p21 단백질의 변이는 세포 주기 조절에 변화를 가져와 정상세포가 암세포로 변성되도록 만든다.p21 유전자의 다형성은 p21 단백질의 생산과 활동성에 영향을 줄 것이다. 따라서 p21 유전자의 다형성은 폐암에 대한 감수성을 조절 할 것으로 생각 되어 본 연구를 하였다. 다른 연구에서 p21다형성과 폐암 ...
p21 단백질의 변이는 세포 주기 조절에 변화를 가져와 정상세포가 암세포로 변성되도록 만든다.p21 유전자의 다형성은 p21 단백질의 생산과 활동성에 영향을 줄 것이다. 따라서 p21 유전자의 다형성은 폐암에 대한 감수성을 조절 할 것으로 생각 되어 본 연구를 하였다. 다른 연구에서 p21다형성과 폐암 위험도 사이 연관성을 조사하였지만, 대부분의 연구는 S31R다형성만 조사 하였다. 그래서 p21유전자에 페암의 위험도에 영향을 줄 가능성이 있는 기능적 다형성을 평가하였다.
첫째로, p21 유전자의 exons, promoter, 및 3' UTR 부위에 위치하는 6개 SNP를 27명의 건강한 한국인을 대상으로 빈도조사와 haplotype-tagging 분석하였다. 여기서 연관불균형이 있는 SNP를 제외한 3개의 SNP (- 2266G> A, S31R 및 IVS2+16G> C)에 대한 case-control 연구를 수행하였다.
p21 -2266G>A에서는 적어도 1개의 -2266A 대립 유전자를 가질 경우 -2266 GG 유전자형과 비교하여 폐암의 위험도가 현저하게 감소하였다. (adjusted OR = 0.71, 95% CI = 0.53-0.95, P = 0.02). S31R 및 IVS2+16G>C는 강한 연관불균형이 있었고, haplotypes (ht2-4)을 가지는 31R는 또는 IVS2+16C 대립 유전자는 wild-type 대립유전자를 가지는 haplotype 31S/IVS2+16G (ht1)와 비교하여 폐암의 위험도가 현저하게 감소하였다. (adjusted OR = 0.65, 95% CI = 0.50-0.83, P= 0.007). -2266A 대립 유전자 및 ht2-4가 방어적인 대립 유전자이라고 여겨질 때, 폐암의 위험도는 방어적인 대립 유전자의 수가 증가한 만큼 줄었다 (P = 0.0002). 0-1개 방어적인 대립 유전자를 가진 group과 비교하여 2개의 방어적인 대립 유전자를 가진 group은 폐암의 위험도가 40%감소하였고,(adjusted OR = 0.60, 95% CI = 0.44-0.82, P = 0.001) 3-4개의 방어적인 대립 유전자를 가진 group에서는 폐암의 위험도가 52%감소하였다.(adjusted OR = 0.48, 95% CI = 0.33-0.71, P = 0.0002). 이 결과는 이들 3개의 p21다형성의 조합된 형질이 단 하나 다형성의 형질 보다는 폐암에 대한 위험도가 더 클 가능성이 있음을 의미한다.
p21 단백질의 변이는 세포 주기 조절에 변화를 가져와 정상세포가 암세포로 변성되도록 만든다.p21 유전자의 다형성은 p21 단백질의 생산과 활동성에 영향을 줄 것이다. 따라서 p21 유전자의 다형성은 폐암에 대한 감수성을 조절 할 것으로 생각 되어 본 연구를 하였다. 다른 연구에서 p21다형성과 폐암 위험도 사이 연관성을 조사하였지만, 대부분의 연구는 S31R다형성만 조사 하였다. 그래서 p21유전자에 페암의 위험도에 영향을 줄 가능성이 있는 기능적 다형성을 평가하였다.
첫째로, p21 유전자의 exons, promoter, 및 3' UTR 부위에 위치하는 6개 SNP를 27명의 건강한 한국인을 대상으로 빈도조사와 haplotype-tagging 분석하였다. 여기서 연관불균형이 있는 SNP를 제외한 3개의 SNP (- 2266G> A, S31R 및 IVS2+16G> C)에 대한 case-control 연구를 수행하였다.
p21 -2266G>A에서는 적어도 1개의 -2266A 대립 유전자를 가질 경우 -2266 GG 유전자형과 비교하여 폐암의 위험도가 현저하게 감소하였다. (adjusted OR = 0.71, 95% CI = 0.53-0.95, P = 0.02). S31R 및 IVS2+16G>C는 강한 연관불균형이 있었고, haplotypes (ht2-4)을 가지는 31R는 또는 IVS2+16C 대립 유전자는 wild-type 대립유전자를 가지는 haplotype 31S/IVS2+16G (ht1)와 비교하여 폐암의 위험도가 현저하게 감소하였다. (adjusted OR = 0.65, 95% CI = 0.50-0.83, P= 0.007). -2266A 대립 유전자 및 ht2-4가 방어적인 대립 유전자이라고 여겨질 때, 폐암의 위험도는 방어적인 대립 유전자의 수가 증가한 만큼 줄었다 (P = 0.0002). 0-1개 방어적인 대립 유전자를 가진 group과 비교하여 2개의 방어적인 대립 유전자를 가진 group은 폐암의 위험도가 40%감소하였고,(adjusted OR = 0.60, 95% CI = 0.44-0.82, P = 0.001) 3-4개의 방어적인 대립 유전자를 가진 group에서는 폐암의 위험도가 52%감소하였다.(adjusted OR = 0.48, 95% CI = 0.33-0.71, P = 0.0002). 이 결과는 이들 3개의 p21다형성의 조합된 형질이 단 하나 다형성의 형질 보다는 폐암에 대한 위험도가 더 클 가능성이 있음을 의미한다.
Although several studies have investigated the association between p21 polymorphisms and the risk of lung cancer, most studies have focused on the S31R polymorphism and the results have been inconsistent. I therefore aimed to comprehensively evaluate potential functional polymorphisms in the p21 gen...
Although several studies have investigated the association between p21 polymorphisms and the risk of lung cancer, most studies have focused on the S31R polymorphism and the results have been inconsistent. I therefore aimed to comprehensively evaluate potential functional polymorphisms in the p21 gene in relation to the risk of lung cancer.
First, I determined the frequencies and haplotype-tagging status of polymorphisms located in the exons, promoter, and 3’UTR region of the p21 gene in 27 healthy Koreans, and then examined three polymorphisms (-2266G>A, S31R, and IVS2+16G>C), based on their frequencies and haplotype-tagging status, in a case-control study.
Individuals with at least one -2266A allele were at a significantly decreased risk of lung cancer compared with those harboring the -2266 GG genotype (adjusted OR = 0.71, 95% CI = 0.53-0.95, P = 0.02). The S31R and IVS2+16G>C were in strong LD, and the haplotypes (ht2-4) carrying 31R or IVS2+16C alleles were associated with a significantly decreased risk of lung cancer compared with the haplotype 31S/IVS2+16G (ht1), which carried wild-type alleles at both loci (adjusted OR = 0.65, 95% CI = 0.50-0.83, P= 0.007). When the -2266A allele and ht2-4 were considered protective alleles, the risk of lung cancer decreased in a dose-dependent manner as the number of protective alleles increased (P = 0.0002). Compared with subjects with zero or one protective alleles, subjects with two protective allele were at a 40% reduced risk of lung cancer (adjusted OR = 0.60, 95% CI = 0.44-0.82, P = 0.001), and subjects with three or four protective alleles were at a 52% reduced risk of lung cancer (adjusted OR = 0.48, 95% CI = 0.33-0.71, P = 0.0002).
These results suggest that a combined analysis of these three p21polymorphisms might better predict the risk of lung cancer than analysis of a single polymorphism.
Although several studies have investigated the association between p21 polymorphisms and the risk of lung cancer, most studies have focused on the S31R polymorphism and the results have been inconsistent. I therefore aimed to comprehensively evaluate potential functional polymorphisms in the p21 gene in relation to the risk of lung cancer.
First, I determined the frequencies and haplotype-tagging status of polymorphisms located in the exons, promoter, and 3’UTR region of the p21 gene in 27 healthy Koreans, and then examined three polymorphisms (-2266G>A, S31R, and IVS2+16G>C), based on their frequencies and haplotype-tagging status, in a case-control study.
Individuals with at least one -2266A allele were at a significantly decreased risk of lung cancer compared with those harboring the -2266 GG genotype (adjusted OR = 0.71, 95% CI = 0.53-0.95, P = 0.02). The S31R and IVS2+16G>C were in strong LD, and the haplotypes (ht2-4) carrying 31R or IVS2+16C alleles were associated with a significantly decreased risk of lung cancer compared with the haplotype 31S/IVS2+16G (ht1), which carried wild-type alleles at both loci (adjusted OR = 0.65, 95% CI = 0.50-0.83, P= 0.007). When the -2266A allele and ht2-4 were considered protective alleles, the risk of lung cancer decreased in a dose-dependent manner as the number of protective alleles increased (P = 0.0002). Compared with subjects with zero or one protective alleles, subjects with two protective allele were at a 40% reduced risk of lung cancer (adjusted OR = 0.60, 95% CI = 0.44-0.82, P = 0.001), and subjects with three or four protective alleles were at a 52% reduced risk of lung cancer (adjusted OR = 0.48, 95% CI = 0.33-0.71, P = 0.0002).
These results suggest that a combined analysis of these three p21polymorphisms might better predict the risk of lung cancer than analysis of a single polymorphism.
Keyword
#p21
#Polymorphism
#Lung cancer
#Genetic susceptibility
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