초록 ▼

□ 연구개요
본 연구과제는 산업적용 가능한 종돈유전체선발시스템을 확립하기 위해 우선적으로 분산되어 있는 데이터를 통합하여 참조유전체 데이터를 만들고 표준화작업을 거쳐 신뢰한만한 수준의 유전체선발시스템을 만든다. 그리고 이를 지속적으로 운영하면서 유전체선발 효과를 검증하고 업데이트하며, 유전체선발기술의 고도화 연구를 통해 유전체선발시스템의 전체적인 수준을 향상시킨다. 또한 미래에 NGS 데이터를 동물유전체육종에 이용하기 위해 머신러닝을 이용한 대용량 유전체 데이터 처리기술을 개발하고, NGS 데이터와 SNP 칩데이터를 이용하여

□ 연구개요
본 연구과제는 산업적용 가능한 종돈유전체선발시스템을 확립하기 위해 우선적으로 분산되어 있는 데이터를 통합하여 참조유전체 데이터를 만들고 표준화작업을 거쳐 신뢰한만한 수준의 유전체선발시스템을 만든다. 그리고 이를 지속적으로 운영하면서 유전체선발 효과를 검증하고 업데이트하며, 유전체선발기술의 고도화 연구를 통해 유전체선발시스템의 전체적인 수준을 향상시킨다. 또한 미래에 NGS 데이터를 동물유전체육종에 이용하기 위해 머신러닝을 이용한 대용량 유전체 데이터 처리기술을 개발하고, NGS 데이터와 SNP 칩데이터를 이용하여 구조유전체변이 연구를 통해 종돈형질에 대한 유전체데이터의 설명력을 높인다.

□ 연구 목표대비 연구결과
1년차에는 국내 종돈 유전체선발 시스템 표준화를 목표로 종돈 유전체 선발을 위한 표현형 데이터 및 분석 모형 표준화 및 유전체 데이터의 표준화를 진행하였다. 2년차에는 국내 종돈 집단에 대한 유전체 구조 정밀 해석을 위해 유전체 데이터를 이용한 haplotype 재구성 및 양적형질좌위 탐색 및 양적형지자위의 유전력 추정을 통한 마커효과 평가와 유전자-환경 상호작용 분석을 추진하였다. 3년차에는 유전체 선발 시스템의 산업적 적용 확장 기술 개발을 목표로 종돈 유전체 정밀지도를 이용한 종돈 필요 형질별 마커효과 추정 및 고품질의 마커효과를 이용한 유전체 육종가 추정시스템을 확립 하였다. 4년차에는 미래 종돈 유전체육종을 위한 유전체 소재 개발을 위해 종돈 NGS 데이터를 이용한 정밀한 구조유전체변이 지도를 작성하고 종돈칩데이터 및 표현형 데이터를 이용한 구조유전체변이효과를 추정하였다. 그런데 칩으로 발굴할 수 있었던 CNV의 경우 집단을 설명하거나 표현형을 설명하기에 SNP와 비교해 설명력이 떨어지는 것을 확인할 수 있었고 현재 NGS 기반으로 small-size InDEL을 이용해 집단을 구분하고 설명할 수 있는 유전체 연구를 수행하고 있다. 5년차에는 미래 종돈 유전체 육종을 위한 대용량 데이터 처리기술 개발을 위해 머신러닝 기법을 이용한 대용량 종돈 유전체 데이터 처리기술을 개발 하였다.

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
분산되어 있는 유전체선발데이터를 통합하여, 추가적인 데이터 생산비용 없이 기존 데이터 활용을 극대화하여 충분한 크기의 참조데이터를 만들었으며, 이를 이용하여 신뢰할만한 국내 종돈을 위한 유전체선발시스템을 구축했다. 또한 국내 종돈장의 참여를 유도하여 국내 종돈산업에 유전체선발시스템을 확대하고, 이 개량기술을 통해 17,000두의 종돈을 넘어 다수의 국내 모돈 및 자돈의 수준을 높였다. 뿐만 아니라 기술고도화작업을 통해 국내 종돈환경을 고려하여 유전체선발시스템의 수준을 한단계 높은 수준으로 향상 시켰다. 본 과제의 전반부가 축산선진국이 사용하고 산업에 적용되고 있는 종돈 유전체육종기술을 따라잡는 과정이라면, 과제 후반부는 미래 기술연구를 통해 국내 종돈 산업을 뒷받침할 세계적 수준의 연구력을 갖추게 되었다.

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 12
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 12
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 12
• 3) 목표 달성 수준 ... 12
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 13
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 13
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 13
• 6. 참고문헌 ... 13
• [붙임1] 세부 정량적 연구개발성과 ... 15
• [붙임2] 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 18
• 끝페이지 ... 33