초록 ▼

요약: 암치료에서 치료 표적의 식별과 바이오마커의 중요성이 최근 크게 부각되고 있음. 그러나 실제 임상에서 바이오마커를 검출하기 위한 충분한 양의 조직 채취가 불가능한 경우가 많고, bulk tumor 내에는 이질적인 정상세포들이 혼합되어 주요 미세시그널을 회석시키는 문제가 있음. 본 연구 과제에서는 암환자에서 채취한 극소량의 검체에서 단일세포들을 분리, 단일세포별 바코드 태깅하는 기술을 개발하고, 분리된 단일세포 레벨에서 차세대 염기서열 분석법을 적용하여 표적치료와 진단의 표지자가 되는 바이오마커를 검출할 수 있는 기술 개발을 목

요약: 암치료에서 치료 표적의 식별과 바이오마커의 중요성이 최근 크게 부각되고 있음. 그러나 실제 임상에서 바이오마커를 검출하기 위한 충분한 양의 조직 채취가 불가능한 경우가 많고, bulk tumor 내에는 이질적인 정상세포들이 혼합되어 주요 미세시그널을 회석시키는 문제가 있음. 본 연구 과제에서는 암환자에서 채취한 극소량의 검체에서 단일세포들을 분리, 단일세포별 바코드 태깅하는 기술을 개발하고, 분리된 단일세포 레벨에서 차세대 염기서열 분석법을 적용하여 표적치료와 진단의 표지자가 되는 바이오마커를 검출할 수 있는 기술 개발을 목표로 함. 본 기술은 순환종양세포에서의 유전체 분석이 가능한 수준까지 끌어올리고 실제 유방암, 대장암, 폐암 환자를 대상으로 다양한 임상적 유용성을 검증함.

(출처 : 요약서 3p)

Abstract ▼

Contents and Results
1. Development of next-generation sequencing technology in circulating tumor cells(CTCs)
2. Comparison of biomarker profiles generated with next-generation sequencing of fine-needle aspiration, core needle biopsy, and bulk tumor specimens: implications in biomarker discove

Contents and Results
1. Development of next-generation sequencing technology in circulating tumor cells(CTCs)
2. Comparison of biomarker profiles generated with next-generation sequencing of fine-needle aspiration, core needle biopsy, and bulk tumor specimens: implications in biomarker discovery using single cell analysis

3. Differentiation of genomic profiles among single cells (tumor heterogeneity)
4. Comparison of biomarker profiling of primary cancer tissue, metastatic cancer tissue, and CTC
5. Implementation of single cell capture and analysis pipelines
6. Clinical application of the single cell analysis
7. Design of single cell capture device
8. High-throughput single-cell isolation with pulse laser
9. Spatial identification of genetic data

(출처 : SUMMARY 6p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 요 약 문 ... 4
• SUMMARY ... 6
• CONTENTS ... 7
• 목차 ... 8
• 제1장 연구개발과제의 개요 ... 10
• 제 1절. 연구개발 목표 ... 10
• 제 2절. 연구개발 필요성 ... 10
• 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 12
• 제 1절. 국외 기술개발 현황 ... 12
• 제 2절. 국내 기술개발 현황 ... 13
• 제3장 연구개발 수행 내용 및 결과 ... 14
• 제 1절. 양질의 유방암 생체시료 확보 ... 14
• 제 2절. 유방암 조직에서 단일세포 분리 후 NGS 분석 실험 (1, 2세부 공동) ... 14
• 제 3절. 세포흡인 생검 조직 (FNA) 을 이용한 체세포변이 분석의 유용성 입증 ... 15
• 제 4절. Single cell picking과 target sequencing을 이용한 CTC 입증 ... 17
• 제 5절. 단일세포 분석 인프라(파이프라인) 구축 ... 19
• 제 6절.암환자 단일세포 분석 ... 20
• 제 7절. 단일세포 및 핵산 분리 기술 개발 ... 26
• 제 8절. 단일 세포 분리 위한 셀 종류, 미세우물의 크기 및 깊이 최적화 ... 29
• 제 9절. 레이저를 이용한 단일세포 분리 시스템 ... 34
• 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 37
• 제 1절. 목표 달성도 ... 37
• 제 2절. 기술발전 기여도 ... 37
• 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 39
• 제 1절. 추가 연구 및 타 연구에의 활용 ... 39
• 제 2절. 연구개발결과 제품화 추진 방안 ... 41
• 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 43
• 제 1절. NGS 임상 적용 추진_관련 업계 분석 ... 43
• 제 2절. 단일세포 유전체 분석 논문 출판 건수 증가 ... 44
• 제 3절. 단일세포 분석 기술에 대한 해외 국가 연구비 투자 상황 ... 44
• 제7장 연구시설ㆍ장비 현황 ... 45
• 제8장 참고문헌 ... 47
• 끝페이지 ... 48