초록 ▼

1. 고추 세 종의 유전체 구축 및 고도화
- 기존 유전체를 정밀화했고 두 종의 고추 유전체를 새로 생성
2. 고추의 종 분화 시점 및 유전체 비교
- 고추 세 종의 분화 시점은 약 1~2백만 년 전 사이에 일어났음
- 유전체 구조분석 결과 염색체 3, 5, 9번에서 rearrangement가 일어남
3. 유전자와 반복서열의 진화패턴
- 고추분화가 일어났던 시점에 유전자와 반복서열의 진화가 발생함
- 특히 NB-LRR 병 저항성 유전자가 C. baccatum에서 많이 증가함
4. Retro

1. 고추 세 종의 유전체 구축 및 고도화
- 기존 유전체를 정밀화했고 두 종의 고추 유전체를 새로 생성
2. 고추의 종 분화 시점 및 유전체 비교
- 고추 세 종의 분화 시점은 약 1~2백만 년 전 사이에 일어났음
- 유전체 구조분석 결과 염색체 3, 5, 9번에서 rearrangement가 일어남
3. 유전자와 반복서열의 진화패턴
- 고추분화가 일어났던 시점에 유전자와 반복서열의 진화가 발생함
- 특히 NB-LRR 병 저항성 유전자가 C. baccatum에서 많이 증가함
4. Retroduplication에 의한 병저항성 유전자의 생성 기작
- 고추의 병저항성 유전자들과 주변의 반복서열을 분석한 결과 retoduplication에 의해 유전자들의 폭발적으로 증가함
- 기능이 알려진 병 저항성 유전자 L과 R3a의 진화기작을 설명함

( 출처: 보고서 요약서 3p )

Abstract ▼

□ Purpose&Contents
1) Enhancement of standard genome data in pepper
- Improvement of contig sequence, refinement of scaffold and psuedomolecule, and gene re-annotation and manual analysis in pepper standard-genome data
2) Construction of multiple standard genome
- Creation of NGS data, a

□ Purpose&Contents
1) Enhancement of standard genome data in pepper
- Improvement of contig sequence, refinement of scaffold and psuedomolecule, and gene re-annotation and manual analysis in pepper standard-genome data
2) Construction of multiple standard genome
- Creation of NGS data, assembly, and annotation for multiple standard genome
3) Speciation analysis of Capsicum plant by comparative study between different pepper genome data
- Evolutional analysis of gene including NBLRR super gene family and repeated sequence

□ Results
- Establishment of useful data including improved standard genome data and two of new genome data from different pepper
- Evolutional clues about the time point of speciation between three different pepper before 1~2 million years and rearrangement especially on chromosome 3, 5 and 9
- Evolutional pattern of gene and repeated sequence that occurred at the time point of speciation and specially NB-LRR family growing rapidly in C. baccatum
- Retroduplication affecting explosive increase of disease resistant gene and elucidating evolutional mechanism about resistant gene including L and R3a gene already known these functions

□ Expected Contribution
- Technology with the completion of multiple pepper genome leading the world in pepper research
- Establishment of a basis for the development of genome-assisted breeding technology in pepper through standard multi-genome construction for GWAS
- Establishment of advanced breeding technologies such as genetic map-based gene isolation, QTL separation, and association mapping for finding important traits such as resistance
- Expansion of market share with technological competitiveness in the world market of pepper seeds

( 출처: SUMMARY 5p )

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 국 문 요 약 문 ... 4
• Summary ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 연구 개발 과제의 개요 ... 7
• 제1절 연구 개발 목적 ... 7
• 제2절 연구 개발의 필요성 ... 8
• 제3절 연구 개발 범위 ... 9
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 10
• 제 3 장 연구 수행 내용 및 결과 ... 14
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 36
• 제1절 : 목표대비 달성도 ... 36
• 제2절 : 정량적 성과(논문게재, ... 37
• 제3절 : 연구성과의 활용·확산 목표 및 달성도를 기술 ... 38
• 제 5 장 연구 결과의 활용 계획 ... 39
• 제 6 장 연구 과정에서 수집한 해외 과학 기술 정보 ... 40
• 제 7 장 연구 개발 결과의 보안 등급 ... 40
• 제 8 장 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 40
• 제 9 장 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행실적 ... 41
• 제 10 장 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 42
• 제 11 장 기타사항 ... 42
• 제 12 장 참고문헌 ... 43
• 끝페이지 ... 44