초록 ▼

※ 연구개요
간암발생 단계별 멀티오믹스의 통합분석을 이용하여 간암진화모델을 구축하고, 이를 기반으로 간암의 발생기전을 발굴 및 제어기술을 개발하고자 함

※ 연구 목표대비 연구결과
□ 간암의 발달 단계별 시료, 임상정보 확보 및 멀티오믹스 데이터의 생산
○ 전암 단계 시료인 간경변, 간이형성 과 조기간암, 진행성 간암 시료 확보 및 임상정보 수집 (총 131례)
○ 유전체, 메틸롬, 전사체 등 멀티오믹스 데이터 생산 (총 249례)
□ 유전체 프로파일링을 이용한 간암의 암진화 모델링
○ 멀

※ 연구개요
간암발생 단계별 멀티오믹스의 통합분석을 이용하여 간암진화모델을 구축하고, 이를 기반으로 간암의 발생기전을 발굴 및 제어기술을 개발하고자 함

※ 연구 목표대비 연구결과
□ 간암의 발달 단계별 시료, 임상정보 확보 및 멀티오믹스 데이터의 생산
○ 전암 단계 시료인 간경변, 간이형성 과 조기간암, 진행성 간암 시료 확보 및 임상정보 수집 (총 131례)
○ 유전체, 메틸롬, 전사체 등 멀티오믹스 데이터 생산 (총 249례)
□ 유전체 프로파일링을 이용한 간암의 암진화 모델링
○ 멀티오믹스 데이터 통합분석 기법 개발, 암진화 모델링 및 타겟 발굴 (SPINK1)
○ 비암호화 타겟 유전변이 4건 발굴 (LINC00844, RP11-115C10.1, C3P1, TPRG1-AS1)
□ 신호전달경로 기반 (pathway-centered) 유전변이 정밀 타겟 발굴
○ 공개 약물유전체 데이터활용 암-약물유전체 데이터 통합분석 파이프라인 구축 및 유전변이-타겟약물 발굴 (EPHB6 변이 - Paclitaxel)
□ 단일세포 시퀀싱기술을 이용한 전사체 데이터 생산
○ 간암 환자의 종양 및 비종양 조직의 단일세포 시퀀싱 데이터 생산 (37례)
○ 단일세포 전사체 데이터의 세포타이핑 분석 파이프라인 개발 (SEQProcess)
□ 간암발생 핵심 비암호화 및 암호화 유전변이의 기능 검증
○ 전암 병변의 조기암화 관련 CAP2 유전자 발현 기능 기전 검증
○ 간암의 진행 제어타겟 USO1 전사이소체 변이 발굴, in vivo 및 in vitro 검증
□ 간암발생 제어기술 개발
○ 비암호화 핵심 유전자 TPRG1-AS1의 하위타겟 RBM24, synthetic lethal 약물 타겟 후보 miR-4691-5p/miR-3659 발굴 및 검증
○ 암화제어 타겟 RBM24의 기능 및 신호전달 기전 규명
○ 간암의 마우스모델(STAM, DEN) 구축 및 발생단계별 단일세포 전사체 데이터 분석을 통한 전암 병변 암화진행 제어타겟 발굴

최종 논문발표 13건, PCT 특허 2건, 국내특허 등록 2건 및 출원 2건 성과 등록
(목표: 최종 논문발표 (3편 이상, SCI) 및 국제특허등록 (1건이상))

※ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
○ 간암의 전주기 단계별 충분한 시료를 확보하는 것이 매우 어려운 실정이며, 양질의 충분한 양의 시료를 확보하여야 멀티오믹스 데이터를 생산할 수 있음
○ 본 연구진은 다년간 충분한 양의 시료와 임상정보를 확보하여 연구 결과로 간암 발생 단계별 멀티오믹스 데이터 프로파일을 구축함. 이는 세계적으로 활용가치가 높은 고품질의 데이터가 될 것이며, 향후 TCGA 또는 CCLE 와 같은 컨소시엄 공개데이터와 더불어, 간암기전연구의 필수 기초 연구 자료가 될 것임
○ 또한, 본 연구는 멀티오믹스 및 약물유전체 데이터 통합분석을 위한 인공지능 기반의 통합분석 전략을 확립하여 오믹스 통합분석을 위한 새로운 방법론을 제시함
○ 본 연구에서 구축한 통합오믹스 분석 기술은 향후 유전체 분석연구의 핵심기술이 될 것이며, 미래의 유전체 정보 분석 연구 및 상용화된 시장 개척이 가능할 것임
○ 본 연구에서 발굴한 간암발생의 조기발견을 위한 마커 및 암발생 제어를 위한 비암화 및 암호화 영역의 핵심 치료타겟은 향후 간암의 조기진단, 정밀치료를 위한 기반이 될 것임

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 1-1. 최종목표 ... 4
• 1-2. 연차별 목표 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 1) 간암의 발달 단계별 시료 및 임상정보 확보 및 데이터 생산 ... 5
• 2) 유전체 프로파일링을 이용한 간암의 암진화 모델링 ... 5
• 3) 신호전달경로 기반 (pathway-centered) 유전변이 정밀 타겟 발굴 ... 7
• 4) 간암발생 핵심 비암호화 및 암호화 유전변이의 기능 검증 ... 8
• 5) 간암발생 제어기술개발 ... 10
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 12
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 12
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 13
• 3) 목표 달성 수준 ... 13
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 14
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 14
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 15
• 6. 참고문헌 ... 15
• [붙임1] 세부 정량적 연구개발성과 ... 16
• [붙임2] 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 22
• 끝페이지 ... 36