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돼지 생식기 호흡기 증후군 바이러스(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)는 전 세계 돼지 산업에 막대한 경제적 손실을 초래하고 있으며, 지속적인 유전적 변이로 인해 질병의 통제, 예방 및 진단에 큰 어려움을 주고 있다. 이 연구에서는 2018년부터 2020년까지 한국에서 발생된 유럽형 (PRRSV-1) 및 북미형 (PRRSV-2) PRRSV의 유전적 특성을 조사하였다. 38개 PRRSV-1 및 47개 PRRSV-2의 open reading ...

돼지 생식기 호흡기 증후군 바이러스(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)는 전 세계 돼지 산업에 막대한 경제적 손실을 초래하고 있으며, 지속적인 유전적 변이로 인해 질병의 통제, 예방 및 진단에 큰 어려움을 주고 있다. 이 연구에서는 2018년부터 2020년까지 한국에서 발생된 유럽형 (PRRSV-1) 및 북미형 (PRRSV-2) PRRSV의 유전적 특성을 조사하였다. 38개 PRRSV-1 및 47개 PRRSV-2의 open reading frame 5 (ORF5) 유전자의 염기서열을 분석한 결과, PRRSV-1의 ORF5는 Lelystad 바이러스와 83.33-93.35%의 상동성을 나타냈으며, PRRSV-2의 ORF5는 VR2332 바이러스와 79.47 -93.33%의 상동성을 나타냈다. 또한, 이 연구를 통하여 lineage 8에 속하는 PRRSV-2 (n=5)가 국내 최초로 확인되었으며, 해당 바이러스들의 염기서열은 생독백신주인 Fostera PRRS MLV와 96.58-99.00%의 상동성을 나타내었다. 아미노산 서열을 추가로 분석한 결과, 이 유전형의 바이러스들은 Fostera PRRS MLV 및 미국의 lineage 8 바이러스들과 유사한 반면, 중국의 HP-PRRSV와는 다른 것으로 확인되었다. 또한 당 단백질 grycoprotein 5 (GP5)의 B 세포 및 T 세포 에피토프는 positive selection pressure 하에서 진화된 것으로 확인되었다. 한국에서 사용하고 있는 상용 키트 2종, 민간병성감정기관의 개발 진단법 1종 및 세계동물보건기구 (OIE)의 추천 진단법으로 총 85개의 다양한 유전형의 PRRSV 검출을 시도한 결과, 한국 분리주를 기반으로 한 국내 진단법들은 높은 검출 민감도를 나타낸 반면, 외국 분리주를 기반으로 한 OIE 진단법은 낮은 민감도를 나타내었다. 이 연구를 통하여 한국 발생 PRRSV-1과 PRRSV-2의 유전적 다양성을 확인하였으며, lineage 8에 속하는 PRRSV-2의 발생을 최초로 확인하였다. 또한, 현재 한국에서 사용하는 분자진단법들은 최근 발생 PRRSV에 대해 높은 민감도를 나타내었지만, PRRSV의 유전적 다양성과 새로운 유전형의 발생을 고려할 때 분자진단법의 효능에 대한 지속적인 평가가 필요할 것으로 생각된다.

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