초록 ▼

□ 연구개요
EBV는 잠복기감염 동안 숙주 유전자 발현에 변이를 일으키고 Hyper-methylation을 유도해 암과 같은 질병을 유도하는데, episome 형태의 genome이 숙주세포 유전자 발현에 어떠한 영향을 미치고 숙주 염색체상 어느 부위에 부착되어 있는지 알려져 있지 않음. 본 연구에서 최신 3차원 유전체 분석기술을 이용해 숙주세포 내 EBV genome의 부착 부위를 규명하고 부착 기작을 밝히며 숙주 유전자 발현에 미치는 영향을 연구함.

□ 연구 목표대비 연구결과
· 4C-seq 방법을 적용하여

□ 연구개요
EBV는 잠복기감염 동안 숙주 유전자 발현에 변이를 일으키고 Hyper-methylation을 유도해 암과 같은 질병을 유도하는데, episome 형태의 genome이 숙주세포 유전자 발현에 어떠한 영향을 미치고 숙주 염색체상 어느 부위에 부착되어 있는지 알려져 있지 않음. 본 연구에서 최신 3차원 유전체 분석기술을 이용해 숙주세포 내 EBV genome의 부착 부위를 규명하고 부착 기작을 밝히며 숙주 유전자 발현에 미치는 영향을 연구함.

□ 연구 목표대비 연구결과
· 4C-seq 방법을 적용하여 세계최초로 숙주세포 염색체 상 EBV genome 부착부위를 10 kb 해상도로 규명하였고, 다수의 ChIP-seq 결과와 비교분석을 통해 EBV genome의 부착부위에 대한 정보를 획득함.
· Hi-C 실험을 통해 숙주세포의 3차원 유전체 구조를 얻고, EBV genome 부착부위가 숙주세포의 3차원 유전체 구조 상 compartment 단위로 형성되어짐을 확인함.
· shEBNA1을 통해 EBV 부착을 제거하였을 때 타깃 유전자의 발현량을 조사하였고, 타깃유전자 발현량이 H3K9me3의 약화에 의해 상승함을 확인함.
· 환자의 혈액으로부터 추출된 B 세포에 EBV를 감염시킨 뒤 숙주세포의 3차원 유전체 구조를 Hi-C로 분석함. EBV 감염에 의한 3차원 유전체 구조변화를 확인하였고, 추가적인 ChIP-seq 실험을 통해 구조변화와 연관성을 가지는 요소를 분석함.
· 잠복기 감염 유형에 따른 숙주세포의 3차원 유전체 구조 특성을 분석함.
· BART 유전자 유무에 따른 EBV episome의 구조를 분석함.
· 혈액암 세포주에서 잠복기 유형에 따른 EBV 부착부위에 차이가 있음을 발견하였고 이에 혈액암 세포주 연구에 집중함. 그로인해 당초 계획했던 후두암과 위암 세포주에서의 연구는 진행하지 못함.

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과 (연구개발결과의 중요성)
▪ 최신 바이오테크놀로지의 발전: 본 연구를 통해 세계 최초로 virus episome이 숙주 염색체에 부착하는 부위를 규명함. 이는 3D genomics 방법을 응용한 새로운 연구방법으로 관련 연구에 바이오테크놀로지 측면에서 큰 영향을 미칠 것으로 기대함.
▪ episomal 바이러스의 genome 부착부위 규명: episome 형태의 genome을 가지고 있는 바이러스로 EBV 외에 KSHV, HSV, HPV, HBV, CMV 등이 존재하는데 이들 episome이 숙주의 어느 부위에 부착되어있고 부착에 의해 숙주 유전자 발현에 어떤 영향을 주는지 추후 연구가 진행될 것으로 예상됨. 더욱이 이들 바이러스는 암을 유발하는 oncogenic 바이러스이기 때문에 episome의 부착이 암발생과 어떤 연관성이 있는지에 대한 중요한 연구에 본 연구결과가 초석이 될 것으로 기대함.
▪ 관련 연구에 미칠 영향: 본 연구는 국제적으로 숙주-바이러스의 상호작용 연구하는 다른 그룹들에 중요한 참고자료가 될 것으로 기대함. 3차원 유전체학 연구를수행하는 국제적인 연구그룹들이 크게 확대되고 있지만 이 분야의 국내 연구는 미비한 실정임. 본 연구를 통해 국내 3차원 유전체학 연구가 알려지고 연구방법이 보급되어져 국가 과학기술의 발전에 기여할 것으로 기대함.

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 1) 1년차 ... 5
• 2) 2년차 ... 6
• 3) 3년차 ... 7
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 10
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 10
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 10
• 3) 목표 달성 수준 ... 11
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 11
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 12
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 12
• 6. 참고문헌 ... 13
• [붙임1] 세부 정량적 연구개발성과 ... 14
• [붙임2] 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 16
• 끝페이지 ... 19