초록 ▼

□ 연구개요
⦁ 수리 분석 기반의 차세대 단백체 분석을 통해 방광암 환자의 침윤 연관 바이오마커를 선별함으로서 향후 침윤성 방광암의 표적치료제 개발을 위한 핵심 바이오마커를 발굴하여 검증하는 것이 최종 목표임.
⦁ 이를 위해 본 연구에서는 침윤성 방광암에 대한 차세대 단백체 분석 및 머신 러닝 알고리즘 기반의 feature selection 분석을 통해 최적 바이오마커 후보군을 도출하고 발굴된 바이오 마커에 대한 생체 외 분자생물학적 기능 검증 및 인체 방광암 tissue microarray 검체 기반의 예측 능력 검증

□ 연구개요
⦁ 수리 분석 기반의 차세대 단백체 분석을 통해 방광암 환자의 침윤 연관 바이오마커를 선별함으로서 향후 침윤성 방광암의 표적치료제 개발을 위한 핵심 바이오마커를 발굴하여 검증하는 것이 최종 목표임.
⦁ 이를 위해 본 연구에서는 침윤성 방광암에 대한 차세대 단백체 분석 및 머신 러닝 알고리즘 기반의 feature selection 분석을 통해 최적 바이오마커 후보군을 도출하고 발굴된 바이오 마커에 대한 생체 외 분자생물학적 기능 검증 및 인체 방광암 tissue microarray 검체 기반의 예측 능력 검증 연구를 3차 년도에 걸쳐 단계적으로 시행하였음.

□ 연구 목표대비 연구결과
1차 년도
⦁ 목표1: 기 확보된 방광암 조직검체의 고처리용량 단백체 분석 시행
⦁ 내용1: 기 보유 중인 병기별 방광암 FFPE 병리 검체 (n=90)에 대한 차세대 단백체 분석 시행 및 생물정보학 분석을 통한 침윤연관 방광암 단백체 프로파일 발굴 및 정의
⦁ 결과1: 연관 단백질의 분자기능별 네트워크 분석 완료 (목표달성 : 100%)
⦁ 목표2: 침윤성 방광암 연관 후보바이오마커의 기능 규명
⦁ 내용2: 본 연구진이 기 구축한 4가지 머신 러닝 알고리즘을 이용한 feature selection 분석을 통해 인체 방광암 침윤 예측 단백질 조합 발굴 분석 시행 및 분자 실험 검증용 최적의 후보 단백체군 선별
⦁ 결과2: 머신 러닝 분석을 통한 방광암 침윤 예측 후보 단백체 조합 선별 완료 (목표 달성:100%)
2차 년도
⦁ 목표1: 방광암 침윤 연관 표적 단백질의 생체 외 세포단위 분자 생물 기전 검증
⦁ 내용1: 머신 러닝 알고리즘 분석을 통해 발굴된 후보 바이오마커에 대한 유전자 조작 방광암 세포주 라이브러리 구축
⦁ 결과1: 발굴된 2개의 후보 바이오마커 유전자 발현 조절 방광암 세포주 구축 및 후보 바이오마커의 분자생물학 기능 검증 (100%완료)
⦁ 목표2: 침윤 바이오 마커의 유도-제어 기전 연관 단백질 체성 정의
⦁ 내용2: 생물정보학 in silico 모델 및 생체외 분자생물모델에서 동시에 유효성이 검증된 최종 후보 바이오마커 표적의 Bio-IP MS 단백체 분석 시행
⦁ 결과2: 머신 러닝 분석을 통한 최적의 방광암 침윤 예측 후보 단백체 조합 선별 (100% 완료)
3차 년도
⦁ 목표1: 선별 바이오마커의 침윤 예측능력 최종 검증 및 침윤 차단 표적 후보 제시
⦁ 내용1: 최종 선별된 방광암 침윤 연관 바이오마커를 본 연구진에 의해 기 구축된 검증용 독립 인체유래 방광암 FFPE 코호트에 대해 면역조직화학염색 검사를 시행 및 숙련된 비뇨기계 병리 전문 인력 및 Aperio imageScope digital pathology 분석 기술을 통한 최종 선별 바이오마커의 방광암 침윤 예측도 평가
⦁ 결과1: 방광암 침윤 예측 후보 단백체 바이오마커 규명 완료 (Cancers 2020)

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
⦁ 방광암 침윤 유도 핵심 유전자의 생체 내 역할을 검증함으로서 방광암의 침윤 차단 핵심 바이오마커 제시 가능
⦁ 면역조직화학염색 기법 기반의 방광암 침윤 예측 능력 평가 진단체 시작품 제시
⦁ 방광암 침윤 차단 표적 치료후보물질 최종 제시
⦁ 방광암의 침윤에 관여하는 분자기전을 단백질 수준에서 규명함으로서 인체 모델에 가장 근접한 방광암의 침윤 대한 대규모 단백질 정보를 후속 연구자 및 신약 개발자들에게 제공할 수 있음.
⦁ 본 연구에서 발굴하는 방광암 침윤 표적 마커는 방광암의 불량한 생존율을 극복할 수 있는 차세대 표적치료제 개발의 핵심 자료로 활용될 것이며, 이를 통해 방광암 환자의 생존율 증대에 기여할 수 있을 것임.

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 8
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 8
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 9
• 3) 목표 달성 수준 ... 10
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 10
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 11
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 11
• 6. 참고문헌 ... 11
• 붙임1. 세부 정량적 연구개발성과 ... 12
• 붙임2. 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 13
• 끝페이지 ... 25