본 연구는 고온다습조건의 환경에서 단기 콩 재배 시 문제가 되고 있는 콩 미이라병 내병성 육종의 기초를 확립하고자 마커를 이용하여 유전자 연관군 지도를 작성하고, 유전적 다양성을 탐색하였다.
우리나라에서 미이라병에 감수성 품종인 화엄풋콩과 저항성품종으로 알려진 PI 417479를 교배한 F₂ 집단에 인위적으로 미이라병을 접종시킨 후 발병도를 평가한 결과 여교잡 후대 BC₂F₂ 의 유전적 분리비가 3:1로 나타났으며 2002년도에 본교 실험실에서 조사한 미이라병 유전적 분리비가 9:7로 나타난 연구결과를 종합해 볼 때, 미이라병과 관련된 저항성 유전자는 한 개 혹은 두 개의 ...
본 연구는 고온다습조건의 환경에서 단기 콩 재배 시 문제가 되고 있는 콩 미이라병 내병성 육종의 기초를 확립하고자 마커를 이용하여 유전자 연관군 지도를 작성하고, 유전적 다양성을 탐색하였다.
우리나라에서 미이라병에 감수성 품종인 화엄풋콩과 저항성품종으로 알려진 PI 417479를 교배한 F₂ 집단에 인위적으로 미이라병을 접종시킨 후 발병도를 평가한 결과 여교잡 후대 BC₂F₂ 의 유전적 분리비가 3:1로 나타났으며 2002년도에 본교 실험실에서 조사한 미이라병 유전적 분리비가 9:7로 나타난 연구결과를 종합해 볼 때, 미이라병과 관련된 저항성 유전자는 한 개 혹은 두 개의 우성유전자로 인해 발현된다고 사료된다.
교잡 후대 F₂ 집단(F₂, BC₁F₂, BC₂F₂)으로부터 genome DNA를 추출한 후 AFLP분석은 18개의 primer 조합중 모부본간 polymorphism양상을 보이는 11개의 primer 조합을 선발하여 분석을 수행하였다. 선발된 마커를 토대로 연관지도를 작성한 결과 F₂, BC₁F₂, BC₂F₂ 순으로 각각 83.6cM, 69.7cM, 12.8cM, 의 연관거리를 나타내었다. 미이라병 저항성 유전자와의 상관관계를 분석한 결과 AF4 primer가 81.6%로 가장 가깝게 연관되어 있을 것이라 판단되었다.
콩 식물체 연관군 Linkage F group내 43개의 SSR primer를 주문제작, 모부본간 polymorphism을 나타내는 9개의 primer를 선발하여 분석을 수행하였다. 선발된 마커를 토대로 연관지도를 작성한 결과 F₂, BC₁F₂, BC₂F₂ 순으로 각각 294.1cM, 70.1cM, 12.2cM, 의 연관거리를 나타내었다. 선발된 9개의 primer 중 미이라병 저항성 유전자와의 상관관계를 분석한 결과 Sct_033이 80.27%로 가장 가깝게 연관되어 있을 것이라 판단되었다.
콩 미이라병 저항성과 관련이 있을 것으로 추정되는 SSR marker와 AFLP marker를 통합하여 확인하여 본 결과, 콩미이라병 저항성 유전자와 관련되었다고 보기에는 여러 가지 문제점이 많다고 할 수 있었다. 선발된 SSR marker와 AFLP marker 간에는 큰 연관성이 없어 보였다. 따라서 연관성 있게 통합된 marker들 간의 추후 탐색도 이뤄져야 할 것으로 사료된다.
본 연구는 고온다습조건의 환경에서 단기 콩 재배 시 문제가 되고 있는 콩 미이라병 내병성 육종의 기초를 확립하고자 마커를 이용하여 유전자 연관군 지도를 작성하고, 유전적 다양성을 탐색하였다.
우리나라에서 미이라병에 감수성 품종인 화엄풋콩과 저항성품종으로 알려진 PI 417479를 교배한 F₂ 집단에 인위적으로 미이라병을 접종시킨 후 발병도를 평가한 결과 여교잡 후대 BC₂F₂ 의 유전적 분리비가 3:1로 나타났으며 2002년도에 본교 실험실에서 조사한 미이라병 유전적 분리비가 9:7로 나타난 연구결과를 종합해 볼 때, 미이라병과 관련된 저항성 유전자는 한 개 혹은 두 개의 우성유전자로 인해 발현된다고 사료된다.
교잡 후대 F₂ 집단(F₂, BC₁F₂, BC₂F₂)으로부터 genome DNA를 추출한 후 AFLP분석은 18개의 primer 조합중 모부본간 polymorphism양상을 보이는 11개의 primer 조합을 선발하여 분석을 수행하였다. 선발된 마커를 토대로 연관지도를 작성한 결과 F₂, BC₁F₂, BC₂F₂ 순으로 각각 83.6cM, 69.7cM, 12.8cM, 의 연관거리를 나타내었다. 미이라병 저항성 유전자와의 상관관계를 분석한 결과 AF4 primer가 81.6%로 가장 가깝게 연관되어 있을 것이라 판단되었다.
콩 식물체 연관군 Linkage F group내 43개의 SSR primer를 주문제작, 모부본간 polymorphism을 나타내는 9개의 primer를 선발하여 분석을 수행하였다. 선발된 마커를 토대로 연관지도를 작성한 결과 F₂, BC₁F₂, BC₂F₂ 순으로 각각 294.1cM, 70.1cM, 12.2cM, 의 연관거리를 나타내었다. 선발된 9개의 primer 중 미이라병 저항성 유전자와의 상관관계를 분석한 결과 Sct_033이 80.27%로 가장 가깝게 연관되어 있을 것이라 판단되었다.
콩 미이라병 저항성과 관련이 있을 것으로 추정되는 SSR marker와 AFLP marker를 통합하여 확인하여 본 결과, 콩미이라병 저항성 유전자와 관련되었다고 보기에는 여러 가지 문제점이 많다고 할 수 있었다. 선발된 SSR marker와 AFLP marker 간에는 큰 연관성이 없어 보였다. 따라서 연관성 있게 통합된 marker들 간의 추후 탐색도 이뤄져야 할 것으로 사료된다.
The use of molecular markers allows for an efficient selection in early generations of the breeding process because they are not affected by the enviornment.
Phomopsis seed decay (PSD) is a part of major disease complex found in most soybean production areas of the world. PSD is a common contributou...
The use of molecular markers allows for an efficient selection in early generations of the breeding process because they are not affected by the enviornment.
Phomopsis seed decay (PSD) is a part of major disease complex found in most soybean production areas of the world. PSD is a common contributour to reduce soybean seed quality, particularly when maturation occurs during periods of high humidity and high temperature. Genetic segregation ratio were examined and genetic linkage map using DNA markers such as SSR and AFLP were surveyed for polymorphism between resistant cultivar PI 417479 and susceptible cultivar Hwaeomput-kong to PSD.
F₂ group (F₂, BC₁F₂ and BC₂F₂) crossed Hwaeomput-kong and PI 417479 were inoculated to PSD artificially. Genetic segregation ratio based on disease severity of seeds from inoculated PSD was proved to be 3:1 and 9:7, that indicated PSD resistant inheritance is controlled one or two dominant genes.
In AFLP analysis, 11 primer combinations shown polymorphisms between parent varities. AFLP analysis was performed with genomic DNA extracted from F₂ group (F₂, BC₁F₂, BC₂F₂). To establish genetic map for resistance to PSD, selected 10 AFLP markers were mapped with genetic distance 83.6cM, 238.5cM and 12.8cM in F₂ group (F₂, BC₁F₂ and BC₂F₂), respectively. AF4 primer would be closely related with PSD resistance gene among 10 primers selected as the result of 80.27% correlation.
SSR analysis was performed with genomic DNA extracted from F₂ group (F₂, BC₁F₂, BC₂F₂). Among the total of 43 F linkage group, 9 SSR markers were selected for parental polymorphism to PSD and the genetic group was mapped with genetic distance, respectively, 294.1cM, 70.1cM and 12.2cM in F₂ group (F₂, BC₁F₂ and BC₂F₂). Sct_033 would be closely related with PSD resistance gene among 9 primers selected as the result of 80.27% correlation.
It may be concluded that identification of markers would be efficient tools for selecting resistant plants in early segreating populations and expending the development of resistant cultivars in soybean breeding programs.
The use of molecular markers allows for an efficient selection in early generations of the breeding process because they are not affected by the enviornment.
Phomopsis seed decay (PSD) is a part of major disease complex found in most soybean production areas of the world. PSD is a common contributour to reduce soybean seed quality, particularly when maturation occurs during periods of high humidity and high temperature. Genetic segregation ratio were examined and genetic linkage map using DNA markers such as SSR and AFLP were surveyed for polymorphism between resistant cultivar PI 417479 and susceptible cultivar Hwaeomput-kong to PSD.
F₂ group (F₂, BC₁F₂ and BC₂F₂) crossed Hwaeomput-kong and PI 417479 were inoculated to PSD artificially. Genetic segregation ratio based on disease severity of seeds from inoculated PSD was proved to be 3:1 and 9:7, that indicated PSD resistant inheritance is controlled one or two dominant genes.
In AFLP analysis, 11 primer combinations shown polymorphisms between parent varities. AFLP analysis was performed with genomic DNA extracted from F₂ group (F₂, BC₁F₂, BC₂F₂). To establish genetic map for resistance to PSD, selected 10 AFLP markers were mapped with genetic distance 83.6cM, 238.5cM and 12.8cM in F₂ group (F₂, BC₁F₂ and BC₂F₂), respectively. AF4 primer would be closely related with PSD resistance gene among 10 primers selected as the result of 80.27% correlation.
SSR analysis was performed with genomic DNA extracted from F₂ group (F₂, BC₁F₂, BC₂F₂). Among the total of 43 F linkage group, 9 SSR markers were selected for parental polymorphism to PSD and the genetic group was mapped with genetic distance, respectively, 294.1cM, 70.1cM and 12.2cM in F₂ group (F₂, BC₁F₂ and BC₂F₂). Sct_033 would be closely related with PSD resistance gene among 9 primers selected as the result of 80.27% correlation.
It may be concluded that identification of markers would be efficient tools for selecting resistant plants in early segreating populations and expending the development of resistant cultivars in soybean breeding programs.
주제어
#Phomopsis seed decay
#DNA marker
#Genetic linkage group
#SSR
#AFLP
학위논문 정보
저자
남시훈
학위수여기관
순천향대학교 일반대학원
학위구분
국내석사
학과
식물자원학과
지도교수
김용호
발행연도
2007
총페이지
ⅲ, 36 p.
키워드
Phomopsis seed decay,
DNA marker,
Genetic linkage group,
SSR,
AFLP
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