초록 ▼

□ 연구개요
○ Alternative splicing event (ASE)는 인간 전사체의 다양성을 부여하는 필수 기작임. 기본적으로 Exon의 inclusion/exclusion을 변화시켜 단백질 도메인의 상실을 야기하기도 하고 stop codon의 위치를 바꿔 nonsense mediated decay (NMD)를 유도 단백질 기능을 상실시키는 것에 대한 연구가 주로 이루어짐.
○ 그러한 ASE가 암에서 발생해 유전자 기능을 변형시키는 일은 자명함에도 불구하고 ASE 연구는 유전체 발현을 활용한 정략적, 수학적 분석기

□ 연구개요
○ Alternative splicing event (ASE)는 인간 전사체의 다양성을 부여하는 필수 기작임. 기본적으로 Exon의 inclusion/exclusion을 변화시켜 단백질 도메인의 상실을 야기하기도 하고 stop codon의 위치를 바꿔 nonsense mediated decay (NMD)를 유도 단백질 기능을 상실시키는 것에 대한 연구가 주로 이루어짐.
○ 그러한 ASE가 암에서 발생해 유전자 기능을 변형시키는 일은 자명함에도 불구하고 ASE 연구는 유전체 발현을 활용한 정략적, 수학적 분석기법에 주로 초점을 두고 있음. 즉 ASE가 일어나는 지역에 대한 정확한 expression quantification을 추정해 exon inclusion/exclusion을 계산하는 연구가 주임. 그러나 수학적으로 분석한 수백 수천의 ASE들 중 어떠한 것이 정말 기능적으로 유의한 ASE인지 객관적으로 분석하는 알고리즘이 전무함.
○ 본 연구는 암유전체의 ASE 분석을 위해 NGS 데이터와 유전자 네트워크의 융합 연구를 진행할 계획임. ASE로 인해 유전자 기능이 변환되는 것을 분석하는데 초점을 맞춰 Pathway레벨 및 유전자 상호작용 네트워크에서 이를 검증하고자 함. 이 분석 기법의 개발로 인해ASE 연구자들이 실제 생물학적 기능에 중요한 ASE를 객관적으로 분석 · 선택하는데 도움이 될 것임. 또한 암 전사체 데이터를 이용해 분석함으로써 암 바이오마커 발굴에 이바지하고자함.

□ 연구 목표대비 연구결과
○ 연구 목표
- 인간 유전체의 ASE 영역을 분석하고 관련 멀티오믹스 정보를 수집해 ASE의 관련 유전체 특징을 파악.
- 다양한 암전사체 임상정보 파악 및 전사체 데이터를 활용한 ASE 분석.
- 암전사체 데이터로부터 ASE 와 기능 관계 분석.

○ 연구 결과
- ASE 영역의 멀티오믹스 염기서열 분석을 통한 데이터베이스 구축. 개발 데이터와 차세대 염기서열 분석 시스템과의 연동 기능을 통한 분석 확장성 확보. 연구 목표와 정확히 일치하는 내용의 결과물 산출함.
- 본 연구 결과는 Nucleic Acids Research 2018 (IF 11.147)에 개체함.
- 암 전사체 데이터 분석 수행을 통한 ASE와 pathway 와의 관련성 분석 및 알고리즘 개발이 진행중임. 해당 항목의 연구내용을 완벽하게 수행하기에 연구기간이 짧고 영속성이 필요하므로 연구 내용을 확장해 중견연구자 지원 사업에 이어서 확장된 연구 내용을 개발 중임.

□ 연구개발결과의 중요성
- 본 연구는 생명현상의 근간을 이루는 ASE 분석중 서열 분석과 관련 데이터베이스 구축을 집중적으로 수행하고 있음. 국내 생물정보학 연구진 중 ASE를 전문적으로 연구하는 팀이 미비하며 본 과제를 통해 전사체 분석 관련 과학기술 확보를 통해 개인 및 국가차원의 학술적 역량을 확보할 수 있음.
- 이공계개인기초 사업을 통해 ASE 연구의 발판을 마련할 수 있었으며 이를 확장한 내용으로 중견연구자지원사업에서 영속성을 가지는 연구를 수행 관련 결과 논문투고를 앞두고 있음.
현재 전사체 분석 기반의 ASE 분석 알고리즘 개발 연구를 진행 중임.

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 3
• 2. 연구수행내용 및 연구결과 ... 4
• 3. 연구개발결과의 중요성 ... 4
• 4. 참고문헌 ... 4
• 5. 연구성과 ... 5
• 끝페이지 ... 5