[학위논문]Biochemical Characterization and Biotechnological Application of Carotenoid Biosynthesis Genes from the Marine Bacterium, Paracoccus haeundaensis원문보기
카로티노이드 (carotenoid)는 C_(40) 이소프레노이드 화합물 (isoprenoid compounds)로서 생리활성물질이며 대단히 유용한 색소 군이다. 카로티노이드는 분자 구조에 따라 노란색, 적색, 주홍색, 주황색 등 여러 색으로 존재한다. 그 예로는 β-카로틴(β-carotene; 당근의 주황색 색소), 라이코펜(lycopene; 토마토의 적색 색소), 푸코잔틴(fucoxanthin; 해조류의 황갈색 또는 갈색 색소), ...
카로티노이드 (carotenoid)는 C_(40) 이소프레노이드 화합물 (isoprenoid compounds)로서 생리활성물질이며 대단히 유용한 색소 군이다. 카로티노이드는 분자 구조에 따라 노란색, 적색, 주홍색, 주황색 등 여러 색으로 존재한다. 그 예로는 β-카로틴(β-carotene; 당근의 주황색 색소), 라이코펜(lycopene; 토마토의 적색 색소), 푸코잔틴(fucoxanthin; 해조류의 황갈색 또는 갈색 색소), 아스타잔틴(astaxanthin; 3, 3'-dihydroxy-β,β-carotene-4, 4'-dione) 등이 있다. 카로티노이드는 인체내에서 비타민 A의 전구체로서의 역할을 하며, 산화 방지효과와 유해 산소 소거작용, 암세포의 증식 억제작용 및 발암 억제작용이 강하여 순환기 질환, 암 및 성인병 등을 예방하는 효능을 가진 것으로 알려져있다. 최근에는 카로티노이드가 직접적인 자외선에 의한 신체의 면역기능을 향상시켜 자외선 노출로부터 피부의 손상을 줄여주거나 멜라닌 생성을 억제함이 밝혀지면서 유럽이나 미국에서 미용 소재로 각광을 받기 시작했다. 현재 카로티노이드는 건강식품 소재(영양 보충제), 보조 및 치료용 약품 및 약제재 첨가물, 식품 착색제 또는 특수기능성사료 첨가제 등으로 사용되고 있다. 본 연구에서는 호기성, 비운동성, 그람 음성, 오렌지색을 띄는, 간균 형태의 해운대 연안에서 분리.동정되어진 파라코커스 해운댄시스 (Paracoccus haeundaensis)로 부터 분리되어진 카로티노이드 생합성 유전자들을 이용하여 카로티노이드를 대량생산하여 분리·정제 후 각 효소의 특성을 분석하는 연구와 생물공학적 방법을 이용하여 대장균형질전환체와 파라코커스 해운댄시스 돌연변이체를 이용하여 아스타잔틴의 생산을 극대화 시키는 연구 및 카로티노이드를 생합성하는 새로운 균주를 동정하는 것을 목적으로 하였다. 파라코커스 해운댄시스는 아스타잔틴을 생성하는 호기성, 비운동성, 그람 음성, 오렌지색을 띄는, 간균 형태의 해양성 세균이다. 파라코커스 해운댄시스에서 아스타잔틴 생합성에 관여하는 유전자는 6개의 유전자군으로 구성되어 있으며, 이들은 다음과 같다. geranylgeranyl diphosphate synthase (CrtE), phytoene synthase (CrtB), phytoene dehydrogenase (CrtI), lycopene cyclase (CrtY), ß-carotene hydroxylase(CrtZ)와 β-carotene ketolase (CrtW) 이다. 이들 유전자군이 생합성하는 카로티노이드 중 zeaxanthin의 hydroxy group에 glucose를 연결시켜 zeaxathin diglucoside를 생합성하는 효소인 zeaxanthin glucosyltransferase(crtX)를 클로닝 하였다. crtX 유전자의 염기서열은 (Genebank, EU431079) 1248 bp 이며 415 아미노산을 암호화하고 있다. Paracoccus haeundaensis의 CrtX 아미노산과 NCBI에 등록된 다른 종들의 CrtX 아미노산의 상동성 비교 시 Lyngbya sp. PCC 8106의 CrtX 아미노산과 95%로 가장 유사하였다. 또한, 대장균 BL21(DE3) 균주에서 zeaxanthin diglucoside 생합성 하기 위해 zeaxanthin glycosylase 상위 생합성 유전자인 crtZ, crtY, crtI, crtB와 crtE의 5개 유전자를 연결하여 pET-vector를 이용하여 pET-EBIYZ 재조합 DNA 구축하였다. 또한 crtX 유전자와 pST29-vector를 이용하여 pSTCRT_X 재조합 DNA 완성하여 이를 공발현시켜 대장균 내에서 zeaxanthin diglucoside가 생합성 됨을 HPLC을 통하여 확인하였다. 파라코커스 해운댄시스의 카로티노이드 생합성 유전자군의 각 유전자의 효소학적 특성을 분석하기 위하여 발현 벡터인 pET-44a(+) 벡터에 각 유전자를 클로닝하였다. 각 crtW, crtZ, crtY, crtI, crtB, crtE 유전자와 3’ 말단에 6개의 Histidine를 포함하는 플라스미드에서 생산하는 재조합 단백질은 각각 분자량이 27 kDa, 18 kDa, 42 kDa, 55 kDa,33 kDa, 30 kDa 이었다. 각각의 단백질을 affinity chromatography를 이용하여 정제하였으며, HPLC로 분석한 결과 각각의 단백질들은 효소학적 활성을 갖고 있었다. 아스타잔틴의 생산성을 증가시키기 위해서 이소프레노이드 생합성 유전자를 대장균에서 클로닝하여 아스타잔틴 생합성 유전자군과 공발현 시키는 방법과 파라코커스 해운댄시스를 물리적, 화학적 방법을 이용하여 돌연변이체를 유도하여 아스타잔틴 생산량 극대화를 유도하였다. 이를 위해서 대장균으로부터 이소프레노이드 생합성 경로에 관여하는 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase (lytB), farnesyl diphosphate (FPP) synthase (ispA), isopentenyl (IPP) diphossphate isomerase (idi) 유전자들을 클로닝 하였고, 이들 유전자를 (pCR-XL-TOPO-Crt-full)와 같이 대장균에 각각 공발현 시켰다. idi 유전자와 아스타잔틴 생산에 관여하는 아스타잔틴 생합성 유전자군이 함께 형질 전환된 BL21(DE3) Codon Plus 대장균를 배양하였을 때, 건조중량으로 1200 ㎍/g의 아스타잔틴을 생산하였다. 또한, 돌연변이체 유도를 위하여 자외선 조사와 EMS를 처리를 병행하여 파라코커스 해운댄시스의 돌연변이주 (PUE)를 만들었으며, PUE와 파라코커스 해운댄시스 (Wild type)의 아스타잔틴 생산량을 비교하면 각각 건조중량으로 204.84 ㎍/g와 53.57 ㎍/g 이었다. 따라서 본 연구 결과, 아스타잔틴 생합성 유전자 군만 형질전환 시킨 대장균보다 이소프레노이드 생합성 유전자와 아스타잔틴 생합성 유전자군을 공발현 시킨 대장균 형질전환체에서 아스타잔틴의 생산량이 3배 증가하였다. 또한, 파라코커스 해운댄시스와 돌연변이주의 아스타잔틴 생산량 또한 돌연변이주에서 야생균주보다 아스타잔틴을 3배 정도 더 생산함을 확인하였다. 본 연구에 사용된 파라코커스 해운댄시스를이외에도 카로티노이드계 색소군을 생성하는 균주를 찾기 위하여 부산 광안리에서 샘플을 채취하여 호기성, 비운동성, 그람 양성, 핑크-오렌지색을 띄는, 구균형태의 신 해양 세균을 한국의 광안리 연안에서 분리하였다. SJ2^(T)로 명명한 이 균주는 핑코-오렌지색의 색소군을 생성하였다. 성장시 최적온도와 최적 pH는 27℃와 pH 8 이었으며, 이 균주는 0-7% (w/v)의 염농도에서도 성장한다. 파라코커스 속에 속하는 모든 기준균주와 SJ2^(T)의 16S rDNA의 서열분석, 지방산 분석, 생화학 테스트의 결과 새로운 종인 코크리아 광안리엔스 (Kocuria gwangalliensis)로 분류하게 되었다. 이렇게 동정하여 분류한 기준주 (type strain)는 SJ2^(T)(=KCCM 42914 ^(T)=LMG 24672^(T)) 이다. 결론적으로 본 연구는 파라코커스 해운댄시스에서 분리된 카로티노이드 생합성 유전자군을 이용하여 대장균에서 대량발현 시켜 재조합단백질들을 분리·정제하여 효소학적 특성을 연구 하였고, 생물공학적기법을 이용하여 아스타잔틴의 생산량을 극대화 시키는 연구를 위하여 이소프로이드 생합성 유전자와 아스타잔틴 생합성 유전군을 이용하여 대장균에서 공발현하는 방법과 파라코커스 해운댄시스의 돌연변이주를 이용하여 균체에서 아스타잔틴의 생산량을 극대화 시키는 연구를 하였다. 또한, 파라코커스 해운댄시스를 이외에도 색소군을 생합성하는 새로운 균주를 찾기 위해서 광안리 연안에서 샘플을 채집하여 코크리아 광안리엔스 (Kocuria gwangalliensis)로 동정하였다.
카로티노이드 (carotenoid)는 C_(40) 이소프레노이드 화합물 (isoprenoid compounds)로서 생리활성물질이며 대단히 유용한 색소 군이다. 카로티노이드는 분자 구조에 따라 노란색, 적색, 주홍색, 주황색 등 여러 색으로 존재한다. 그 예로는 β-카로틴(β-carotene; 당근의 주황색 색소), 라이코펜(lycopene; 토마토의 적색 색소), 푸코잔틴(fucoxanthin; 해조류의 황갈색 또는 갈색 색소), 아스타잔틴(astaxanthin; 3, 3'-dihydroxy-β,β-carotene-4, 4'-dione) 등이 있다. 카로티노이드는 인체내에서 비타민 A의 전구체로서의 역할을 하며, 산화 방지효과와 유해 산소 소거작용, 암세포의 증식 억제작용 및 발암 억제작용이 강하여 순환기 질환, 암 및 성인병 등을 예방하는 효능을 가진 것으로 알려져있다. 최근에는 카로티노이드가 직접적인 자외선에 의한 신체의 면역기능을 향상시켜 자외선 노출로부터 피부의 손상을 줄여주거나 멜라닌 생성을 억제함이 밝혀지면서 유럽이나 미국에서 미용 소재로 각광을 받기 시작했다. 현재 카로티노이드는 건강식품 소재(영양 보충제), 보조 및 치료용 약품 및 약제재 첨가물, 식품 착색제 또는 특수기능성사료 첨가제 등으로 사용되고 있다. 본 연구에서는 호기성, 비운동성, 그람 음성, 오렌지색을 띄는, 간균 형태의 해운대 연안에서 분리.동정되어진 파라코커스 해운댄시스 (Paracoccus haeundaensis)로 부터 분리되어진 카로티노이드 생합성 유전자들을 이용하여 카로티노이드를 대량생산하여 분리·정제 후 각 효소의 특성을 분석하는 연구와 생물공학적 방법을 이용하여 대장균형질전환체와 파라코커스 해운댄시스 돌연변이체를 이용하여 아스타잔틴의 생산을 극대화 시키는 연구 및 카로티노이드를 생합성하는 새로운 균주를 동정하는 것을 목적으로 하였다. 파라코커스 해운댄시스는 아스타잔틴을 생성하는 호기성, 비운동성, 그람 음성, 오렌지색을 띄는, 간균 형태의 해양성 세균이다. 파라코커스 해운댄시스에서 아스타잔틴 생합성에 관여하는 유전자는 6개의 유전자군으로 구성되어 있으며, 이들은 다음과 같다. geranylgeranyl diphosphate synthase (CrtE), phytoene synthase (CrtB), phytoene dehydrogenase (CrtI), lycopene cyclase (CrtY), ß-carotene hydroxylase(CrtZ)와 β-carotene ketolase (CrtW) 이다. 이들 유전자군이 생합성하는 카로티노이드 중 zeaxanthin의 hydroxy group에 glucose를 연결시켜 zeaxathin diglucoside를 생합성하는 효소인 zeaxanthin glucosyltransferase(crtX)를 클로닝 하였다. crtX 유전자의 염기서열은 (Genebank, EU431079) 1248 bp 이며 415 아미노산을 암호화하고 있다. Paracoccus haeundaensis의 CrtX 아미노산과 NCBI에 등록된 다른 종들의 CrtX 아미노산의 상동성 비교 시 Lyngbya sp. PCC 8106의 CrtX 아미노산과 95%로 가장 유사하였다. 또한, 대장균 BL21(DE3) 균주에서 zeaxanthin diglucoside 생합성 하기 위해 zeaxanthin glycosylase 상위 생합성 유전자인 crtZ, crtY, crtI, crtB와 crtE의 5개 유전자를 연결하여 pET-vector를 이용하여 pET-EBIYZ 재조합 DNA 구축하였다. 또한 crtX 유전자와 pST29-vector를 이용하여 pSTCRT_X 재조합 DNA 완성하여 이를 공발현시켜 대장균 내에서 zeaxanthin diglucoside가 생합성 됨을 HPLC을 통하여 확인하였다. 파라코커스 해운댄시스의 카로티노이드 생합성 유전자군의 각 유전자의 효소학적 특성을 분석하기 위하여 발현 벡터인 pET-44a(+) 벡터에 각 유전자를 클로닝하였다. 각 crtW, crtZ, crtY, crtI, crtB, crtE 유전자와 3’ 말단에 6개의 Histidine를 포함하는 플라스미드에서 생산하는 재조합 단백질은 각각 분자량이 27 kDa, 18 kDa, 42 kDa, 55 kDa,33 kDa, 30 kDa 이었다. 각각의 단백질을 affinity chromatography를 이용하여 정제하였으며, HPLC로 분석한 결과 각각의 단백질들은 효소학적 활성을 갖고 있었다. 아스타잔틴의 생산성을 증가시키기 위해서 이소프레노이드 생합성 유전자를 대장균에서 클로닝하여 아스타잔틴 생합성 유전자군과 공발현 시키는 방법과 파라코커스 해운댄시스를 물리적, 화학적 방법을 이용하여 돌연변이체를 유도하여 아스타잔틴 생산량 극대화를 유도하였다. 이를 위해서 대장균으로부터 이소프레노이드 생합성 경로에 관여하는 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase (lytB), farnesyl diphosphate (FPP) synthase (ispA), isopentenyl (IPP) diphossphate isomerase (idi) 유전자들을 클로닝 하였고, 이들 유전자를 (pCR-XL-TOPO-Crt-full)와 같이 대장균에 각각 공발현 시켰다. idi 유전자와 아스타잔틴 생산에 관여하는 아스타잔틴 생합성 유전자군이 함께 형질 전환된 BL21(DE3) Codon Plus 대장균를 배양하였을 때, 건조중량으로 1200 ㎍/g의 아스타잔틴을 생산하였다. 또한, 돌연변이체 유도를 위하여 자외선 조사와 EMS를 처리를 병행하여 파라코커스 해운댄시스의 돌연변이주 (PUE)를 만들었으며, PUE와 파라코커스 해운댄시스 (Wild type)의 아스타잔틴 생산량을 비교하면 각각 건조중량으로 204.84 ㎍/g와 53.57 ㎍/g 이었다. 따라서 본 연구 결과, 아스타잔틴 생합성 유전자 군만 형질전환 시킨 대장균보다 이소프레노이드 생합성 유전자와 아스타잔틴 생합성 유전자군을 공발현 시킨 대장균 형질전환체에서 아스타잔틴의 생산량이 3배 증가하였다. 또한, 파라코커스 해운댄시스와 돌연변이주의 아스타잔틴 생산량 또한 돌연변이주에서 야생균주보다 아스타잔틴을 3배 정도 더 생산함을 확인하였다. 본 연구에 사용된 파라코커스 해운댄시스를이외에도 카로티노이드계 색소군을 생성하는 균주를 찾기 위하여 부산 광안리에서 샘플을 채취하여 호기성, 비운동성, 그람 양성, 핑크-오렌지색을 띄는, 구균형태의 신 해양 세균을 한국의 광안리 연안에서 분리하였다. SJ2^(T)로 명명한 이 균주는 핑코-오렌지색의 색소군을 생성하였다. 성장시 최적온도와 최적 pH는 27℃와 pH 8 이었으며, 이 균주는 0-7% (w/v)의 염농도에서도 성장한다. 파라코커스 속에 속하는 모든 기준균주와 SJ2^(T)의 16S rDNA의 서열분석, 지방산 분석, 생화학 테스트의 결과 새로운 종인 코크리아 광안리엔스 (Kocuria gwangalliensis)로 분류하게 되었다. 이렇게 동정하여 분류한 기준주 (type strain)는 SJ2^(T)(=KCCM 42914 ^(T)=LMG 24672^(T)) 이다. 결론적으로 본 연구는 파라코커스 해운댄시스에서 분리된 카로티노이드 생합성 유전자군을 이용하여 대장균에서 대량발현 시켜 재조합단백질들을 분리·정제하여 효소학적 특성을 연구 하였고, 생물공학적기법을 이용하여 아스타잔틴의 생산량을 극대화 시키는 연구를 위하여 이소프로이드 생합성 유전자와 아스타잔틴 생합성 유전군을 이용하여 대장균에서 공발현하는 방법과 파라코커스 해운댄시스의 돌연변이주를 이용하여 균체에서 아스타잔틴의 생산량을 극대화 시키는 연구를 하였다. 또한, 파라코커스 해운댄시스를 이외에도 색소군을 생합성하는 새로운 균주를 찾기 위해서 광안리 연안에서 샘플을 채집하여 코크리아 광안리엔스 (Kocuria gwangalliensis)로 동정하였다.
Carotenoids are a widely distributed class of structurally and functionally diverse yellow, orange, and red colored natural pigments. These pigments are synthesized in bacteria, algae, fungi, and plants. Carotenoids exhibit diverse biological properties, including strong antioxidative and antitumor ...
Carotenoids are a widely distributed class of structurally and functionally diverse yellow, orange, and red colored natural pigments. These pigments are synthesized in bacteria, algae, fungi, and plants. Carotenoids exhibit diverse biological properties, including strong antioxidative and antitumor activities, and enhancement of immune responses. Carotenoids typically consist of a C40 hydrocarbon backbone often modified by different oxygen-containing functional groups, to yield cyclic or acyclic xanthophylls. Potential and definite functions of carotenoids are provitamin A and antioxidants. Antioxidative properties can be summarized in the abilities of these molecules to act either as photoprotective agents against the harmful effects of light and oxygen or as compounds reactive against chemical species generated within cells and able to induce oxidative damage. In the microbial world, carotenoids are present in both anoxygenic and oxygenic photosynthetic bacteria and algae and in many fungi. However, only a few carotenoids (β-carotene, lycopene, astaxanthin, canthaxanthin, lutein, β-apo-8-carotenal, and β-apo-8-carotenal-ester) can be produced commercially by chemical synthesis, fermentation or isolation from the small number of abundant natural sources. Their demands are rapidly increased but their supplies are not enough. In this study, we have reported the characterization of carotenoid biosynthesis enzymes which purified from overexpressed cells with carotenoid biosynthesis genes and showed the enhanced production of carotenoids. In order to express each gene of the carotenoid biosynthesis genes, composed of seven genes; crtX, crtE, crtB, crtI, crtY, crtZ, and crtW genes, the individual gene was subcloned into the expression vector, pET-44a (+), which allows expression of recombinant protein with C-terminal fusion His-tag. The expression plasmids were individually constructed under the control of T7 promoter, and resulted in as pET-CrtX, pET-CrtE, pET-CrtB, pET-CrtI, pET-CrtY, pET-CrtZ, and pET-CrtW plasmid, respectively. Each plasmid was transformed into E. coli BL21(DE3) strain and the expression of the recombinant protein by the addition of IPTG. The expression and purification of each recombinant protein was analyzed by SDS-PAGE. In order to determine the enzymatic activity of purified proteins, the product of the reaction mixture was incubated with purified enzymes and its substrates, and analyzed the reaction products by HPLC. In order to increase production of astaxanthin, Frist, we have engineered a co-expression system consisted of both the combinational constructs of the carotenoid biosynthesis genes from P. haeundaensis and the isoprenoid biosynthesis genes from E. coli. This metabolically engineered E. coli strain containing both isoprenoid pathway and astaxanthin biosynthesis genes produced 1200 ㎍/g DCW (dry cells weight) of astaxanthin, resulting 3-folds increased production of astaxanthin compared to the E. coli harboring only astaxanthin biosynthesis genes. Secondly, we have used physical and chemical mutagenesis for the enhanced production of astaxanthin on the P. haeundaensis. The isolated mutants exhibited an increase of 3.8 folds in astaxanthin production compared to untreated strain, suitable candidate for the production of astaxanthin on an industrial scale. A new strain of aerobic, non-motile, Gram-positive pink-orange pigmented, and coccoid marine bacterium was isolated from the Gwangalli coast, in Korea. The full-length 16S rRNA gene from strain SJ2T shared the greatest similarity with the sequences of Kocuria carniphila and Kocuria marina. Strain SJ2T exhibited mean levels of DNA-DNA relatedness of 17% and 35%, respectively, to the type strains of K. carniphila and K. marina. Based on these results, strain SJ2T be classified as a new species, Kocuria gwangalliensis. The type strain is SJ2T (=KCCM 42914 T =LMG 24672T).
Carotenoids are a widely distributed class of structurally and functionally diverse yellow, orange, and red colored natural pigments. These pigments are synthesized in bacteria, algae, fungi, and plants. Carotenoids exhibit diverse biological properties, including strong antioxidative and antitumor activities, and enhancement of immune responses. Carotenoids typically consist of a C40 hydrocarbon backbone often modified by different oxygen-containing functional groups, to yield cyclic or acyclic xanthophylls. Potential and definite functions of carotenoids are provitamin A and antioxidants. Antioxidative properties can be summarized in the abilities of these molecules to act either as photoprotective agents against the harmful effects of light and oxygen or as compounds reactive against chemical species generated within cells and able to induce oxidative damage. In the microbial world, carotenoids are present in both anoxygenic and oxygenic photosynthetic bacteria and algae and in many fungi. However, only a few carotenoids (β-carotene, lycopene, astaxanthin, canthaxanthin, lutein, β-apo-8-carotenal, and β-apo-8-carotenal-ester) can be produced commercially by chemical synthesis, fermentation or isolation from the small number of abundant natural sources. Their demands are rapidly increased but their supplies are not enough. In this study, we have reported the characterization of carotenoid biosynthesis enzymes which purified from overexpressed cells with carotenoid biosynthesis genes and showed the enhanced production of carotenoids. In order to express each gene of the carotenoid biosynthesis genes, composed of seven genes; crtX, crtE, crtB, crtI, crtY, crtZ, and crtW genes, the individual gene was subcloned into the expression vector, pET-44a (+), which allows expression of recombinant protein with C-terminal fusion His-tag. The expression plasmids were individually constructed under the control of T7 promoter, and resulted in as pET-CrtX, pET-CrtE, pET-CrtB, pET-CrtI, pET-CrtY, pET-CrtZ, and pET-CrtW plasmid, respectively. Each plasmid was transformed into E. coli BL21(DE3) strain and the expression of the recombinant protein by the addition of IPTG. The expression and purification of each recombinant protein was analyzed by SDS-PAGE. In order to determine the enzymatic activity of purified proteins, the product of the reaction mixture was incubated with purified enzymes and its substrates, and analyzed the reaction products by HPLC. In order to increase production of astaxanthin, Frist, we have engineered a co-expression system consisted of both the combinational constructs of the carotenoid biosynthesis genes from P. haeundaensis and the isoprenoid biosynthesis genes from E. coli. This metabolically engineered E. coli strain containing both isoprenoid pathway and astaxanthin biosynthesis genes produced 1200 ㎍/g DCW (dry cells weight) of astaxanthin, resulting 3-folds increased production of astaxanthin compared to the E. coli harboring only astaxanthin biosynthesis genes. Secondly, we have used physical and chemical mutagenesis for the enhanced production of astaxanthin on the P. haeundaensis. The isolated mutants exhibited an increase of 3.8 folds in astaxanthin production compared to untreated strain, suitable candidate for the production of astaxanthin on an industrial scale. A new strain of aerobic, non-motile, Gram-positive pink-orange pigmented, and coccoid marine bacterium was isolated from the Gwangalli coast, in Korea. The full-length 16S rRNA gene from strain SJ2T shared the greatest similarity with the sequences of Kocuria carniphila and Kocuria marina. Strain SJ2T exhibited mean levels of DNA-DNA relatedness of 17% and 35%, respectively, to the type strains of K. carniphila and K. marina. Based on these results, strain SJ2T be classified as a new species, Kocuria gwangalliensis. The type strain is SJ2T (=KCCM 42914 T =LMG 24672T).
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