초록 ▼

- 분열효모 유전자 적중 균주 pool은 1) 형태, 2) growth, 3) 적중 삽입 위치 이상 등을 보이는 outlier 균주를 포함하고 있으므로, 이를 체계적으로 점검하고 원인을 규명
- 분열효모 유전자 적중 균주 바코드의 에러를 수정하고 DB를 최적화하여 약물작용점 NGS 분석 시스템에 활용
- 유전자 적중 위치에 따른 상호간섭 분석으로 시스템 고도화
- 8-MOP: cytochrome P450 저해제로 drug repositioning으로 8-MOP 항암 유 효능을 확인
- Econazole: dru

- 분열효모 유전자 적중 균주 pool은 1) 형태, 2) growth, 3) 적중 삽입 위치 이상 등을 보이는 outlier 균주를 포함하고 있으므로, 이를 체계적으로 점검하고 원인을 규명
- 분열효모 유전자 적중 균주 바코드의 에러를 수정하고 DB를 최적화하여 약물작용점 NGS 분석 시스템에 활용
- 유전자 적중 위치에 따른 상호간섭 분석으로 시스템 고도화
- 8-MOP: cytochrome P450 저해제로 drug repositioning으로 8-MOP 항암 유 효능을 확인
- Econazole: drug repositioning으로 항암효과를 확인
- 결손균주 라이브러리에 대하여 바코드의 위치 및 염기서열을 검증하고 바코드 오류를 교정하고, 기존 barcode-seq 데이터 및 1, 2 세부 과제에서 생산하는 barcode-seq 데이터를 분석함
- barcode-seq 데이터 분석 과정을 확립하고 최신 통계 분석 방법들을 기존 분석 파이프라인에 추가하여 유용한 분석 도구를 확립함

(출처 : 요약서 3p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 요약문 ... 4
• 목차 ... 5
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
• 1. 분열효모 유전자 적중 균주의 점검 ... 6
• 2. 바코드 유전체 NGS 분석 방법의 타당성 점검 ... 8
• 3. 균주 pool 제조 SOP 작성 ... 8
• 4. 유전체 NGS 분석 SOP의 확립 (3세부 협력) ... 9
• 5. 항암제 drug screening (2세부 협력) ... 9
• 6. 약물작용점 분석은 부작용 없는 신약개발의 필수 영역 ... 10
• 7. 약물작용점 발굴을 위한 CRISPR 시스템 기반 기술의 중요성 ... 10
• 8. 약물작용점 탐색을 위한 barcode-seq 데이터 분석의 필요성 ... 11
• 9. 결손 균주의 검증 및 품질관리의 필요성 ... 11
• 10. 모델생물체를 이용한 약물작용점 데이터의 수집, DB화 및 웹 서버개발의 필요성 ... 12
• 2. 연구수행내용 및 성과 ... 13
• 1. 분열효모 유전자 적중 균주의 점검 ... 13
• 2. 바코드 유전체 NGS 분석 방법의 타당성 점검 ... 34
• 3. 균주 pool 제조 SOP 작성 ... 36
• 4. 유전체 NGS 분석 SOP의 확립 (3세부 협력) ... 39
• 5. CRISPR 약물작용점 분석 기술 확립 ... 39
• 6. 항암제 2종 약물작용점 분석 ... 41
• 7. 항암제 약물작용점 분석 시스템 고도화 ... 44
• 8. 약물 처리 최적화 조건 확립 ... 49
• 9. 약물 반응성 통합 전사체 분석 ... 49
• 10. 분열효모 결손균주 바코드 검증 ... 52
• 11. barcode-seq 데이터 분석 ... 60
• 12. barcode-seq 데이터 분석 방법 확립 및 개선 ... 61
• 13. 약물작용점 탐색을 위한 효모 전사체 정보 수집 및 분석 ... 73
• 14. 약물작용점 분석을 위한 기능 연구 및 생물정보 데이터베이스 구축 ... 76
• 3. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 77
• 4. 연구개발성과의 활용 계획 등 ... 79
• 붙임. 참고문헌 ... 80
• 끝페이지 ... 81