초록 ▼

□ 연구개요
혈중에는 감염증이 없더라도 미생물(박테리아)가 존재함을 WGS 인간참조염기서열에 unmapped reads의 분석과 16S rRNA amplicon의 metataxa 분석과 분류결과를 통해 입증하며, 대사적 정상인에도 미량 존재하는 혈중 미생물은, 만성염증을 배경으로 하는 대표적 만성질환으로서 비만 성인에서도 혈중 미생물(박테리아)의 기여에 대해 검증함
혈중 미생물의 검출 방법으로 혈액DNA 로부터 16S rRNA v3-v4 지역 amplicon의 NGS 분석 및 의 종 분류, 분포 분석(16S metatax

□ 연구개요
혈중에는 감염증이 없더라도 미생물(박테리아)가 존재함을 WGS 인간참조염기서열에 unmapped reads의 분석과 16S rRNA amplicon의 metataxa 분석과 분류결과를 통해 입증하며, 대사적 정상인에도 미량 존재하는 혈중 미생물은, 만성염증을 배경으로 하는 대표적 만성질환으로서 비만 성인에서도 혈중 미생물(박테리아)의 기여에 대해 검증함
혈중 미생물의 검출 방법으로 혈액DNA 로부터 16S rRNA v3-v4 지역 amplicon의 NGS 분석 및 의 종 분류, 분포 분석(16S metataxa 분석) 및 혈액의 WGS를 박테리아 종분류 (Phylogenetic)분석하였음

□ 연구 목표대비 연구결과
인간 참조서열 GRCh38에 unmapped read를 추출하고, 이를 새로 구성한 박테리아 참조DB로부터 각 개인별 혈중 박테리아 조성을 분석하는 파이프라인을 새로이 정립하였고,
5가족 37명에서의 혈액내 박테리아는 사람 diploid 당 약 0.8개 대장균에 해당하는 양으로 극 미량이 존재하였으며, 그 조성은 문(phyla)수준에서는 Proteobacteria, 강(class)수준에서는 gamma, beta proteobacteria등의 조성으로 16S metataxa 조성과 유사하였고,
전체박테리아(eubacteria) proteobacteria의 qPCR결과의 조성과 모두 유사하여 재현성이 있음.
혈중에는 감염증이 없더라도 미생물(박테리아)가 존재함을 아래의 각 방법 간의 합치성을 통해 입증 하였음
WGS 인간참조염기서열에 unmappable reads의 분석법의 신뢰성이 가장 높은 것을 고려하여 연구결과의 요약은 성별 및 체질량지수에 변동과는 상관성이 낮았으며, 만성질환으로서 비만(노화)에서의 혈중 박테리아의 변동 분석 결과 비만 보다는 노화에서 연관성이 높은 결과를 보이며, 노화와 상관성으로는 균의 양은 많아질 수 있으나 다양성이 떨어짐.

□ 연구개발결과의 중요성
만성질환의 Proteobactria의 계통 및 수의 증가는, 강력한 염증유발인자인 내독소(endotoxin,LPS)의 공급원임을 설명할 수 있으며, 만성염증성 질환의 종류별로 병인으로서 조직 내에 어떤 미생물(박테리아) 종이 공통적-혹은 차별적으로 존재 및, 질환마다 차별적으로 존재하는 박테리아의 차별적 염증 기전의 규명을 통해, 특정 박테리아의 제어를 통해 만성질환의 조절이 가능함을 시사함
만성질환 유발기전으로서 혈중에서의 지속적인 저강도 박테리아의 부하의 핵심요인으로서의 노화현상이 Proteobactria의 계통 및 수의 증가에서 기안함을 시사함

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구수행내용 및 연구결과 ... 5
• (가) 인간 참조유전체에 맵핑되지 않은 WGS 염기서열 분석을 통한 혈중 미생물 존재에 대한 연구 ... 5
• (나) 혈액DNA 로부터 16S rRNA amplicon의 metataxa 분석을 통한 박테리아 및 내독소(endotoxin)을 제공하는 전체 박테리아(eubacteria) 및 proteobacteria의 존재의 입증 ... 7
• (다) Quantitative PCR로 혈액 내 세균의 정량적 측정 ... 7
• 3. 연구개발결과의 중요성 ... 8
• 4. 참고문헌 ... 8
• 5. 연구성과 ... 9
• 끝페이지 ... 9