초록 ▼

□ 연구개요
연구 목표: 위암의 복막 전이에 관련된 분자생물학적 마커를 발굴하고 기능을 규명하여 위암 복막 전이가 있는 환자의 맞춤형 약물 반응성 평가 시스템을 구축한다.
• 1년차: 위암 수술시 검체로 확보한 복수(腹水, ascites)를 활용하여 위암의 복막 전이가 있는 환자와 없는 환자의 복수의 유전체 특성을 분석하고 복막 전이에 관련된 분자생물학적 유전자 마커를 발굴 한다.
• 2년차: 전향적으로 확보한 복수 검체를 활용하여 단일세포전사체 분석을 통해 1차년도에 확보한 유전자 마커를 검증하고 복수 organo

□ 연구개요
연구 목표: 위암의 복막 전이에 관련된 분자생물학적 마커를 발굴하고 기능을 규명하여 위암 복막 전이가 있는 환자의 맞춤형 약물 반응성 평가 시스템을 구축한다.
• 1년차: 위암 수술시 검체로 확보한 복수(腹水, ascites)를 활용하여 위암의 복막 전이가 있는 환자와 없는 환자의 복수의 유전체 특성을 분석하고 복막 전이에 관련된 분자생물학적 유전자 마커를 발굴 한다.
• 2년차: 전향적으로 확보한 복수 검체를 활용하여 단일세포전사체 분석을 통해 1차년도에 확보한 유전자 마커를 검증하고 복수 organoid를 수립하여 복막 전이 관련 기전을 규명한다.
• 3년차: 수립된 복수 organoid를 활용해 복막 전이에 관련된 분자생물학적 마커를 검증하고 개인별 약물 반응성 평가를 통해 맞춤형 치료전략을 수립한다.

□ 연구 목표대비 연구결과
1. 복막 전이가 있는 28명 위암 환자 28명에 대해 전이조직 29례, 원발 조직 21례, 정상 조직(또는 혈액) 27례 총 77례의 WGS data 확보하였고 Data QC 후 mutational landscape, signiture, clonality 등의 분석을 완료하여 원발암과 전이암의 유전체 특성을 분석함.
2. 12명의 위암 환자에서 수집된 복수에서 171개의 target gene에 대한 cancer panel을 이용해 복수에서 수집된 세포에서 발견되는 변이를 확인함.
3. 복수 유래 세포의 복막암 특이적인 signature를 분석하고자 7명 위암환자 복수의 단일세포 전사체 분석을 시행하였고 항암치료 여부에 따른 세포 조성의 차이를 확인함
4. 위암환자의 복수 유래 오가노이드를 수립고 이를 활용해 항암제 감수성 평가를 실시하여 악성 복수세포유래 오가노이드의 약물 반응성 평가 플랫폼을 구축함

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
• 본 연구를 통해 확보한 28명의 복막전이를 가진 위암 환자의 원발암 및 전이조직의 전장유전체 및 전사체 데이터를 활용해 전이위암 조직의 분자생물학적 특성을 분석하였고 전이에 따른 종양미세환경의 차이를 확인하였음. 추가적으로 TCGA나 ACRG의 대규모 유전체 연구 데이터와 비교 분석하여 복막전이를 가진 환자의 유전체 특성을 연구하는데 기초 자료로 활용하고자 함.
• 본 연구를 통해 복수 유래 세포의 단일세포 전사체 분석을 시행하였고 항암치료 여부에 따른 세포 조성의 차이를 분석였음. 향후 악성 복수 환자의 항암제 저항성 연구 자료로 활용 하고자 함.
• 위암환자의 복수 유래 오가노이드를 활용한 항암제 감수성 평가 시스템을 수립 하였고 향후 항암제 약물 반응성 스크리닝 플랫폼으로 활용 가능 함.
• 전이가 있는 위암 환자와 전이가 없는 위암 환자의 혈청 내 단백질 스크리닝을 통해 전이 환자에서 유의하게 증가하는 단백질을 확인 하였고 향후 전이성 암 진단 및 예후예측용 바이오마커로 활용 가능.
• 본 연구를 통해 현재까지 장기 생존을 기대하기 어려운 복막 전이 환자의 임상 치료 전략 수립에 기여할 수 있음

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 2.1 위암 수술시 확보한 28명 환자의 WGS data 생산 및 기본 분석 ... 4
• 2.2 WTS 데이터 분석 ... 8
• 2.3 위암환자 복수 (ascites)의 단일세포 전사체 분석 ... 9
• 2.4 위암 수술시 확보한 12명 환자의 복수에서 cancer panel 분석 ... 12
• 2.5 위암 환자의 조직 및 복수 유래 오가노이드 수립 ... 13
• 2.6 위암 오가노이드를 활용한 항암제 반응성 확인 ... 13
• 2.7 HTS 시스템을 이용한 복수 유래 오가노이드의 항암제 약물 반응성 테스트 ... 14
• 2.8 위암 환자의 혈중 단백질 스크리닝을 통한 전이성 암 진단 및 예후예측용 바이오마커 발굴 ... 15
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 16
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 16
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 16
• 3) 목표 달성 수준 ... 16
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 17
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 17
• 6. 자체점검표 ... 18
• 7. 참고문헌 ... 19
• 끝페이지 ... 27