초록

무 표준유전체 Rs2.0를 작성하고 정보 활용 인터페이스를 구축하여 유전체 완성도와 활용도를 높임. 무 유전지도와 물리지도의 해상도를 향상했으며 유전·다양성 집단을 육성하고 유전분석을 수행함. 유전체 정보를 이용하여 육종에 활용할 수 있는 대량의 분자표지를 확보함.

(출처 : 보고서 요약서 3p)

Abstract ▼

Purpose&Contents
○ To improve the radish genome assembly into Rs2.0 and to update relevant information
○ To upgrade genome assembly and SNP mapping algorithm
○ To develop an information interface for genome-based breeding
○ To increase resolution of genetic and physical maps
○ To coll

Purpose&Contents
○ To improve the radish genome assembly into Rs2.0 and to update relevant information
○ To upgrade genome assembly and SNP mapping algorithm
○ To develop an information interface for genome-based breeding
○ To increase resolution of genetic and physical maps
○ To collect radish accessions based on genetic diversity
○ To exploit candidates of molecular markers
○ To establish a set of radish core collection

Results
○ The radish genome (Rs1.0) was sequenced and assembled into 426.2 Mb spanning >98% of the gene space, of which 344.0 Mb were integrated into nine chromosome pseudomolecules

○ Approximately 36% of the genome was repetitive sequences and 46,514 protein-coding genes were predicted and annotated

○ Comparative mapping of the tPCK-like ancestral genome revealed that the radish genome has intermediate characteristics between the Brassica A/C and B genomes in the triplicated segments, suggesting an internal origin from the genus Brassica

○ The evolutionary characteristics shared between radish and other Brassica species provided genomic evidences that the current form of 9 chromosomes in radish was rearranged from 12 chromosomes of hexaploid progenitor

○ A total of 786,789 molecular markers (772,678 SNPs, 1,039 InDels, and 13,072 SSR markers) were developed and 700 SNP markers were finally selected for high throughput genetic analysis

○ Gap filling and additional assembly of the radish genome resulted in development of Rs2.0 which covers 437.1 Mb and 49,217 protein-coding genes

○ A total of 2,316 radish accessions were collected from three radish germplasm banks, the RDA in Korea, the NARO in Japan, and the IPK in Germany

○ A radish core collection consisting of 125 accessions, corresponding to 14.1% of the non-redundant whole collection, were assembled

Expected Contribution
○ Establishment of genetic and genomic resources for basic and applied researches of radish
○ Contribution to identification of agronomic trait-related genes
○ Development of high throughput molecular marker tools for marker- or genome-assisted breeding

(출처 : Summary 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 국 문 요 약 문 ... 4
• Summary ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 연구 개발 과제의 개요 ... 7
• 제1절 연구 개발 목적 ... 7
• 제2절 연구 개발의 필요성 ... 7
• 제3절 연구 개발 범위 ... 11
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 13
• 제1절 국내 기술 수준 및 시장 현황 ... 13
• 제2절 국외 기술 수준 및 시장 현황 ... 14
• 제3절 국내외 연구현황 ... 15
• 제 3 장 연구 수행 내용 및 결과 ... 16
• 제1절 1세부과제: 무의 표준유전체 정밀화 및 유전체 활용 인터페이스 구축 ... 16
• 제2절 1협동과제: 무의 초고밀도 유전지도 작성 및 유전·다양성집단 육성 ... 52
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 94
• 제1절 목표대비 달성도 ... 94
• 제2절 정량적 성과(논문게재, 특허출원, 기타) ... 94
• 제3절 연구성과의 활용·확산 목표 및 달성도 ... 95
• 제 5 장 연구 결과의 활용 계획 ... 96
• 제 6 장 연구 과정에서 수집한 해외 과학 기술 정보 ... 97
• 제 7 장 연구 개발 결과의 보안 등급 ... 98
• 제 8 장 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 99
• 제 9 장 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행실적 ... 100
• 제1절 연구실 안전조치 이행 ... 100
• 제2절 LMO 연구시설 및 수입신고 현황 ... 101
• 제 10 장 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 102
• 제 11 장 기타사항 ... 103
• 제 12 장 참고문헌 ... 104
• 끝페이지 ... 105