초록 ▼

• NGS QC에 대한 일관된 기준 제시 및 RNA-seq, WGS 샘플에 대한 파이프라인 확립 및 대장암 환자 RNA 시퀀싱 123샘플, WGS 119 샘플에 대한 NGS 시퀀싱 완료
• 대장암 환자의 종양조직 및 정상조직을 대상으로, 단일세포 기반 종양세포와 종양미세환경세포 프로파일링
• 단일세포 레벨에서 대장암 종양세포 특이적으로 비율이 올라가는 세포 타입 발굴 및 종양 세포의 특성 파악
• 종양 조직과 정상 조직을 구분하여 단일세포 수준에서 리간드 – 수용체 네트워크 구성. 종양 조직과 정상 조직이 서로 다른

• NGS QC에 대한 일관된 기준 제시 및 RNA-seq, WGS 샘플에 대한 파이프라인 확립 및 대장암 환자 RNA 시퀀싱 123샘플, WGS 119 샘플에 대한 NGS 시퀀싱 완료
• 대장암 환자의 종양조직 및 정상조직을 대상으로, 단일세포 기반 종양세포와 종양미세환경세포 프로파일링
• 단일세포 레벨에서 대장암 종양세포 특이적으로 비율이 올라가는 세포 타입 발굴 및 종양 세포의 특성 파악
• 종양 조직과 정상 조직을 구분하여 단일세포 수준에서 리간드 – 수용체 네트워크 구성. 종양 조직과 정상 조직이 서로 다른 네트워크중심축을 형성한다는 분석 결과를 도출
• 단일세포 전사체를 이용 대규모 데이터베이스 구축 및 분석 플랫폼을 연계한 웹사이트 구현

(출처 : 보고서 요약서 3p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 요약문 ... 4
• 목차 ... 5
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
• 1-1. 연구개발의 목적 ... 6
• 1-2. 연구개발의 범위 ... 6
• 1-3. 연구개발의 필요성 ... 7
• 2. 연구수행내용 및 성과 ... 12
• 2-1. 대장암 다중오믹스 데이터 생산 및 관리 현황 ... 12
• 2-2. 대장암 단일세포 전사체 데이터 분석을 위한 QC 및 알고리즘 확립 ... 20
• 2-3. 단일세포 수준 대장암 종양세포 및 종양미세환경세포 특성 프로파일링 ... 22
• 2-4. 단일세포 전사체 기반 대장암 특이적 네트워크 구성 ... 30
• 2-5. 단일세포 전사체 기반 바이오마커 발굴 ... 32
• 2-6. 희귀 대장암 유전체 분석 및 암환자의 cell free DNA 분석 ... 32
• 2-7. 단일세포 전사체 데이터베이스 구축 및 interative web page 구현 ... 32
• 2-8. 연구개발 결과의 성과 ... 35
• 3. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 37
• 3-1. 목표 ... 37
• 3-2. 목표 달성여부 ... 37
• 3-3. 목표 미달성 시 원인(사유) 및 차후대책(후속연구의 필요성 등) ... 38
• 4. 연구개발성과의 활용 계획 등 ... 39
• 붙임. 참고문헌 ... 40
• 끝페이지 ... 40