초록 ▼

항생제 내성 균주들이 점차 기하급수적으로 많아지고 있으며 이에 대한 항생제 사용량은 감소 추세이지만, 항생제 내성률은 여전히 높아 항생제 내성 감소를 위한 체계적인 관리가 필요하다. 따라서 주요 관리 대상인 항생제 내성균의 유전적 특성을 연구하기 위한 신속분석법을 개발하고 효율적인 항생제 내성 유전자 분석을 위한 실험 가이드를 마련하고자 한다. 항생제내성 균주를 검출하기 위한 Database를 구축하기 위해, 공개된 항생제 내성 유전자 데이터베이스인 CARD, Lahey database를 통합시켰다. 이후 문헌고찰을 통해 최종 항생

항생제 내성 균주들이 점차 기하급수적으로 많아지고 있으며 이에 대한 항생제 사용량은 감소 추세이지만, 항생제 내성률은 여전히 높아 항생제 내성 감소를 위한 체계적인 관리가 필요하다. 따라서 주요 관리 대상인 항생제 내성균의 유전적 특성을 연구하기 위한 신속분석법을 개발하고 효율적인 항생제 내성 유전자 분석을 위한 실험 가이드를 마련하고자 한다. 항생제내성 균주를 검출하기 위한 Database를 구축하기 위해, 공개된 항생제 내성 유전자 데이터베이스인 CARD, Lahey database를 통합시켰다. 이후 문헌고찰을 통해 최종 항생제 내성 유전자 데이터베이스를 구축 및 업데이트하였다. 만들어진 데이터베이스를 이용하여 전장 유전체염기서열 분석을 수행하였으며 이를 통해 구축된 데이터베이스의 실효성을 확인하였다. 전장유전체 염기서열 분석을 통해 ESBL 계열 항생제 내성 유전자와 메치실린과 밴코마이신, 시플로플록사신과 같은 2차 항생제에 내성을 가지는 다제내성 유전자들을 그룹화 하였으며, 그룹화된 유전자들의 보존된 염기서열을 기준으로 검출 프라이머를 디자인하였다. 개발된 검사법을 이용하여 실제 균주에 적용 실험함으로서 실효성을 확인하였다. ESBL계열 내성 유전자들을 검출할 수 있는 검사법을 개발하였다. 해당 검사법은 19쌍의 다자인된 프라이머로 총1,650개의 ESBL계열 내성 유전자들을 검출할 수 있다. 또한 메치실린, 밴코마이신 그리고 시플로플록사신에 저항성을 가지는 유전자의 경우, 27쌍의 디자인된 프라이머로 총 249개의 다제내성 유전자들을 검출할 수 있다. 개발된 검사법으로 단일염기 다형성으로 내성을 가지는 시플로플록사신 저항성 균주들을 검출할 수 있다.

(출처 : 국문 요약문 6p)

Abstract ▼

Antibiotic resistant strains are increasing exponentially and antibiotic usage is declining, but antibiotic resistance rate is still high, so systematic management is needed to reduce antibiotic resistance. Therefore, we will develop a rapid method for studying the genetic characteristics of antibio

Antibiotic resistant strains are increasing exponentially and antibiotic usage is declining, but antibiotic resistance rate is still high, so systematic management is needed to reduce antibiotic resistance. Therefore, we will develop a rapid method for studying the genetic characteristics of antibiotic resistant bacteria, which are the main subjects of management, and provide an experimental guide for efficient antibiotic resistance gene analysis. In order to construct a database for detecting antibiotic resistant strains, CARD, a published antibiotic resistance gene database, and Lahey database were integrated. After reviewing the literature, we constructed and updated the final antibiotic resistance gene database. Sequence analysis of the full - length genome sequence was performed using the prepared database and the database was confirmed to be effective. Multi-resistant genes resistant to ESBL antibiotic resistance genes and resistance to secondary antibiotics such as methicillin and vancomycin and siflofloxacin were grouped through full-length genome sequencing analysis, and the conserved sequences of the grouped genes As a detection primer. The effectiveness of the method was verified by applying the method to the actual strain. The rapid method was developed to detect ESBL resistance genes. The rapid method is capable of detecting a total of 1,650 ESBL-resistant genes with 19 pairs of congruent primers. In the case of genes resistant to methicillin, vancomycin and siprofloxacin, a total of 249 multidrug resistance genes can be detected with 27 pairs of designed primers. The developed method can detect siphflocoxa resistant strains resistant to single nucleotide polymorphism.

(출처 : SUMMARY 8p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 용역연구개발과제 최종보고서 ... 2
• 제 출 문 ... 3
• 목차 ... 4
• Ⅰ. 총괄연구개발과제 요약문 ... 6
• 국문 요약문 ... 6
• Summary ... 8
• Ⅱ. 총괄연구개발과제 연구결과 ... 10
• 제1장 총괄연구개발과제의 목적 및 필요성 ... 10
• 제2장 총괄연구개발과제의 내용 및 방법 ... 15
• 제3장 총괄연구개발과제의 최종결과 및 고찰 ... 185
• 제4장 총괄연구개발과제의 연구성과 ... 190
• 제5장 총괄주요연구 변경사항 ... 192
• 제6장 총괄참고문헌 ... 193
• 제7장 총괄첨부서류 ... 194
• 끝페이지 ... 195