초록 ▼

□ 연구개요
ATAC-seq을 이용하여 다양한 암 종의 후성유전체를 탐색하고, 질병 특이적 후성유전체 특성 분석하고자 함. 급성 골수성 백혈병(AML), 만성 골수성 백혈병(CML), 골수이형성증후군 (MDS) 등 다양한 혈액암 종에 대한 후성 유전체 탐색 및 분석하였음. 이를 바탕으로 CML 특이적 유전자 발현 조절 부위의 검증을 수행하고, 진단 시 검체와 임상 정보를 활용하여 후성유전체 기반의 약물 반응성 및 재발 가능성을 진단할 수 있는 지표를 특정하였음.

□ 연구 목표대비 연구결과
1. ATAC_seq

□ 연구개요
ATAC-seq을 이용하여 다양한 암 종의 후성유전체를 탐색하고, 질병 특이적 후성유전체 특성 분석하고자 함. 급성 골수성 백혈병(AML), 만성 골수성 백혈병(CML), 골수이형성증후군 (MDS) 등 다양한 혈액암 종에 대한 후성 유전체 탐색 및 분석하였음. 이를 바탕으로 CML 특이적 유전자 발현 조절 부위의 검증을 수행하고, 진단 시 검체와 임상 정보를 활용하여 후성유전체 기반의 약물 반응성 및 재발 가능성을 진단할 수 있는 지표를 특정하였음.

□ 연구 목표대비 연구결과
1. ATAC_seq을 이용한 후성유전체 분석 (100%)
혈액암 환자 검체 365개, 고형암 환자 검체 546개에 대한 ATAC-seq 수행 및 QC를 통과한 341개(62%)의 검체 데이터 분석
2. 데이터 분석 (100%)
각 질병간 비교 및 약물 반응성, 재발, 유전적 변이 등을 포함하는 sub-type에 대한 비교 분석 및 질병/sub-type 특이적 후성유전체 분석
3. 크리스퍼 스크리닝 및 유전자 발현 기전 연구 (100%)
ATAC-seq 결과와 데이터베이스를 활용한 크리스퍼 라이브러리 제작 및 스크리닝 수행, CML 세포주에서 환자 검체에서 유의한 유전자 발현 조절 부위를 특정하고 검증
4. 후성유전체 마커 특정 및 유전자 진단 (100%)
ATAC-seq을 기반으로 CML환자의 진단 시 Gleevec 저항성과 관련된 특이적 유전자 발현 조절 부위 특정 및 진단용 지표 선정

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
다양한 암종에서 공통적으로 발견되는 distal element의 중요성은 GWAS 연구 등에서 주로 발견되는 non-coding SNP의 등의 기능과 밀접한 관련이 있을 것으로 예상됨. 따라서 본 연구에서 확보한 주요 혈액암 및 갑상선암, 위암과 sub-type 특이적 유전자 발현 조절의 기능을 연구하는 것을 질병의 이해와 치료 및 진단에서 매우 중요한 기여를 할 수 있을 것으로 기대됨. 2021년 대한혈액학회 국제학술대회(ICKSH)의 발표에 따르면 CML의 치료비용은 1차 치료제 중 가장 저렴한 글리벡이 약 1,700만 원이고 닐로티닙은 약 3,000만 원에 달함. 본 연구를 통해 질환자에게 효과적인 선정하면 투약 기간을 줄이고 기능적 완치에 이르는 환자 수의 증가를 기대할 수 있음. 국내 CML 환자 수를 고려할 때 기능적 완치에 이르러 효과적인 투약 중단을 시행하면 국가적으로 매년 천억 원 이상의 의료비를 절감할 수 있을 것으로 예상함(한국혈액암협회, 2020). 또한, CML 환자의 검체를 활용한 연구와 국제 데이터베이스를 활용한 분석 등을 통해 아시아인 및 한국인의 유전체 특성이 반영된 연구 결과 또한 도출할 수 있을 것임. 이러한 연구 기법은 글리벡 뿐만 아니라 2차 3차 항암제에도 적용하여 혈액암 환자의 진단 시에 다양한 항암제의 반응성을 예측할 수 있는 기술로 발전 시키고자 함.

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 1) 연구개발의 목표 ... 4
• 2)　연구개발의 필요성 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 1) 주요 연구 변경사항 ... 5
• 2) 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 7
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 7
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 12
• 3) 목표 달성 수준 ... 12
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 13
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 13
• 6. 자체점검표 ... 14
• 7. 참고문헌 ... 14
• 붙임1. 세부 정량적 연구개발성과 ... 16
• 붙임2. 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 17
• 끝페이지 ... 19