초록 ▼

본 과제의 목표는 암 환자의 종양조직의 후성유전체 및 전사체 기반의 면역 프로파일링을 통하여 면역 항암 치료제 반응 예측과 해당 치료제에 대한 내성발생 기전을 규명의 기반 데이터를 제공하고자 하는데 있음.

1. 항암면역 치료 받은 폐암 환자의 조직 샘플 코호트 구축과 후성유전체 데이터 생산과 반응군에서 차이를 보이는 후성유전체 후보군 도출
- 항암면역 치료를 받은 50명의 환자 조직에서 DNA 분리/저장, 임상데이터 베이스 구축 (성별/나이/ 암종/ 병리학적 타입/ 항암면역치료 반응)
- 분리된 DNA로 EP

본 과제의 목표는 암 환자의 종양조직의 후성유전체 및 전사체 기반의 면역 프로파일링을 통하여 면역 항암 치료제 반응 예측과 해당 치료제에 대한 내성발생 기전을 규명의 기반 데이터를 제공하고자 하는데 있음.

1. 항암면역 치료 받은 폐암 환자의 조직 샘플 코호트 구축과 후성유전체 데이터 생산과 반응군에서 차이를 보이는 후성유전체 후보군 도출
- 항암면역 치료를 받은 50명의 환자 조직에서 DNA 분리/저장, 임상데이터 베이스 구축 (성별/나이/ 암종/ 병리학적 타입/ 항암면역치료 반응)
- 분리된 DNA로 EPIC array 850k platform 으로 후성유전체 데이터 생산
- 생산된 후성유전체 분석을 통하여 반응군에서 차이를 보이는 후성유전체 후보군 도출

2. 폐암 수술시 절제한 종양조직, 혈액 샘플 코호트 구축
- 수술 검체의 종양 조직 및 이로부터 분리한 종양침윤 면역세포의 후성유전체 및 전사체 조사를 위한 DNA 및 RNA 샘플 분리 및 저장 (50례)
- 분리된 DNA로 EPIC array 850K platform으로 후성유전체 데이터 (50례) 분리된 RNA로 RNAseq 데이터 생산 (50례)
- 총 100례의 데이터 생산.

3. 두경부암 수술시 절제한 종양조직 임상데이터 코호트 구출
- 수술 검체의 종양 조직 및 이로부터 분리한 종양침윤 면역세포의 전사체 조사를 위한 RNA 샘플 분리 및 저장 (50례)
- 분리된 RNA 로 RNAseq 데이터 생산 (50례)

4. 두경부암에서 생산된 RNAseq 전사체 데이터 분석을 통하여 두경부암의 면역 프로파일링 진행
- 두경부암에서 HPV 와 연관이 있는 구인두암 환자에서 HPV 양성/ 음성의 임상적 변수와 분석을 하여 HPV 양성인 군에서 면역관련 경로 유전자가 집중되어 있음을 관찰함.
- 이를 XCELL을 이용한 deconvolution을 이용하여 실제 면역세포에 대한 분석을 진행하여 두경부암 HPV 양성 환자에서의 immune signature를 발굴함.

5. 폐암 혹은 두경부암 조직과 혈액을 이용하여 다양한 면역체크포인트, 면역조절 물질과 면역세포 침윤 분석
- 폐암, 두경부암 조직과 혈액을 이용하여 다양한 면역체크포인트, 면역조절 물질과 면역세포 침윤 분석 (10례)

(출처 : 보고서 요약서 3p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 요약문 ... 5
• 목차 ... 6
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
• 2. 연구수행내용 및 성과 ... 17
• 1. 면역항암제 사용한 폐암 환자의 코호트 구축, 후성 유전체 데이터 확보 ... 18
• 2. 면역항암제 사용한 폐암 환자에서 반응군과 비반응군의 차이나는 후성유전체 후보군 도출 ... 20
• 3. 폐암 환자의 수술시 절제된 종양조직 임상코호트 구축과 후성유전체, 전사체 데이터 확보 ... 23
• 4. 두경부암 환자의 수술시 절제된 종양조직 임상코호트 구축과 전사체 데이터 확보 ... 24
• 5. 두경부암 환자의 수술시 절제된 종양조직 전사체 데이터 분석을 통한 immune signature 분석 ... 25
• 6. 면역 항암제 사용환자의 혈액 샘플 임상 코호트 구축 ... 27
• 7. 폐암/ 두경부암 환자의 수술 절제한 종양 미세환경에서 면역세포 프로파일 분석 ... 27
• 3. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 27
• 4. 연구개발성과의 활용 계획 등 ... 31
• 끝페이지 ... 33