accessibility. Knockdown of TRIM29 in HMECs followed by gene expression microarray revealed an effect on genes involved in epidermis development, differentiation, cell death, and inflammation.
▸ Investment of epigenetic regulator and mechanism during inflammation we investigated the role of epigenetic readers in the lipopolysaccharide (LPS)-induced immune responses in mouse primary astrocytes. We found that Brd2 is involved in the modulation of neuroinflammatory responses through PAI-1 and via the regulation of epigenetic reader BET protein,
▸ Targeting dysregulated epigenome component in cancer
- We found that the epigenetic reader BRD4 is a key mediator of the activated MYC-AP4 axis in epithelial and mesenchymal breast cancer cell lines, demonstrating that the BET protein inhibitor will be very effective against MYC-AP4 axis activated cancers and other diseases by targeting multiple points.
- We investigated the potential of BRD4 as a therapeutic target in liver malignancy. BRD4 was overexpressed in three different large cohort of hepatocellular carcinoma (HCC) patients as well as in liver cancer cell lines. BRD4 inhibition caused MYC-independent large-scale gene expression changes in liver cancer cells. Serial gene expression analyses with SK-Hep1 liver cancer cells treated with JQ1 to delineate the key player of BRD4 inhibition identified E2F2 as the first line of downstream direct target of BRD4.
(출처: Summary 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1목차 ... 2연구계획 요약문 ... 3연구결과 요약문 ... 4 국문요약문 ... 4 SUMMARY ... 5연구내용 및 결과 ... 6 1. 연구개발과제의 개요 ... 6 2. 국내외 기술개발 현황 ... 8 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 10 4. 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 21 5. 연구결과의 활용계획 ... 22 6. 연구과정에서 수집한 해외 과학기술정보 ... 22 7. 참고문헌 ... 23 8. 연구성과 ... 24 9. 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설‧장비 현황 ... 26 10. 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행실적 ... 26 11. 기타사항 ... 26끝페이지 ... 26