초록 ▼

□ 연구개요
본 연구는 접근이 용이한 대량의 종양 조직 전사체 데이터를 활용하여 종양조직 및 면역세포의 조성을 추정하는 deconvolution 을 a)기존에 사용하는 정상인의 말초혈핵단핵세포에서 기인한 참조데이터 대신 암세포 및 암 주변의 환경에 따라 변화한 면역세포의 단일세포의 전사체 프로파일을 참조데이터로 하여 암세포 및 주변세포를 정확히 대번하는 데이터를 만들고 b)검정대상의 조직 전사체 와 참조데이터로 쓰이는 단일세포 전사체 데이터의 기술적인 차이에서 오는 충돌을 고려한 알고리즘의 개발로 그 정확성을 높이고자 하였다.

□ 연구개요
본 연구는 접근이 용이한 대량의 종양 조직 전사체 데이터를 활용하여 종양조직 및 면역세포의 조성을 추정하는 deconvolution 을 a)기존에 사용하는 정상인의 말초혈핵단핵세포에서 기인한 참조데이터 대신 암세포 및 암 주변의 환경에 따라 변화한 면역세포의 단일세포의 전사체 프로파일을 참조데이터로 하여 암세포 및 주변세포를 정확히 대번하는 데이터를 만들고 b)검정대상의 조직 전사체 와 참조데이터로 쓰이는 단일세포 전사체 데이터의 기술적인 차이에서 오는 충돌을 고려한 알고리즘의 개발로 그 정확성을 높이고자 하였다. 본 연구를 통한 deconvolution 알고리즘의 개선은 전사체 뿐만이 아닌 다른 후성유전체 데이터에서의 활용가능성을 재고 할 것이다.

□ 연구 목표대비 연구결과
1차년도에 목표하였던 유방암 단일세포데이터를 이용한 참조데이터 제작은, 그 연구를 성실히 수행한결과 제작 파이프라인을 확립하였고 그 파이프라인을 이용, 단일세포의 기본분석과정을 거쳐 유방암 특이적인 암세포 및 5종 가량의 주변 면역세포의 세포특이적 유전자발현 참조데이터를 제작하였다. 하지만 이의 검정과정에서 참조데이터가 세포특이적인 성질이 아닌 세포가 유래한 환자특이적인 성질을 띄는 것으로 확인이 되어, 즉 세포종을 대변하지 못하는 데이터로 판단되어 이후 deconvolution 알고리즘에의 이용으로 이어지지 못하였다. 목표한 바는 아니지만 암세포의 조성이 대부분인 유방암 데이터의 특징을 활용하여 암세포의 이질성 형성에 영향을 주는 요인을 단일세포의 클러스터링 및 궤도분석을 통하여 심층적으로 조사하여 성과를 내었다.
2차년도에는 참조데이터 제작의 범위를 다른암종으로 확장하고자 하였고 이 목표는 대장암, 폐암, 다발성 골수종을 통하여 이루고자 하였다. 하지만 환자특이적인 성질을 완전히 배제할 수 없다고 판단하여 변이에 안정적인 대장암 단일세포 메틸레이션 데이터를 이용 세포특이적인 메틸레이션 참조데이터를 얻는데 성공하였고 활용가능성의 검정도 확인하였다. 하지만 연구의 중단으로 인하여 마지막 목표였던 단일세포
-조직세포 전사체의 기술적인 충돌을 고려한 deconvolution 알고리즘의 개발은 착수하지 못하였다.

□ 연구개발결과의
중요성
본 연구를 통하여 개선된 deconvolution 파이프라인 및 알고리즘을 통해 종양세포 및 면역세포 특이적인 유전체정보를 더 정확히 구분할 수 있고 이는 향후 연구자로 하여금 환자의 발병예후, 면역 및 약물반응에 대한 정확한 예측 하는데 중요한 자료로 쓰일 것이다. 또한 본 연구를 통해 개선된 알고리즘은, 기본분석에만 국한된 조직전사체 데이터를 deconvolution 에 활용함으로서 새로운 연구방안을 제시할 수 있고 기존에축적된 데이터의 가치와 활용성을 높여줄 것이다.
마지막으로 본 연구를 통혀 확립된 참조데이터 제작 파이프라인은 유전체 및 전사체 데이터 뿐만 아니라 암의 임상정보와 깊게 연관이 있는 메틸레이션 데이터에까지 적용되어 암유전체학의 성과를 높임과 더불어 맟춤형 진단 및 치료연구의 개선에도 기대해 볼 수 있을 것이다.

(출처 : 연구결과 요약문 3p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• A. 본 연구의 필요성 ... 4
• B. 연구목표 ... 4
• C. 연구범위 ... 4
• 2. 연구수행내용 및 연구결과 ... 4
• A. 1차년도 연구 목표 및 결과 ... 4
• B. 2차년도 연구 목표 및 결과 ... 6
• 3. 연구개발결과의 중요성 ... 8
• 4. 참고문헌 ... 8
• 5. 연구성과 ... 9
• 끝페이지 ... 9