풍란(Neofinetia falcata(Thunb.) Hu)은 난과에 속하며 일속 일 종으로된 Neofinetia 속의 유일한 종이다. 멸종위기종인 풍란의 자생지내 유전다양성을 파악해 보고자 채집된 야생형 풍란종과 이식재배 되어 있는 것, 외국유래의 개체 및 풍란의 비교군을 포함하여 RAPD와 ITS염기서열 및 ETS 염기서열 분석을 실시 하였다. RAPD분석 결과 2개의 primer에서 야생형 풍란의 개체에만 각각 1884bp, 1540bp 에 위치한 band가 뚜렷하게 나타났다. ITS 염기서열 분석에서는 분석결과 ITS1은 225-235bp, 5.8S는 162bp, ITS2는 256-261bp로 나타났다. ITS1 region은 풍란 분류군간에 염기변화(T→C, 80bp)가 나타났지만 5.8S와 ITS2 region은 염기변화가 나타나지 않았다. ETS 염기서열 분석에서 ETS region은 295bp-354bp로 나타났지만 ITS 염기서열 분석에서와 마찬가지로 야생형 풍란개체군과과 조직배양이나 이식재배한 풍란개체군간에 염기의 변화가 존재하지 않았다. RAPD 분석방법은 풍란의 ...
풍란(Neofinetia falcata(Thunb.) Hu)은 난과에 속하며 일속 일 종으로된 Neofinetia 속의 유일한 종이다. 멸종위기종인 풍란의 자생지내 유전다양성을 파악해 보고자 채집된 야생형 풍란종과 이식재배 되어 있는 것, 외국유래의 개체 및 풍란의 비교군을 포함하여 RAPD와 ITS염기서열 및 ETS 염기서열 분석을 실시 하였다. RAPD분석 결과 2개의 primer에서 야생형 풍란의 개체에만 각각 1884bp, 1540bp 에 위치한 band가 뚜렷하게 나타났다. ITS 염기서열 분석에서는 분석결과 ITS1은 225-235bp, 5.8S는 162bp, ITS2는 256-261bp로 나타났다. ITS1 region은 풍란 분류군간에 염기변화(T→C, 80bp)가 나타났지만 5.8S와 ITS2 region은 염기변화가 나타나지 않았다. ETS 염기서열 분석에서 ETS region은 295bp-354bp로 나타났지만 ITS 염기서열 분석에서와 마찬가지로 야생형 풍란개체군과과 조직배양이나 이식재배한 풍란개체군간에 염기의 변화가 존재하지 않았다. RAPD 분석방법은 풍란의 재배종과 야생종사이에 야생종에만 나타나는 특이한 band가 나타나 종내 개체군의 유연관계규명에 유용하게 사용되었다. ITS 염기서열 분석과 ETS 염기서열 분석에서는 ITS 염기서열 중 ITS1부분에는 염기변화가 존재하였지만 ITS2와 5.8S 부분 그리고 ETS region의 염기변화가 존재하지 않아 풍란종내 개체군의 유연관계를 규명하기에는 적합하지 않았다.
풍란(Neofinetia falcata(Thunb.) Hu)은 난과에 속하며 일속 일 종으로된 Neofinetia 속의 유일한 종이다. 멸종위기종인 풍란의 자생지내 유전다양성을 파악해 보고자 채집된 야생형 풍란종과 이식재배 되어 있는 것, 외국유래의 개체 및 풍란의 비교군을 포함하여 RAPD와 ITS 염기서열 및 ETS 염기서열 분석을 실시 하였다. RAPD분석 결과 2개의 primer에서 야생형 풍란의 개체에만 각각 1884bp, 1540bp 에 위치한 band가 뚜렷하게 나타났다. ITS 염기서열 분석에서는 분석결과 ITS1은 225-235bp, 5.8S는 162bp, ITS2는 256-261bp로 나타났다. ITS1 region은 풍란 분류군간에 염기변화(T→C, 80bp)가 나타났지만 5.8S와 ITS2 region은 염기변화가 나타나지 않았다. ETS 염기서열 분석에서 ETS region은 295bp-354bp로 나타났지만 ITS 염기서열 분석에서와 마찬가지로 야생형 풍란개체군과과 조직배양이나 이식재배한 풍란개체군간에 염기의 변화가 존재하지 않았다. RAPD 분석방법은 풍란의 재배종과 야생종사이에 야생종에만 나타나는 특이한 band가 나타나 종내 개체군의 유연관계규명에 유용하게 사용되었다. ITS 염기서열 분석과 ETS 염기서열 분석에서는 ITS 염기서열 중 ITS1부분에는 염기변화가 존재하였지만 ITS2와 5.8S 부분 그리고 ETS region의 염기변화가 존재하지 않아 풍란종내 개체군의 유연관계를 규명하기에는 적합하지 않았다.
Neofinetia falcata (Thunb.) Hu, a monotypic species in Orchidaceae, is distributed in subtropical and temperate region of Far Eastern Asia. Also it is designated to a rare and endangered species to be disappeared in Korea. We had performed genetic analyses among the wild types in natural habitat, th...
Neofinetia falcata (Thunb.) Hu, a monotypic species in Orchidaceae, is distributed in subtropical and temperate region of Far Eastern Asia. Also it is designated to a rare and endangered species to be disappeared in Korea. We had performed genetic analyses among the wild types in natural habitat, the transplanted and cultivated ones, and others from China and Japan. Based on molecular genetic analyses by RAPD and nuclear ribosomal DNA ITS/ETS sequence data, the genetic diversity and systematic relationship amomg the OTUs of Neofinetia falcata had been discussed. Based on RAPD analyses, two index markers with two primers to distinguish the wild types from others were obtained which are located on 1884bp and 1540bp, respectively. Based on the nRDNA ITS and ETS sequences results, there were no base substitution in ETS, ITS2 and 5.8S region. And we could not confirmed special significant variations among the Neofinetia falcata OTUs from ITS and ETS sequences data. In this study, RAPD analyses were useful to elucidate the genetic relationships among Neofinetia falcata populations. And nrDNA ITS and ETS sequences could not be applied to discuss the phylogenetic relationships among the treated taxa even ITS1 region had several variations.
Neofinetia falcata (Thunb.) Hu, a monotypic species in Orchidaceae, is distributed in subtropical and temperate region of Far Eastern Asia. Also it is designated to a rare and endangered species to be disappeared in Korea. We had performed genetic analyses among the wild types in natural habitat, the transplanted and cultivated ones, and others from China and Japan. Based on molecular genetic analyses by RAPD and nuclear ribosomal DNA ITS/ETS sequence data, the genetic diversity and systematic relationship amomg the OTUs of Neofinetia falcata had been discussed. Based on RAPD analyses, two index markers with two primers to distinguish the wild types from others were obtained which are located on 1884bp and 1540bp, respectively. Based on the nRDNA ITS and ETS sequences results, there were no base substitution in ETS, ITS2 and 5.8S region. And we could not confirmed special significant variations among the Neofinetia falcata OTUs from ITS and ETS sequences data. In this study, RAPD analyses were useful to elucidate the genetic relationships among Neofinetia falcata populations. And nrDNA ITS and ETS sequences could not be applied to discuss the phylogenetic relationships among the treated taxa even ITS1 region had several variations.
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