초록 ▼

□ 연구개요
비침습적인 검체(뇨 그리고 혈액 검체)로부터 암 예방 및 예후 예측 모델에 적용하기 위한 분석 방법 최적화 및 검증
- 비침습적 시료로부터 원형RNA (circRNA) 추출을 위한 추출을 위한 방법론 확립 및 표준화
- 암 진행 과정 및 약물반응과의 연관성을 보이는 원형RNA 발굴
- 임상학적 정보를 이용한 원형RNA 발현과의 임상에 효용성 평가

□ 연구 목표대비 연구결과
○ 시료 수집
▶ 정상군과 암환자의 소변및 혈액 수집 (80여명의 뇨검체, 혈액 수집)
▶ 수술 환

□ 연구개요
비침습적인 검체(뇨 그리고 혈액 검체)로부터 암 예방 및 예후 예측 모델에 적용하기 위한 분석 방법 최적화 및 검증
- 비침습적 시료로부터 원형RNA (circRNA) 추출을 위한 추출을 위한 방법론 확립 및 표준화
- 암 진행 과정 및 약물반응과의 연관성을 보이는 원형RNA 발굴
- 임상학적 정보를 이용한 원형RNA 발현과의 임상에 효용성 평가

□ 연구 목표대비 연구결과
○ 시료 수집
▶ 정상군과 암환자의 소변및 혈액 수집 (80여명의 뇨검체, 혈액 수집)
▶ 수술 환자의 전후 단계에서의 소변 및 혈액 수집 (뇨 검체 30명 paired 시료 수집 완료)

○ Wet-LAB 단계
▶ 시료로부터 circRNA을 수집하기 위한 exosome 추출 방법 정립
1) ultracentrifuge를 이용하여 추출하는 방법과
2) filter 방법을 통해 추출한 뇨검체를 extracellular vesicle을 추출할 수 있는 분리 kit 방법

○ Dry-LAB 단계
▶ 추출한 exosomal RNAs를 이용하여 NGS 최적의 분석 방법 정립
- customizing된 라이브러리 제작 및 NGS로 분석 가능한 최대치로 circRNA 검출

○ 분석 단계
- 수술 전 환자로부터 RNaseR를 미처리 후 시료로 부터 검출된 circRNA은 10개이며 RNaseR를 처리 후 시료로 부터는 128개가 검출되었음. 반면에 ciRNA는 RNaseR를 미처리 후 시료로 부터 검출된 circRNA은 2개이며 RNaseR를 처리 후 시료로 부터는 389개가 검출
- 수술 후 환자에 RNaseR을 처리한 결과물에서는 KEGG pathway 중에서 AMPK signaling pathway, PI3K-AKT saignaling pathway, TCA cycle 등이 연관성 발견

□ 연구발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
- noncoding 영역의 새로운 분자마커 개발이 가능하며, 특히 비침습적인 방법을 통한 방법으로 새로운 진단 및 예후 예측 모델에 활용이 가능함
- 표준화 되고 체계화된 방법론으로 정확한 circRNA 데이터 베이스 제공이 가능하며, 다른 암종에 대해 적용 가능함
- noncoding RNA 분석 기술 노하우 축적에 따라 다른 noncoding 영역의 확대 가능
- 이러한 circRNA 데이터베이스를 기반으로 현재 화두인 인공지능 관련하여 기계학습 및 심화학습을 통한 암 예방 및 예측 모델에 활용 가능함

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 6
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 10
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 10
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 10
• 3) 목표 달성 수준 ... 10
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 10
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 11
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 12
• 6. 자체점검표 ... 12
• 7. 참고문헌 ... 12
• 붙임1. 세부 정량적 연구개발성과 ... 13
• 붙임2. 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 14
• 끝페이지 ... 16