초록 ▼

□ 연구개발 목표 및 내용
￭ 최종 목표
1. 전체 식물 표준유전체 기반 유전자 모델 정보 고도화를 위한 통합 시스템 구축.
2. 핵심 농업형질 관련 유용 유전자 군 대량 발굴 및 유전자 진화메커니즘 규명.
￭ 전체 내용
- 본 과제의 연구는 1) 전체 공개 식물 유전체를 기반으로 한 대상 유전자 군(Target gene family)을 공개된 생명정보 리소스 기반의 re-annotation tool 개발을 통하여 2) 전체 식물 종에 대한 일괄적 re-annotation을 저비용 고효율로 수행

□ 연구개발 목표 및 내용
￭ 최종 목표
1. 전체 식물 표준유전체 기반 유전자 모델 정보 고도화를 위한 통합 시스템 구축.
2. 핵심 농업형질 관련 유용 유전자 군 대량 발굴 및 유전자 진화메커니즘 규명.
￭ 전체 내용
- 본 과제의 연구는 1) 전체 공개 식물 유전체를 기반으로 한 대상 유전자 군(Target gene family)을 공개된 생명정보 리소스 기반의 re-annotation tool 개발을 통하여 2) 전체 식물 종에 대한 일괄적 re-annotation을 저비용 고효율로 수행하고자 한다. 3) 고도화 된 유전자 군에 대하여 전체 식물 레벨의 비교 유전체 진화 분석을 통한 종/속/과 특이적 유전자 발굴과 진화메커니즘을 규명하고 4) 이를 기반으로 한 통합 웹 기반 유전체 고도화 및 비교유전체 분석 플랫폼을 구축하고자 한다.
￭ 1단계
ₒ 목표
- 식물 표준유전체 기반 유전자 모델 정보 고도화 프로그램 개발 및 유용 유전자 군 대량 발굴
ₒ 내용
- 1단계의 연구를 통하여 1) 대상 유전자 군(Target gene family)을 공개된 생명정보 리소스 기반으로 새롭게 re-annotation 할 수 있는 TGFam-Finder(Target Gene Family Finder)를 개발하였고 2) TGFam-Finder를 이용하여 전체 식물 종에 대한 일괄적 re-annotation을 병저항성 유전자군, 개화관련 전사인자, 대사산물 관련 유전자 군에 대하여 수행하였으며 3) 고도화 된 유전자 군에 대하여 전체 식물 레벨의 비교 유전체 분석을 수행 후 특이적 유전자들을 발굴 하였다. 이는 추후 유전자 기능검정의 재료로 활용 될 것이다.
￭ 2단계
ₒ 목표
- 새롭게 annotation 유전자 정보를 활용한 중요 형질연관 기능성 유전자 동정 및 유전체 플랫폼 구축
ₒ 내용
- 2단계의 연구를 통하여 1) 벼, 토마토 등 주요작물 유전체에서 새롭게 annotation 된 대상 유전자 군(Target gene family)에 대한 기능성 유전자 발굴 및 해당 유전자들의 진화 기작 규명 연구를 수행한다. 2) 수집된 유전체 정보, 고도화된 유전자 정보, 비교유전체 분석 결과 등을 활용 할 수 있는 웹 기반의 플랫폼 구축을 수행하여 다양한 유전체 활용 연구자들을 지원한다

□ 연구개발성과
- 유전자 고도화 소프트웨어 (TGFam-Finder) 개발 및 공개
- 식물 50종에 대한 고도화 된 중요 유전자 군 정보 구축
- 중요 유전자 서열 비교를 통한 종 특이적 유전자 정보 구축
- 수월성 있는 논문 (교신저자 4편, 분야 별 상위 3% 또는 IF>10이상 논문 3편) 게재

□ 연구개발성과 활용계획 및 기대 효과
- 비교 분석 된 유전자 서열들은 중요 농업형질 관련 기능성 유전자 후보군으로서 현재 공개되지 않았기 때문에 가치있는 육종 소재로서 중요하게 사용 될 수 있을거라 생각됨. 해당 기능 유전체 연구자들과의 공동연구를 통한 시너지를 창출할수 있을거라 기대됨
- 새로 분석된 유전자 annotation 결과 및 비교 유전체 분석 결과는 기존에 public database에 공개된 유전자 정보에서 결여되었던 정보들이 매우 많이 존재하므로, 기능 및 진화 유전체 연구 가속화에 매우 기여할 것으로 기대됨

(출처 : 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 요 약 문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 7
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 7
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 8
• 3) 목표 달성 수준 ... 9
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 9
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 10
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 10
• 6. 참고문헌 ... 10
• 붙임1. 세부 정량적 연구개발성과 ... 11
• 붙임2. 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 12
• 끝페이지 ... 28