초록 ▼

□ 연구개요
피부림프종 FFPE tissue를 이용하여 bulk transcriptome analhysis 및 spatially resolved transcriptome analysis를 시행한다. 이를 통해 Primary cutaneous lymphoma 각 아형별 tumor microenvironment의 immune cell type, tumor microenvironment의 immunologic function과 관련된 gene expression profiling, tumor specific antigen을 규명한다

□ 연구개요
피부림프종 FFPE tissue를 이용하여 bulk transcriptome analhysis 및 spatially resolved transcriptome analysis를 시행한다. 이를 통해 Primary cutaneous lymphoma 각 아형별 tumor microenvironment의 immune cell type, tumor microenvironment의 immunologic function과 관련된 gene expression profiling, tumor specific antigen을 규명한다.

□ 연구 목표대비 연구결과
Cutaneous lymphoma의 대표적 3가지 아형인 mycosis fungoides, lymphomatoid papulosis, anaplastic large cell lymphoma 의 bulk transcriptome analysis 및 digital spatial transcriptome analysis를 시행하였고, 3가지 아형의 상이한 tumor microenvirome nt 및 tumor cell 유전자 발현의 차이점을 규명하였다.
3가지 피부림프종 유형에 대해 nanostring GeoMx DSP 방식을 이용하여 spatial transcriptome 분석, nCpounter tumor immunity panel을 이용하여 total transcriptome analysis를 시행하였다.
Differential expressed gene (DEGs) 분석을 통해 각 림프종 아형에서 가장 특이적으로 발현되는 유전자를 발견하였으며, pathway analysis 및 gene set enrichment analysis를 통해 림프종 아형에 따라 tumorigenesis 주요기전을 규명하였다.
또한 cell deconlution analysis를 통해 tumor cell area 및 extratumoral area의 tumor microenvironement 구성 성분을 분석하였다.

종양세포 특이적인 CD30 발현 영역을 지정하여 tumor cell specific transcriptome 발현을 분석. MF에서의 extracellular matrix remodeling, 종양세포 근접 cancer associated fibroblast의 중요성을 규명하였다. 또한 lymphomatoid papulosis에서의 DNA repair, collagen remodeling, chromosome maintenance signaling pathway가 높게 발현됨을 규명하고 이는 임상적 특징을 설명할 수 있는 병태기전으로 이해할 수 있다.

이번 과제 연구결과를 바탕으로 2023년 Korean Society of Investigative Dermatology, International Society of Investigative Dermatology, World Congress of Dermatology 학술대회에 구연 및 포스터 발표를 시행예정이며,
현재 2건의 연구논문을 작성하여 Journal of Investigative Dermatology 에 투고 및 리뷰과정 (2차 revision 시행중) 중이다.

□ 연구발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
1) Mycosis fungoides, tumor type 의 특이 유전자 발현 및 tumor microenviroment 규명을 통한 targeted therapy 또는 immunotherapy의 기반데이타 마련
: 본 연구를 통해 advanced, transformed mycosis fungoides 에서의 extracellular matrix remodeling 기전이 tumor progression에 중요한 기전이며, cancer associated fibroblast 및 M2 tumor asscoiated macrophage가 tumor microenvironment 내에서 중요한 역할을 함을 규명하였다
: 이는 치료 성적이 좋지 advanced mycosis fungoides에서 적용될 수 있는 targeted or immunotherapy의 타겟물질로서의 가치를 시사하며, 향후 치료제 개발의 기반데이타활용이 기대된다.

2) Mycosis fungoides, lymphomatoid papulosis, anaplastic large cell lymphoma 아형별 예후 예측인자 및 biomarker 로서의 가치
3) Cutaneous lymphoma subtype 내에서의 tumor microenvironment 및 tumor cell phenotype의 categorization을 통해 향후 rare subtype classification을 위한 근거자료 제시
본 연구에서 lymphomatoid papulosis 및 anaplastic large cell lymohoma의 gene expreesion 차이를 규명, CD30 lymphoproliferative disorder 스펙트럼 내에서 subtype classification 근거 자료 및 pathogenesis 기반자료 제공. Apoptosis pathway, circadian clock disruption, interferon signaling, DNA repair signaling이 두 아형간 차이가 있었으며, 이는 종양기전에 대한 이해 및 향후 면역치료의 기반자료로서 의미가 있음

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 6
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 6
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 12
• 3) 목표 달성 수준 ... 12
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 12
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 13
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 13
• 6. 자체점검표 ... 14
• 7. 참고문헌 ... 14
• [붙임1] 세부 정량적 연구개발성과 ... 16
• [붙임2] 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 17
• 끝페이지 ... 29