보고서 정보
주관연구기관 |
연세대학교 Yonsei University |
연구책임자 |
김현창
|
참여연구자 |
정선재
,
이호규
,
이혁희
,
김지혜
,
정혜원
,
강정호
,
김연지
,
김대중
,
하경화
,
최선주
,
윤자영
,
박효미
,
김은지
,
문지우
,
서예은
,
김초현
,
송모세
,
이하신
,
최정태
,
안효은
,
이현미
,
진예은
,
이민정
,
윤지현
,
이가빈
,
장혜선
|
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
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발행년월 | 2023-04 |
과제시작연도 |
2022 |
주관부처 |
질병관리청 Korea Disease Control and Prevention Agency(KDCA) |
등록번호 |
TRKO202300028508 |
과제고유번호 |
1776000233 |
사업명 |
국가보건의료연구인프라구축 |
DB 구축일자 |
2023-11-15
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키워드 |
빅데이터.코호트.유전체.오믹스.정밀의료.Bigdata.cohort.omics.genome.precision medicine.
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초록
▼
시범사업 목표: 본 과제의 목표는 2013-2018년 구축된 “심뇌혈관 및 대사질환 원인연구센터(CMERC) 코호트” 참여자들로부터 데이터 및 생체시료 기탁에 대한 동의를 재구득하고, 연구자원을 추가로 확보하여 “국가 통합 바이오 빅데이터 구축 사업(NPBBD)” 연계 등록을 시범적으로 수행하고, 이를 통하여 기 구축 코호트들을 국가 바이오 빅데이터 연구자원으로 전환하기 위한 전략을 제시하는 것임.
기존 코호트의 NPBBD 연계 가능성 검토: CMERC 코호트에서 확보한 기존 동의서와 NPBBD 사업에서 요구하는 동의
시범사업 목표: 본 과제의 목표는 2013-2018년 구축된 “심뇌혈관 및 대사질환 원인연구센터(CMERC) 코호트” 참여자들로부터 데이터 및 생체시료 기탁에 대한 동의를 재구득하고, 연구자원을 추가로 확보하여 “국가 통합 바이오 빅데이터 구축 사업(NPBBD)” 연계 등록을 시범적으로 수행하고, 이를 통하여 기 구축 코호트들을 국가 바이오 빅데이터 연구자원으로 전환하기 위한 전략을 제시하는 것임.
기존 코호트의 NPBBD 연계 가능성 검토: CMERC 코호트에서 확보한 기존 동의서와 NPBBD 사업에서 요구하는 동의 내용을 비교하여, 기존 코호트를 국가 바이오 빅데이터 자원으로 기탁 활용하기 위한 새로운 연구 설명문과 동의서 서식을 개발하였음. 코호트에서 기 확보한 자원과 NPBBD 사업에 필요할 것으로 예상되는 자원을 비교 분석하여, 추적조사로 추가 확보할 데이터와 생체시료를 정의하였음.
NPBBD 연계 등록을 위한 코호트 추적조사: CMERC 코호트에서 추적조사가 가능한 1,500명을 목표로 동의서 구득과 추적 검진조사를 수행 중으로 2023년 4월 24일까지 1,164명 완료함(1,500명 등록까지 검진 조사 지속). 동의서 구득 및 설문조사는 모바일 온라인 설문도구를 개발하여 진행하였으며, 검진은 두 곳의 의료기관에서 진행 중임. 공복 혈액을 채취하여 혈청 3ml, 혈장 3ml, 연막 1ml를 샘플로 제작하여 기탁 예정임. 이차자료 연계 가능성을 확인하기 위하여 병원정보시스템으로부터 과거 영상검사(QCT) 원본 데이터 3,998건을 추출 후 가명처리하여 연구용 데이터레이크에 탑재하였음.
NPBBD 신규 등록 예행 연습: 기존 자료가 없는 새로운 참여자를 NPBBD에 등록할 때 필요한 인프라소요를 확인하기 위하여 CMERC 코호트 참여자 중 50명은 신규 등록에 준하는 수준으로 동의서 구득, 설문조사, 임상검사, 생체시료 확보를 완료하였음. 기존 코호트 자원을 일부 활용하는 연계 등록에 비하여 검진 비용은 1.5배, 시간은 2.6배, 필요 인력은 2배 정도로 추산됨. 설문조사 결과 건강검진 내용과 환경에 대한 만족도는 높으나, 참여 동기는 국가연구사업 기여보다는 건강검진을 받기 위해서가 더 많았음. 응답자의 98%가 기탁한 자원에서 얻은 새로운 건강정보가 있을 경우 결과 환류를 위하여 다시 연락하는 것에 긍정적임.
기존 코호트의 NPBBD 연계 등록 성공을 위한 전략: 기존 코호트 연계 등록의 장점은 비용이나 시간 절감보다는 과거 코호트 데이터를 연계하여 종적 분석이 가능한 것이 더 중요함. 과거 기반조사 결과와 추적조사 검사결과를 비교하면 많은 건강지표에서 유의한 변화를 보여 종적 연구가 가능할 것으로 판단됨. 추적조사 및 NPBBD 연계 등록에 참여율이 낮아지는 주요 원인이 전화 통화 연결이 어려운 것과 검진 일정에 맞추기 어려운 것이어서 참여율 제고를 위한 전략이 필요함. 추적조사 참여자와 미참여자의 특성은 큰 차이가 없어 특정 집단 보다는 전반적인 참여율 제고 전략 개발이 필요함.
기대효과 및 활용방안: 본 사업을 통해서 기 구축 코호트를 “국가 통합 바이오 빅데이터”에 연계 등록하는 모형을 제시하였음. 이를 통해서 정부 재정이 투입되어 구축된 여러 코호트 자료의 활용성을 획기적으로 향상시키고, 연구가치가 높은 장기 추적 데이터를 제공하여 “국가 통합 바이오 빅데이터”의 조기 구축과 성공에 기여할 수 있을 것임.
(출처 : 요약문 4p)
Abstract
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Project Goal: This project aimed to re-obtain written consent for donating health data and samples from the CMERC Cohort (established in 2013-2018), and to register them to the "National Project of Bio-Big Data (NPBBD)". By doing these, we can derive strategies to utilize established cohorts into th
Project Goal: This project aimed to re-obtain written consent for donating health data and samples from the CMERC Cohort (established in 2013-2018), and to register them to the "National Project of Bio-Big Data (NPBBD)". By doing these, we can derive strategies to utilize established cohorts into the resources for the NPBBD project.
Possibility of linkage of existing cohort to NPBBD: Informed consent forms were developed. Additional data and biosamples which were expected to be necessary for the NPBBD project were determined. Follow-up examinations are bieng conducted on a target of 1,500 individuals. As of April 24, 2023, 1,164 individuals have participated in the study. Consent acquisition and survey were conducted using a mobile online survey tool, and health examinations are underway at two medical institutions. Fasting blood samples are collected to secure 3ml serum, 3ml plasma, and 1ml buffy coat for donation. To confirm the possibility of secondary data linkage, 3,998 QCT imaging data were extracted from the hospital information system, anonymized, and loaded into a research data lake.
Pilot practice for NPBBD registration of new participants: Fifty participants from the CMERC cohort completed the consent acquisition, survey, health examination, and biospecimen acquisition required for new registration. The estimated costs of the examinations were approximately 1.5 times higher, time was 2.6 times longer, and personnel requirements were about twice as high for new registration than for linkage registration using existing cohort. Overall satisfaction for health examination was was high. The main motivation for participation was to receive health checkups rather than contribute to national research projects. Most (98%) respondents were positive about being contacted again for result feedback if new health information was obtained from the donated resources.
Strategy for successful linkage of existing cohort to NPBBD: The biggest advantage of linkage registration is the ability to conduct longitudinal data analysis by linking past cohort data. Comparing the results of the past baseline survey with the follow-up investigation results, significant changes were observed in many health indicators, indicating the possibility of longitudinal research. Strategies are needed to improve participation rates as the main reasons for low participation rates are difficulty in telephone contact and scheduling of health examinations. Characteristics of participants and non-participants were similar overall.
Expected outcomes and utilization: This project suggests a model for linking established cohorts to the NPBBD, which will improve the utility of data from government-funded cohort studies, and also will contribute to the success of the NPBBD project with fast and efficient data collection.
(source : Summary 5p)
목차 Contents
- 표지 ... 1
- 제출문 ... 2
- 목차 ... 3
- 요약문 ... 4
- Summary ... 5
- 학술연구개발용역과제 연구결과 ... 6
- 제1장 최종 목표 ... 6
- 1.1 목표 ... 6
- 1.2 목표달성도 및 관련분야에 대한 기여도 ... 31
- 제2장 국내외 기술 현황 ... 32
- 2.1 국외 현황 ... 32
- 2.2 국내 현황 ... 38
- 제3장 최종 연구 내용 및 방법 ... 41
- 3.1. 과제 수행 개요 ... 41
- 3.2. CMERC 코호트 현황 분석 및 국가바이오빅데이터 연계 가능성 검토 ... 42
- 3.3. CMERC 코호트 추적 검진을 통한 국가바이오빅데이터 연계 등록 ... 43
- 3.4. 국가바이오빅데이터 신규 등록에 준하는 수준의 검진 조사 ... 45
- 3.5. 정부지원 기 구축 코호트의 국가바이오빅데이터 연계 등록을 위한 전략 ... 46
- 제4장 최종 연구 결과 ... 47
- 4.1. CMERC 코호트 현황 분석 및 국가바이오빅데이터 연계 가능성 검토 ... 47
- 4.2. CMERC 코호트 참여자 국가바이오빅데이터 동의서 구득 및 추가 연구 자원 확보 ... 53
- 4.3. 국가바이오빅데이터 신규 등록에 준하는 수준의 검진 예행연습 ... 78
- 4.4. 기존 코호트의 국가바이오빅데이터 연계 등록을 위한 전략 도출 ... 85
- 제5장 연구결과 고찰 및 결론 ... 89
- 제6장 연구개발성과의 관리 및 활용계획 ... 94
- 제7장 연구용역과제 진행과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 97
- 제8장 기타 중요변경사항 ... 97
- 제9장 연구비 사용 내역 및 연구원 분담표 ... 99
- 9.1 연구비 사용 내역(2023.05.01까지 사용내역 작성) ... 99
- 9.2 연구분담표 ... 100
- 9.3 연구분담내용 ... 102
- 제10장 참고문헌 ... 103
- 제11장 첨부서류 ... 105
- 끝페이지 ... 115
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