초록 ▼

◯ 연구의 필요성
- 주요 화훼작물인 국화 기초 및 응용 연구, 품종 육종을 원활히 수행할 수 있도록 유전체 정보 구축, 유전자원 수집 및 특성평가, 유전자지도 작성 등이 필요함

◯ 연구개발 결과
- 2배체 야생국화 산국을 유전체 해독소재로 선정
- 2세대, 3세대 염기서열 분석장비, HiC로 유전체 해독 및 조립하여 4.026Gbp, 10,765 scaffolds, N50 8.542Mbp 확보
- 전사체 분석으로 370,893 유전자 확보, 주석달기 수행
- 세포소기관 유전체 확보, 주석달기

◯ 연구의 필요성
- 주요 화훼작물인 국화 기초 및 응용 연구, 품종 육종을 원활히 수행할 수 있도록 유전체 정보 구축, 유전자원 수집 및 특성평가, 유전자지도 작성 등이 필요함

◯ 연구개발 결과
- 2배체 야생국화 산국을 유전체 해독소재로 선정
- 2세대, 3세대 염기서열 분석장비, HiC로 유전체 해독 및 조립하여 4.026Gbp, 10,765 scaffolds, N50 8.542Mbp 확보
- 전사체 분석으로 370,893 유전자 확보, 주석달기 수행
- 세포소기관 유전체 확보, 주석달기 수행, 근연관계 분석
- 산국 유전체 특성 규명 : 반복염기서열, whole genome duplication
- 국화속 유전자원 7종 29계통 수집 및 증식
- 국화속 유전자원 배수성 및 원예적 특성 조사, 교잡친화성 검정
- 국화 교잡분리집단 육성 및 원예적 특성 검정, 외부협동과제에 유전자 지도 작성을 위하여 공시재료로 제공, 향후 국화 형질유전연구를 위한 소재로 활용

(출처 : 보고서 요약서 3p)

Abstract ▼

Purpose&Contents
Chrysanthemum is an important ornamental plant. To support basic and applied research in Chrysanthemum species, genomic and genetic resources need to be obtained. This study aims to reveal genome sequences of a Chrysanthemum species, and to collect and characterize diverse Chrysa

Purpose&Contents
Chrysanthemum is an important ornamental plant. To support basic and applied research in Chrysanthemum species, genomic and genetic resources need to be obtained. This study aims to reveal genome sequences of a Chrysanthemum species, and to collect and characterize diverse Chrysanthemum species. Also, pseudo F₁ population is generated by interspecific crossing to construct linkage map and support genome assembly.

Results
Since genome sequencing and assembly is difficult in a cultivated and commercial species (Chrysanthemum morifolium) with hexaploidy and large genome, a diploid wild species (Chrysanthemum boreale) with smaller genome is chosen to obtain a reference genome for Chrysanthemum genus. K-mer frequency analysis estimates genome size of 2.947 Gbp and reveals repetitive and heterozygous nature of genome. Genome analysis using 2^nd and 3^rd generation sequencers and HiC technology generated 4.026Gbp of genome consisted of 10,765 scaffolds. A total of 370,893 transcripts are obtained by transcriptome sequencing and annotation. In addition, 7 species and 29 germplasms are collected, propagated and characterized.
After ploidy analysis, diploid species are crossed to construct pseudo F₁ population. Population is used to construct linkage map by other research group.

Expected Contribution
Chrysanthemum genome and genetic materials such as germplasms and population are utilized to facilitate diverse research and application. Particularly, they serve as a fundamental resource to construct a platform for chrysanthemum molecular breeding.

(출처 : Summary 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 국 문 요 약 문 ... 4
• Summary ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 연구 개발 과제의 개요 ... 7
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 9
• 제 3 장 연구 수행 내용 및 결과 ... 11
• 제1세부과제 : 국화 구조유전체 해독 및 정보분석 ... 11
• 제1협동과제 : 국화 유전체 해독소재 특성분석 및 집단구축 ... 39
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 55
• 제 5 장 연구 결과의 활용 계획 ... 59
• 제 6 장 연구 과정에서 수집한 해외 과학 기술 정보 ... 60
• 제 7 장 연구 개발 결과의 보안 등급 ... 61
• 제 8 장 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 62
• 제 9 장 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행실적 ... 63
• 제 10 장 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 64
• 제 11 장 기타사항 ... 65
• 제 12 장 참고문헌 ... 68
• 끝페이지 ... 71