초록 ▼

○ 핵형분석과 아울러 Illumina와 Pacbio로 2배체 들깨 유전체 염기서열의 대량생산하여 Pacbio contig를 기반으로 Illumina mate pair로 2802개 contig로 구성된 scaffold를 확보하였음. 이중 2098개 contig가 10개의 Hi-C 분석으로 분리와 교정되어 크기는 약 638.7Mb였음
○ F2 교배집단의 GBS 데이터에 다양한 유전지도 작성 프로그램을 적용하여 10개의 연관군을 형성함
○ 총 10개의 pseudomolecule 수준의 연관그룹에 대해 BLAST2GO와 BUSC

○ 핵형분석과 아울러 Illumina와 Pacbio로 2배체 들깨 유전체 염기서열의 대량생산하여 Pacbio contig를 기반으로 Illumina mate pair로 2802개 contig로 구성된 scaffold를 확보하였음. 이중 2098개 contig가 10개의 Hi-C 분석으로 분리와 교정되어 크기는 약 638.7Mb였음
○ F2 교배집단의 GBS 데이터에 다양한 유전지도 작성 프로그램을 적용하여 10개의 연관군을 형성함
○ 총 10개의 pseudomolecule 수준의 연관그룹에 대해 BLAST2GO와 BUSCO분석으로 조립 수준 확인한 후, 총 32,67개 유전자를 예측함
○ 들깨 전사체 어셈블리 서열유사성을 통하여 MCscan을 이용한 유전체내 duplication 확인하였으며, 근연종으로 참깨와 대표적인 유지작물의 콩의 orthologous gene을 통하여 synteny 분석을 하였음
○ 12개 RNAseq 데이터를 이용한 어셈블리 서열 중에서 지방산생합성 경로의 유전자군 56개와 FAD gene family 18개의 잎, 꽃, 종자성숙단계의 발현양상 및 유전체내 copy number 확인함

(출처 : 보고서 요약서 4p)

Abstract ▼

Purpose&Contents
○ De novo genome sequencing of diploid Perilla

Results
○ Generation of de novo genome sequence using NGS
○ Analysis of genome structure by both assembly and annotation
○ Comparative genome analysis and construction of bioinformatic DB

Expected Contribution

Purpose&Contents
○ De novo genome sequencing of diploid Perilla

Results
○ Generation of de novo genome sequence using NGS
○ Analysis of genome structure by both assembly and annotation
○ Comparative genome analysis and construction of bioinformatic DB

Expected Contribution
○ Obtaining de novo genome sequence of perilla
○ Development of both useful molecular markers and genes by comparative genome analysis
○ Establishment of reference genome basis for molecular breeding perilla with high quality
○ Increasing utilization through linking studies with related researchers

(출처 : Summary 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 4
• 국 문 요 약 문 ... 5
• Summary ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 연구 개발 과제의 개요 ... 7
• 제1절 연구 개발 목적 ... 7
• 제2절 연구 개발의 필요성 ... 7
• 제3절 연구 개발 범위 ... 7
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 7
• 제1절 국내 기술 수준 및 시장 현황 ... 7
• 제2절 국외 기술 수준 및 시장 현황 ... 8
• 제 3 장 연구 수행 내용 및 결과 ... 9
• 제1절 연구수행 내용 ... 9
• 제2절 주요 결과 ... 9
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 93
• 제1절 목표대비 달성도 ... 93
• 제2절 정량적 성과(논문게재, 특허출원, 기타)를 기술 ... 95
• 제 5 장 연구 결과의 활용 계획 ... 95
• 제 6 장 연구 과정에서 수집한 해외 과학 기술 정보 ... 95
• 제 7 장 연구 개발 결과의 보안 등급 ... 95
• 제 8 장 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 95
• 제 9 장 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행실적 ... 96
• 제 10 장 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 96
• 제 11 장 기타사항 ... 98
• 제 12 장 참고문헌 ... 98
• 끝페이지 ... 100