초록 ▼

□ 연구개요
폐암은 종양연관항원이 잘 규명되어있지 않아 면역치료법 개발에 제한이 있으나, 최근 폐암의 빈발한 염기서열 변이가 종양특이항원(신생항원, neoantigen)으로 작용하여 면역치료법 개발에 유용하게 사용될 수 있음이 밝혀지고 있음. 본 연구에서는 정상 폐 조직과 말초혈액의 전장 엑솜 염기서열과 차이가 나는 폐암조직의 신생항원을 분석한 자료를 이용하여 환자의 HLA 대립유전자에 제한되는 펩티드 후보물질을 탐색하고 폐 종양침윤 림프구를 이용하여 이러한 펩티드의 면역원성(immunity)을 측정하고 신생항원을 발굴하는 체

□ 연구개요
폐암은 종양연관항원이 잘 규명되어있지 않아 면역치료법 개발에 제한이 있으나, 최근 폐암의 빈발한 염기서열 변이가 종양특이항원(신생항원, neoantigen)으로 작용하여 면역치료법 개발에 유용하게 사용될 수 있음이 밝혀지고 있음. 본 연구에서는 정상 폐 조직과 말초혈액의 전장 엑솜 염기서열과 차이가 나는 폐암조직의 신생항원을 분석한 자료를 이용하여 환자의 HLA 대립유전자에 제한되는 펩티드 후보물질을 탐색하고 폐 종양침윤 림프구를 이용하여 이러한 펩티드의 면역원성(immunity)을 측정하고 신생항원을 발굴하는 체계를 구축하고자 함. 3D 배양을 통해 형성된 폐암 오가노이드와 시험관 내에서 배양된 신생항원 특이 T 세포를 이용하여 생체 내와 유사한 환경에서 항종양 면역 효능 측정법을 확립하고자 함

□ 연구 목표대비 연구결과
◎ 폐암 특이 염기서열 신생항원 탐색을 위한 폐암 환자에서 차세대 염기서열분석(next generation sequencing)을 이용한 whole exon sequencing (WES) 및 RNA sequencing 진행방법 확립
◎ 정확한 신생항원 예측을 위한 HLA 유전자 검사 방법 확립
◎ 폐암의 돌연변이 중 해당 환자의 MHC class I, II 대립유전자에 항원제시 되는 신생항원 후보군을 신속하게 선별하고자 binding prediction을 분석함.
◎ 환자 폐암의 돌연변이 중 신생항원 후보군을 신속하게 선별하는 분석 프로그램을 개발 완료함.
◎ 수많은 신생항원 후보군들을 엮은 Tandem minigene (TMG) RNA 합성법을 확립함. 각 신생항원 후보들의 면역원성을 신속하게 알아내기 위해 Single minigene (SMG)의 합성법을 확립함.
◎ 적은 환자 시료에서 신생항원 후보의 면역원성을 측정하는 방법을 확립함.

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
◎ 폐암 특이 염기서열 신생항원 탐색
● 차세대 염기서열 분석을 이용한 폐암조직 및 폐암 오가노이드의 전장 엑솜 염기서열을 분석하고 driver mutation 후보군을 선별함 - somatic mutation 분석 및 tumor mutational burden 분석으로 신생항원 후보 물질을 탐색함.
● 신생항원 발현 정도 비교분석 - FPKM > 1인 transcript 를 나타내는 신생항원 후보 물질 (유전자) 선별
◎ In silico 신생항원 예측
● 인공 신경망을 이용한 netMHCpan EL4.0 (웹 기반 IEDB Analysis Resource의 MHC-I Binding Predictions (http://tools.iedb.org/mhci/)으로 HLA 결합 친화력이 높은 신생항원을 선별함
● 신생항원이 프로테아좀에 의해 프로세싱되는 서열을 시뮬레이션하여 신생항원의 펩타이드 서열을 예측함

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 18
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 18
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 18
• 3) 목표 달성 수준 ... 18
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 19
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 20
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 20
• 6. 자체점검표 ... 22
• 7. 참고문헌 ... 22
• [붙임1] 세부 정량적 연구개발성과 ... 23
• [붙임2] 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 25
• 끝페이지 ... 30