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효모 기반 약물작용점 분석의 생물정보 분석 시스템 개발
Development of bioinformatics system for drug-target identification using yeast deletion library 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 한국생명공학연구원
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology
연구책임자 김선영
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2020-02
과제시작연도 2019
주관부처 과학기술정보통신부
Ministry of Science and ICT
등록번호 TRKO202100002090
과제고유번호 1711082249
사업명 바이오.의료기술개발(R&D)
DB 구축일자 2021-06-12
키워드 분열효모 결손균주.전장유전체 분석.바코드 시퀀싱.약물작용점 데이터베이스.바코드 분석 소프트웨어.fission yeast deletion mutants.whole-genome sequencing.barcode-seq.drug target database.barcode-seq analysis software.

초록 ▼

연구의 목적 및 내용
분열효모 기반 생체 약물작용점 분석 시스템 구축을 위하여,
· 결손균주 라이브러리의 전장유전체 분석을 통해 기존 결손균주의 완성도를 높임
· 효과적인 약물작용점 분석을 위한 실험 및 분석 방법을 확립함
· 연구자들이 쉽게 사용할 수 있는 barcode-seq 데이터 분석 도구를 개발, 제공함
· 효모 기반 약물작용점 분석 오믹스 데이터들을 수집, 정리하여 DB로 제공함

연구개발성과
· 결손균주 라이브러리에 대하여 pooled strains과 개별균주 약 80

목차 Contents

  • 표지 ... 1
  • 제 출 문 ... 2
  • 보고서 요약서 ... 3
  • 요약문 ... 4
  • 목차 ... 5
  • 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
  • 가. 연구개발의 필요성 ... 6
  • (1) 약물작용점 탐색을 위한 barcode-seq 데이터 분석의 필요성 ... 6
  • (2) 결손 균주의 검증 및 품질관리의 필요성 ... 6
  • (3) 모델생물체를 이용한 약물작용점 데이터의 수집, DB화 및 웹 서버 개발의 필요성 ... 7
  • 나. 연구개발 범위 ... 7
  • 2. 연구수행내용 및 성과 ... 7
  • 가. 분열효모 결손균주 바코드 검증 ... 7
  • (1) 분열효모 결손균주 설계 검토 및 분석 방법 확립 ... 7
  • (2) 결손균주 바코드 삽입 위치 분석 ... 10
  • (3) 결손균주 바코드 염기서열 분석 ... 15
  • 나. barcode-seq 데이터 분석 ... 17
  • 다. barcode-seq 데이터 분석 방법 확립 및 개선 ... 19
  • (1) Updated Barcas : Post statistical processing ... 19
  • 라. 약물작용점 탐색을 위한 효모 전사체 정보 수집 및 분석 ... 32
  • (1) 효모 전사체 정보 수집 ... 32
  • (2) 효모 전사체 데이터 분석 ... 33
  • 마. 약물작용점 분석을 위한 기능 연구 및 생물정보 데이터베이스 구축 ... 35
  • (1) 약물작용점 분석을 위한 유전자 기능 연구 ... 35
  • (2) 약물유전체 관련 생물정보 데이터베이스 구축 ... 36
  • (3) 유전체 분석 연구 ... 36
  • 3. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 37
  • 3-1. 목표 ... 37
  • 3-2. 목표 달성여부 ... 37
  • 3-3. 목표 미달성 시 원인(사유) 및 차후대책(후속연구의 필요성 등) ... 37
  • 4. 연구개발성과의 활용 계획 등 ... 38
  • 가. 검증된 분열효모 균주 라이브러리 ... 38
  • 나. 약물작용점 데이터베이스 ... 38
  • 붙임. 참고문헌 ... 39
  • 끝페이지 ... 39

표/그림 (63)

참고문헌 (25)

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