초록 ▼

1차년도: 호흡기감염 결핵/ 비결핵 항산균 특이적 유전체 바이오마커 발굴 및 진단용 NGS 패널 설계
○ 결핵/비결핵 항산균 감염 환자유래 균주 확보
○ 결핵/비결핵 항산균 NGS 시퀀싱을 위한 라이브러리 제작방법 표준화
○ NGS 시퀀싱 데이터 분석 파이프라인 설계 및 개발
○ 결핵/비결핵 항산균 유전체 분석용 데이터베이스 구축 및 분석
○ 결핵/비결핵 항산균 동정 및 항생제 내성 신규 바이오마커 후보 발굴 및 검증
○ NGS 기반의 결핵 객담검사 알고리즘 개발
○ 신규 바이오마커를 활용한 다

1차년도: 호흡기감염 결핵/ 비결핵 항산균 특이적 유전체 바이오마커 발굴 및 진단용 NGS 패널 설계
○ 결핵/비결핵 항산균 감염 환자유래 균주 확보
○ 결핵/비결핵 항산균 NGS 시퀀싱을 위한 라이브러리 제작방법 표준화
○ NGS 시퀀싱 데이터 분석 파이프라인 설계 및 개발
○ 결핵/비결핵 항산균 유전체 분석용 데이터베이스 구축 및 분석
○ 결핵/비결핵 항산균 동정 및 항생제 내성 신규 바이오마커 후보 발굴 및 검증
○ NGS 기반의 결핵 객담검사 알고리즘 개발
○ 신규 바이오마커를 활용한 다중진단용 NGS 패널 시제품 설계
2차년도: 결핵/비결핵 항산균 동정 및 항생제 내성 유전변이 동시-다중진단 시제품 개발과 성능평가
○ 결핵/비결핵 항산균 동정 및 항생제 내성 관련 유전변이 진단을 위한 패널 시제품 제작
○ 표준물질 및 임상검체를 이용한 시제품의 성능시험 수행
○ 기허가 제품 및 NGS 기반 제품과의 성능비교 수행
○ NGS 데이터 분석용 소프트웨어 설계 및 개발
○ NGS 기반의 결핵 객담검사 알고리즘의 임상 적용 평가

(출처 : 요약문 4p)

Abstract ▼

1st Year: Respiratory tuberculosis/non-tuberculous mycobacteria-specific genomic biomarker discovery and NGS panel design for diagnosis
○ Possessing strains derived from tuberculosis/non-tuberculosis mycobacteria-infected patients
○ Standardization of DNA library preparation method for tubercu

1st Year: Respiratory tuberculosis/non-tuberculous mycobacteria-specific genomic biomarker discovery and NGS panel design for diagnosis
○ Possessing strains derived from tuberculosis/non-tuberculosis mycobacteria-infected patients
○ Standardization of DNA library preparation method for tuberculosis/non-tuberculosis mycobacterium NGS sequencing
○ NGS sequencing data analysis pipeline design and development
○ Establishment and analysis of database for tuberculosis/non-tuberculosis mycobacteria genome analysis
○ Identification of tuberculosis/non-tuberculosis mycobacteria and discovery and validation of new biomarker candidates for antibiotic resistance
○ Development of NGS-based tuberculosis sputum test algorithm
○ NGS panel prototype design for multiple diagnostics using new biomarkers

2nd Year: Identification of tuberculosis/non-tuberculous mycobacteria and antibiotic resistance genetic mutation simultaneous-multiple diagnosis prototype development and performance evaluation
○ Production of panel prototypes for the identification of tuberculosis/non-tuberculous mycobacteria and the diagnosis of antibiotic resistance-related genetic mutations
○ Performance testing of prototypes using standard materials and clinical samples
○ Performance comparison with licensed products and NGS-based products
○ Software design and development for NGS data analysis
○ Evaluation of clinical application of NGS-based tuberculosis sputum test algorithm

(source : SUMMARY 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 요약문 ... 4
• SUMMARY ... 5
• 총괄연구개발과제의 연구성과 실적 및 향후 계획 ... 6
• 참여연구원 현황표 ... 9
• 목차 ... 10
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 11
• 1-1. 연구개발과제 개요 ... 11
• 1-2. 연구개발 대상의 국내외 현황 ... 17
• 1-3. 연구개발의 중요성 ... 27
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 29
• 2-1. 주관연구기관 (엔젠바이오) ... 29
• 2-2. 공동연구기관 (결핵연구원) ... 30
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 정도 ... 32
• 3-1. 연구수행결과 ... 32
• 2) 목표 달성 수준 ... 146
• 5. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도 ... 147
• 6. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 147
• 7. 참고문헌 ... 148
• 끝페이지 ... 151