보고서 정보
주관연구기관 |
농림축산검역본부 Animal and Plant Quarantine Agency |
연구책임자 |
송재영
|
참여연구자 |
우인옥
,
조수동
,
현방훈
,
문서영
|
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
|
발행년월 | 2019-12 |
과제시작연도 |
2019 |
주관부처 |
농림축산식품부 Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs(MAFRA) |
등록번호 |
TRKO202000030778 |
과제고유번호 |
1545019595 |
사업명 |
농림축산검역검사기술개발(R&D) |
DB 구축일자 |
2020-11-21
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키워드 |
돼지파보바이러스.혈구응집억제반응.효소면역측정법.바이러스중화시험.Porcine parvovirus 1-6.genetic diversity.Porcine parvovirus.Hemanglutination Inhibition.HI.Enzyme-linked immunosorbent assay.ELISA.Virus neutralization test.VN.
|
초록
▼
5. 최종 연구결과 요약
O 세부과제명 : 신종 돼지파보바이 러스 검사
1. 돼지 가검물 시료 : 도축장 출하돈 전혈, 도축장 출하돈 폐조직, 비육돈 혈청[n=100 (100농가, 농가당 10개씩혼합)], 유사산 태아 조직시료에서 돼지파보바이러스 1-7 검색
1. 돼지 가검물 시료(조직, 혈액)에서 신종돼지파보바이러스(PPV) 1~7 검색
- PPV1 : 항원 양성율 42.3%(481/1138)[출하돈 혈액 시료 38.5%(37/96), 출하돈 폐조직 시료 58.2%(375/644), 비육돈 혈청 10
5. 최종 연구결과 요약
O 세부과제명 : 신종 돼지파보바이 러스 검사
1. 돼지 가검물 시료 : 도축장 출하돈 전혈, 도축장 출하돈 폐조직, 비육돈 혈청[n=100 (100농가, 농가당 10개씩혼합)], 유사산 태아 조직시료에서 돼지파보바이러스 1-7 검색
1. 돼지 가검물 시료(조직, 혈액)에서 신종돼지파보바이러스(PPV) 1~7 검색
- PPV1 : 항원 양성율 42.3%(481/1138)[출하돈 혈액 시료 38.5%(37/96), 출하돈 폐조직 시료 58.2%(375/644), 비육돈 혈청 10%(10/100), 유·사산 조직 19.8%(59/298)]
- PPV2 : 항원 양성율 45.0%(473/1138)[출하돈 혈액 시료 3.1%(3/96), 폐조직 시료 71.0%(457/644), 비육돈 혈청 7%(7/100), 유·사산 조직 16.1%(44/298))
- PPV3 : 항원 양성율 46.2%(504/1092)[출하돈 혈액 시료 6.0%(3/50), 폐조직 시료 72.7%(460/644), 비육돈 혈청 1%(1/100), 유·사산 조직 13.4%(40/298)]
- PPV4 : 항원 양성율 33.4%(365/1092)[출하돈 혈액 시료 42.0%(21/50), 폐조직 시료 53.4%(324/644), 비육돈 혈청 1%(1/100), 유·사산 조직 6.4%(19/298)]
- PPV5 : 항원 양성율 42.8%(467/1092)[출하돈 혈액 시료 16.0%(8/50), 폐조직 시료 63.0%(406/644), 비육돈 혈청 3%(3/100), 유·사산 조직 18.5%(50/298)]
- PPV6 : 항원 양성율 44.9%(490/1092)[출하돈 혈액 시료 38.0%(19/50), 폐조직 시료 65.2%(420/644), 비육돈 혈청 2%(2/100), 유·사산 조직 16.4%(49/298)]
- PPV7 : 항원 양성율 41.0%(425/1056)[출하돈 혈액 시료 : 5.2%(5/96), 폐조직 시료 60.6%(390/644), 비육돈 혈청 0%(0/100), 유·사산 조직 17.1%(37/216)
- 신종돼지파보바이러스 검색 결과 검색 시료로 도축장에서 채취한 폐조직 시료가 가장 적합하 였으며 53.4~72.7%의 높은 양성율이 나타남
2. 돼지파보바이러스 항원 양성 시료에 대한 유전자 분석 및 변이 여부 확인
- PPV1 VP2 (PPV 항원성부위) 유전자 염기서열을 NCBI에 9개 유전자 서열을 Genbank에 등록하였음(Acc.No : MH447542-50 : PPV82, PPV49, PPV 25, PPV23, PPV13, PPV20, PPV21, PPV22, PPV1220)
- 유사산 태아에서 PPV1 바이러스 분리(PPV190313) 및 전체 유전자 염기 서열 확보, PPV1 백신주(NADL-2) 유전자와 국내 PPV1 VP2 유전자염기서열의 상동성은 99.1~99.4%, 아미노산은 서열은97.8~98.6% 의 상동성을 나타냄
- PPV2 전체 유전자 염기서열 2종 확보 : 유사산 태아에서 확보된 PPV2-KA2017의 유전자염 기서열은 미국 분리주 (US136)와 유전적으로 상동성이 높고,ORF1은 98.7%이고 ORF2는 99.9%임, PPV2-KA208 유전자염기서열은 중국분리주(CnPPV-YH14)와 유적전으로 상동성이 높고, ORF1은 97.8%이고 ORF2는 98.7%임
- PPV3 전체 유전자 염기서열 1개 확보 : PPV3은 중국분리주(EU200673)와 유전적으로 상동성이 높고, 유전자 시퀀스 상동성은 ORF1은 99.4%이고 ORF2는 98.6%임
- PPV4 전체 유전자 염기서열 4개 확보 : 돼지 도축장 폐시료에서 확보된 2종의 전체 유전자 중 S171206는 중국분리주(GU978965)와 96.5% 상동성을 가지고 있고, S180605는 브라질 분리주 유전자(KY586145)와 97.6% 상동성을 확인함, 돼지 유사산 태아에서 확보된 2종의 전체유전자 중에서 S180119-2는 중국분리주(GU978965)와 98.3% 상동성을 보였으며, S180119-23는 미국분리주(GQ387500)와 96.8% 상동성 확인함
- PPV5 전체 유전자 염기서열 4종 확보 : 돼지 도축장 폐시료에서 확보된 4종의 전체 유전자 중에서 PPV5(1206-29, 1219-29, 1220-17)는 미국분리주(JX896319)와 99.2%, 99.4%, 99.3% 상동성을 확인, 돼지 유사산 태아에서 확보된 PPV5(S18-23)는 중국 분리주 (JX896319)와 99.3%의 상동성을 확인함
- PPV6 NS1, VP1 유전자에 대한 염기서열 7종 확보 : 중국 분리주와는 90.8~97.5% 상동성을 확인하였으며, 미국 분리주와는 93.7~97.3% 상동성을 확인함
- PPV7 VP1 유전자에 대한 9개 염기서열 확보 : 미국 분리주 PPV7 42와 88.1%-97.9%이고, 중국 분리주와는 87.5%-97.8% 상동성을 확인
3. 돼지파보바이러스 분리
- 돼지파보바이러스 1~7까지 ST 세포, PK-15 세포 배양 후 바이러스 분리를 진행 후 PCR을 이용하여 바이러스 배양을 확인
O 세부과제명: 신종 돼지파보바이러스 항체 조사
1. 돼지파보바이러스 항체 조사
- 도축장 출하돈에서 돼지파보바이러스(PPV1) 항체 분포조사 : 도축장 출하돈 혈청(n=140)에 대한 돼지파보바이러스 HI test 결과 42.9%(60/140) 양성 확인
2. 신종돼지파보바이러스(PPV 2) 효소면역흡착법 개발 위한 항원 제작
- PPV2 ELISA용 항원으로 사용하기 위해 PPV2 캡시드 단백질(GH loop)을 대장균에서 발현 확인
(출처 : 요약 1p)
Abstract
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Emerging porcine parvovirus 2 through 6 (PPV2-6) and porcine circovirus type 3 (PCV3) are newly emerging viruses with unknown pathogenesis. The aim of this study was to better understand the co-factors of porcine circovirus associated with postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) and porcin
Emerging porcine parvovirus 2 through 6 (PPV2-6) and porcine circovirus type 3 (PCV3) are newly emerging viruses with unknown pathogenesis. The aim of this study was to better understand the co-factors of porcine circovirus associated with postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) and porcine respiratory disease complex (PRDC). A total of 917 samples (188 aborted pig fetuses, 634 lung tissues and 95 blood samples in finishing pigs) from domestic pigs in South Korea were tested for PPV 1-6, PPV 3 and co-infections with PCV2, respectively. The detection rates of PPV1, PPV2, PPV3, PPV4, PPV5, PPV6, PCV2, and PCV3 were 51%, 58%, 56%, 39%, 51%, 51%, 51%, and 40%, respectively, and the co-factor with PCV2 was detected in 28% (PPV1), 38% (PPV2), 38% (PPV3), 26% (PPV4), 32% (PPV5), 33% (PPV6), and 30% (PCV3). The highest co-factor with PCV2 provides valuable information for further study of pathological porcine circoviruses associated with PMWS and PRDC in pigs. Additionally, a phylogenetic analysis based on the complete major capsid genes of PPV1-6 and PCV2-3 suggested slight variation and difference across strains.
(출처 : Abstract 35p)
목차 Contents
- 표지 ... 1
- I. 연구배경 및 목표 ... 3
- 1. 연구배경 ... 3
- 2. 연구최종목표 ... 4
- 3. 연차별 연구개발 목표 및 내용 ... 4
- II. 연구방법 및 수행전략 ... 5
- 1. 재 료 ... 5
- 2. 연구전략 및 방법 ... 5
- III. 연구결과 ... 6
- IV. 연구결과요약 ... 30
- V. 참고자료 ... 34
- VI. 영문초록 ... 35
- 끝페이지 ... 35
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